基于上下游转录调控的特征数据识别关键microRNA

近年来,基于机器学习的microRNA与复杂疾病之间的关系预测受到广泛关注。然而现存的方法大多是围绕microRNA表达谱,相似性网络,序列特征等角度开发的,忽略了转录调控信息的重要性。基于此提出了一种新的基于microRNA上下游转录调控特征数据的机器学习算法(RPDZ)去预测癌症相关microRNA的重要性。此方法首先通过手动搜索和批量处理高通量数据,计算和整合microRNA上下游的特征数据,然后利用随机森林进行有效的特征提取,最后利用深度神经网络更好地捕捉疾病与microRNA的关系,更好地预测microRNA的重要性得分。使用ROC曲线下方的面积(AUC)、F-measure值和准确度(ACC)作为评估预测性能的指标。通过五折交叉验证的实验表明所提出的算法(ACC:0.8748,AUC:0.93,F-measure:0.8701)相比其他三种对比方法PESM、SVM、GaussianNB可得到更好的分类识别效果。算法不仅可以有效地整合多组学特征数据识别关键的miRNA,还可以为精确和自动化的计算机辅助诊断奠定基础。     

基于上下游转录调控的特征数据识别关键microRNA

近年来,基于机器学习的microRNA与复杂疾病之间的关系预测受到广泛关注。然而现存的方法大多是围绕microRNA表达谱,相似性网络,序列特征等角度开发的,忽略了转录调控信息的重要性。基于此提出了一种新的基于microRNA上下游转录调控特征数据的机器学习算法(RPDZ)去预测癌症相关microRNA的重要性。此方法首先通过手动搜索和批量处理高通量数据,计算和整合microRNA上下游的特征数据,然后利用随机森林进行有效的特征提取,最后利用深度神经网络更好地捕捉疾病与microRNA的关系,更好地预测microRNA的重要性得分。使用ROC曲线下方的面积(AUC)、F-measure值和准确度(ACC)作为评估预测性能的指标。通过五折交叉验证的实验表明所提出的算法(ACC:0.874 8,AUC:0.93,F-measure:0.870 1)相比其他三种对比方法PESM、SVM、GaussianNB可得到更好的分类识别效果。算法不仅可以有效地整合多组学特征数据识别关键的miRNA,还可以为精确和自动化的计算机辅助诊断奠定基础。     

基于空气填充基片集成波导的自温度补偿带通滤波器

提出一种基于空气填充衬底集成波导（Air-Filled Substrate-Integrated Waveguide,AFSIW）,具有良好温度稳定性的窄带带通滤波器。针对不同的谐振腔工作模式,提出两种补偿结构,可以对矩形波导谐振器的TE101和TE301模式进行补偿,并且不会使TE201模式和TE102模式接近滤波器通带,拓宽了阻带范围。设计并制作一个以10 GHz为中心、100 MHz带宽的三极AFSIW带通滤波器。通过实验验证其在10～140℃时,中心频率热稳定性低至1.62 ppm/℃。     

国土空间规划体系中的城市设计管控:上海控规附加图则的新探索

以上海为例,回顾上海控规附加图则管控的演进过程和设计实践。结合新时期新要求分析上海当前控规附加图则管控面临的新挑战。提出新时期上海控规附加图则管控的新探索和具体做法:在城市设计管控体系方面,推动全市城镇建设用地城市设计全覆盖,完善分级分类的差异化管控引导;在附加图则编制要求方面,加强面向实施的弹性适应,形成因需而异的图则编制要求;在附加图则管控方式方面,加强目标传导和弹性控制,构建导控并重、刚弹兼备的管控方式。     

于多源数据空间分析的城市体检方法与更新策略——以北京市海淀街道为例

在城市更新中基于多源数据与空间分析模型有助于精准发现问题并解析其形成的机理,对保证更新措施的有效性和长效性均有重要意义。本研究以北京市海淀街道的城市体检工作为例,以绿色出行、完整社区和健康城市为目标,综合多源大数据与实地调研小数据对慢行交通、社区商业和公共空间三方面的问题进行诊断,并应用空间句法模型对问题背后的路权分配、社区商业需求、居民户外活动的自组织空间规律进行了分析,探索了一种以数据空间分析为基础的城市问题诊断-分析-优化的工作流程。     

