肉制品中致泻大肠埃希菌的分子特征分析

目的 了解国内肉制品中致泻大肠埃希菌（DEC）的流行特征。方法 运用全基因组测序技术对86株DEC进行分子特征分析，明确优势病理类型、序列型和血清型。通过全基因组单核苷酸多态性分析，确定我国肉制品来源DEC菌株之间的系统发育关系。结果 肉制品中致泻大肠埃希菌的病理类型以EAEC为主，86株DEC可分为8种毒力基因型，包括48个ST型（包括6个新ST型）和55个O:H血清型；ST11和CC10为优势序列型和克隆复合体，O157、O15和O6为优势血清群。DEC菌株间表现为高度的遗传异质性，相同病理类型的同源性较低，处在不同的进化分支上。结论 DEC的病理类型与ST型及血清型间未见对应关系，通过对ST型及血清型的监测不能直接对病理类型进行判断，但数量最多的ST型及血清型揭示了DEC的主要危害特征与防控点。可根据全基因组测序结果补充和优化DEC的判定方法，为今后DEC的溯源及流行病学调查提供数据支撑。