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水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定 总被引:1,自引:0,他引:1
采用EcoR I和Hpa II/Msp I双酶切建立了适合于水稻基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平检测了水稻DNA甲基化修饰位点.以12对MSAP引物进行选择性扩增,共检测到甲基化修饰位点120个,"CCGG/GGCC"位点甲基化修饰比例为20.17%.对部分水稻基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了55条存在甲基化位点变异的DNA序列,通过BLAST比对分析将其联配到水稻基因组序列上.分析表明,这些甲基化修饰位点主要集中于基因启动子区(47%)和第一外显子区(22%),在其侧翼序列中存在类似"CpG island" 典型序列特征的"CpG"二核苷酸成簇富集区.在此基础上,对应用MSAP技术分离水稻基因组DNA甲基化修饰位点的有效性以及水稻基因组序列中"CpG island"类似序列分布特征和生物意义进行了讨论. 相似文献
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在焊缝缺陷的检测问题中,电磁超声技术可以在材料中高效地产生斜入射SV波,有效地检出焊缝的缺陷或不连续性。电磁超声传感器中的永磁体结构影响着超声波的激发效率,决定着回波信号的强弱。根据斜入射SV波EMAT理论,建立传感器的二维有限元模型,对永磁体的结构参数进行模拟分析,利用振动位移振幅作为评判标准,分析不同永磁体参数对传感器激发效率的影响。结果表明:永磁体的高度对位移振幅大小影响作用最强,紧接着是宽度和提离距离,除了高度的增加对位移振幅是正面影响,位移振幅会随着永磁体宽度和提离距离的增加而减小,最后确定了永磁体的最优参数组合。 相似文献
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针对传统交通时段划分方法的局限性,提出了一种混合蛙跳算法(SFLA)与模糊C均值算法(FCM)有机结合的交通时段划分方法SFLA-FCM。SFLA是一种全新的后启发式群体进化算法,具有高效的计算性能和优良的全局搜索能力。SFLA-FCM使用SFLA的优化过程代替FCM的基于梯度下降的迭代过程,有效地避免了FCM对初值敏感及容易陷入局部极小的缺陷。实验结果表明,与单一FCM法相比,SFLA-FCM聚类更准确,效果更佳,对解决城市交通时段的自动划分问题是可行、有效的。 相似文献
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