木素胺化改性制备重金属吸附剂

以木素为原料,通过胺化改性制备木素基重金属吸附剂,吸附Pb2+。实验中首先将木素用琥珀酸酐进行酸酐改性,然后以对甲苯磺酰氯为催化剂与三乙烯四胺反应,得到胺化改性木素。以琥珀酸酐与木素摩尔比及反应时间为变量优化酸酐改性条件。通过测定羧基含量、红外光谱分析(FT-IR)和吸附性能分析对产物性能进行表征。结果表明,琥珀酸酐与木素摩尔比1.5∶1、反应时间1 h、温度28℃、pH值8.5~9.0时,所得酸酐改性木素中羧基含量最高,达1.98 mmol/g;FT-IR谱图分析显示木素改性成功;胺化改性木素对Pb~(2+)吸附符合拟二阶动力学模型和Freundlich模型,同时随着pH值的升高,产物吸附性能随之提高,p H值5时吸附性能降低,在p H值为5时胺化改性木素对Pb~(2+)的吸附量达到152.95 mg/g。     

氨基酸基防污可注射自融合水凝胶的制备及其在术后防粘连中的应用（英文）

设计和制备具有优异防污能力的可注射防粘连材料对预防手术后组织和器官的粘连具有重要的意义.在此,我们将含有羟基的氨基酸衍生物引入水凝胶的制备中,通过N-丙烯酰丝氨酸(ASer)的自由基聚合制备了一种新型的氢键交联水凝胶(PASer).结果发现一个甲基取代基的存在会对分子间氢键相互作用产生明显的影响:与聚(N-丙烯酰苏氨酸)(PAThr)水凝胶相比,PASer水凝胶具有较低的成胶浓度和增强的力学性能.值得一提的是,亲水性羟基使PASer水凝胶能够有效抵抗蛋白质吸附和细胞粘附.PASer水凝胶具有优异的力学性能、可注射性、自融合性、良好的生物相容性和适宜的体内停留时间,符合临床对术后抗粘连材料的要求.体内研究实验结果表明,PASer水凝胶在建立的小鼠腹壁缺损模型中可以有效预防术后腹膜粘连发生.     

移动定位大数据支持建成环境规划设计的途径和方法

移动定位大数据包括手机信令数 据、移动互联网LBS数据等类型,是表示个 体活动时空特征的轨迹数据。在移动定位 大数据中依据轨迹点的时空特征规律能识 别出个体活动的居住、工作、游憩等特征 点,计算上述活动的空间分布特征,进而获 得居住、工作、游憩等功能之间联系的流向 和流量特征,获得传统数据无法反映的城 市功能空间分布以及城市功能联系的时空 特征。由此,移动定位大数据支持建成环境 规划设计有密度出发和联系出发两种应用途 径。联系出发的途径能支持区域城市关联、 职住空间关系、城市中心体系、设施服务水 平等方向;密度出发的应用途径能支持城 市人口规模、街道活力分析等方向。移动定 位大数据测算居民活动特征还只是一种推 测,在应用方法上要避免“黑箱”方式,对移 动定位大数据测算结果一定要结合传统数 据进行校核,提高可靠性。     

多肽间非共价作用的质谱研究

为了研究多肽间的非共价作用,将多肽按摩尔比1:1混合,待平衡后用电喷雾电离质谱分析多肽间的相互作用.结果表明,其中部分五肽相互作用未形成非共价复合物,也有部分五肽相互作用容易形成非共价复合物,通过改变五肽的氨基酸序列和加长肽链后,用电喷雾电离质谱分析多肽间作用的变化,研究巯基、氢键和疏水作用对多肽非共价作用的影响.五肽...     

钛酸锶钡铁电纳米晶的制备

当晶粒尺寸降到纳米量级时,材料会体现出许多有用性能,因此制备形貌规整,单分散性适于纳米自组装的铁电纳米晶成为研究重点。在总结铁电纳米晶制备与改性方法的基础上,选择了Glycothermal法制备Bax Sr1-x Ti O3纳米晶,并对产物进行测试与表征。