Protein interaction networks: centrality,modularity, dynamics,and applications

In the post-genomic era, proteomics has achieved significant theoretical and practical advances with the development of high-throughput technologies. Especially the rapid accumulation of protein-protein interactions (PPIs) provides a foundation for constructing protein interaction networks (PINs), which can furnish a new perspective for understanding cellular organizations, processes, and functions at network level. In this paper, we present a comprehensive survey on three main characteristics of PINs: centrality, modularity, and dynamics. 1) Different centrality measures, which are used to calculate the importance of proteins, are summarized based on the structural characteristics of PINs or on the basis of its integrated biological information; 2) Different modularity definitions and various clustering algorithms for predicting protein complexes or identifying functional modules are introduced; 3) The dynamics of proteins, PPIs and sub-networks are discussed, respectively. Finally, the main applications of PINs in the complex diseases are reviewed, and the challenges and future research directions are also discussed.     

顶部定常吸气对高层建筑模型气动力的影响

为减少高层建筑受到的风荷载,提高高层建筑抗风性能,提出一种顶部吸气的主动控制方法。在一高宽比为H/d=5的正方形截面柱体的高层建筑模型上,通过在其顶部前边缘开设狭缝进行吸气来实现流动控制。通过风洞试验研究了顶部吸气对气动力与顶部分离流的影响.利用流动可视化与流场测试结果揭示了顶部狭缝吸气的控制机理.实验对比了不同吸气系数Q(=U/U_∞,U为狭缝吸气速度)对气动力控制效果的影响,并对Q=0,1和3的三种工况下风压分布与顶部剪切流进行了详细对比.研究发现狭缝吸气改变了顶部分离流特性,并对模型所有高度上的气动力均有显著影响.Q=1时控制效果最佳,脉动阻力与脉动升力分别减小17.8%和45.5%.此时顶面分离流被削弱并伴随有再附现象且湍流强度较大,最有利于顶部剪切流与尾流间的动量交换,从而削弱柱体展向涡脱落与脉动气动力.     

对变压器真实油温的智能化监测

本文中作者通过FLUENT温度场解析和变压器实物温升试验,找出了变压器油温最热的真实位置,从而提出智能化监测的解决方案,为真实反映油温升提供可靠的依据.     

熟料烧结过程中氧化铁反应行为的热力学分析

通过对Fe2O3与碳酸钠、氧化钙以及硅酸钙反应的热力学分析,明确Fe2O3在铝土矿炉料烧结过程中的热力学反应规律。热力学计算、分析结果表明:Fe2O3在正常烧结温度范围内能与Na2CO3或CaO发生反应,但更易与CaO反应形成2CaO.Fe2O3或CaO.Fe2O3,Fe2O3和Na2O.Fe2O3能使2CaO.SiO2和3CaO.2SiO2转变为CaO.SiO2,CaO.SiO2进一步与Na2O.Al2O3或Na2O.Fe2O3反应生成不溶的三元化合物而造成烧结法生产氧化铝过程中Na2O和Al2O3的损失。4CaO.Al2O3.Fe2O3不能由铁酸钙和铝酸钠相互反应产生,而可能是CaO、Al2O3和Fe2O3三者直接反应的产物,且在烧结条件下Na2O.Fe2O3可分解4CaO.Al2O3.Fe2O3。     

双端制动器惯性试验台的设计

随着我国汽车工业的迅猛发展,汽车产量不断增多,车速越来越高,对汽车制动性能要求也越来越高。汽车制动器是汽车上的重要设备,其质量的好坏影响着行车的安全。电惯量模拟是近几年兴起的一种比较先进的负载模拟方法,文章就制动器惯性试验台系统结构以及电惯量模拟的方法进行了比较详细的说明。     

高钒高速钢碳化钒形态的数值化分析

针对碳化钒的不同形态,设计出定量分析软件,并利用形状因子K,实现了高钒高速钢不同碳化物形态数值化处理,当K介于0.785～1.000之间碳化钒形态为团球状;K≤0.223,碳化钒呈开花状.高钒高速钢当碳含量达到4.2%时,K为0.86和当量直径D为0.78μm,碳化物呈团球状均匀分布.     

CA6140车床数控改造中机械装置设计技巧

介绍了普通车床数控改造中机械装置的几个独特设计，使得数控车床纵向进给系统结构更简单、性能更可靠、装拆更方便。     

间隔ν-支持向量机及其几何问题

提出总间隔ν=支持向量机(TM-ν-SVM),该算法可取得比ν-SVM更好的理论分类性能.研究表明TM-ν-SVM等价于求解特征空间中的两个压缩凸包的最近点对.讨论压缩凸包的相关性质,并给出对应的几何算法.数值模拟实验表明TM-ν-SVM和对应的几何算法可取得比其它算法更好的性能.     

基于人工免疫的网络安全态势评估模型

本文将人工免疫原理应用到网络安全态势评估的研究中.通过对入侵检测模型中有关自体、非自体、抗原的形式化描述,建立了抗体细胞的演化机制、动态免疫记忆、免疫监视等免疫机制.依据人体免疫系统抗体浓度的变化与病原体入侵强度的对应关系,建立了网络安全态势实时定量计算模型.     

基于范畴论的多TBox整合研究

在语义Web环境下,单一和分散的知识库会引发数据的冗余和不一致性,且严重影响知识库智能化查询,降低知识库中数据的重用性和可操作性.文中提出一种基于范畴论的多TBox整合方法来整合知识库,旨在解决上述者类问题.此方法具有高度抽象性和强大表达能力的范畴论是多知识库整合的理想工具.将TBox作为操作对象,范畴论中"态射"功能可实现TBox的映射,"外推"功能可实现TBox的整合,最后通过实验验证方法的可行性和有效性,实验结果基本符合要求.