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为揭示牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)小亚基在烟草(Nicotiana tabacum)中的生理功能,采用电子克隆的方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术,从烟草中克隆到1个牛儿基牛儿基焦磷酸合成酶小亚基基因的cDNA序列,命名为NtGGPPS5(GenBank登陆号:KF316932)。该基因全长1320 bp,编码332个氨基酸,与番茄(Solanum lycopersicum,XP_004246572)及其野生种(Solanum pennellii,ADZ24721)的GGPPS小亚基的氨基酸序列一致性均为92%,具有一个特征性的异戊二烯合成酶保守的天门冬氨酸富集区。进化分析表明,植物GGPPS分为大亚基和小亚基两个分支,而且NtGGPPS5属于小亚基。实时荧光定量PCR试验表明,NtGGPPS5基因在烟草根、茎、叶和芽中均有表达,表达量为芽叶茎根。 相似文献
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转基因作物标记蛋白潜在致敏性的生物信息学预测 总被引：2，自引：0，他引：2
转基因作物表达的标记蛋白带来潜在致敏性顾虑.根据FAO/WHO决策方案,使用SDAP、Farrp和NCBI三大数据库对GUS、NptⅡ和OPH的潜在致敏性进行评估.在线Blast或Fasta发现,OPH、GUS和NptⅡ全序列或连续80 aa的匹配性皆不存在致敏性可能.连续6aa比对中,OPH有2个片段与大豆、小麦和橡胶树的前纤维蛋白或德国蟑螂过敏原相关蛋白存在序列一致;GUS有1个片段与埃及伊蚊唾液腺过敏原存在序列一致;NptⅡ有1个片段与摇蚊血红蛋白过敏原存在序列一致,但匹配的6 aa序列皆未在各蛋白抗原性决定部位,是假阳性结果.初步证明转基因植物表达的GUS、NptⅡ和OPH不具有潜在的致敏性风险. 相似文献