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The aqueous solution structure of the cyclic pentapeptide cyclo(-Ser-D-Leu-Asp-Val-Pro-) has been determined by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy, combined with a conformational search and distance-geometry calculations. As many as five conformers in slow exchange were observed, and the rate of interconversion between components was measured from the build-up rates of exchange peaks. NMR data allowed the structures of the two predominant conformers to be determined. The major component (66%) contained a cis-proline as part of a type-VIa2 beta-turn encompassing residues Asp-Val-cis-Pro-Ser. The second component (16%) contained only trans-amide bonds, and a type-VIII beta-turn formed by residues Val-Pro-Ser-D-Leu. These structures are discussed in relation to the (phi, psi), space available to the cyclic pentapeptide, determined by a conformational search, and in relation to previously published cyclic-pentapeptide structures. The molecule exhibits activity in a scintillation-proximity assay for the inhibition of the interaction between the integrin very-late antigen-4 (VLA-4; alpha 4 beta 1) and vascular-cell-adhesion molecule-1 (VCAM-1). The structure/activity relationship of the LDV sequence is discussed and related to the recently published X-ray structure of VCAM-1. The relevance of the work to the design of anti-inflammatory drugs is discussed.  相似文献   
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Earlier studies have established that mutant strains of Azotobacter vinelandii that do not synthesize ferredoxin I (AvFdI) overexpress another protein designated Protein X (Morgan, T. V., Lundell, P. J., and Burgess, B. K. (1988) J. Biol. Chem. 263, 1370-1375). This protein has now been purified using two-dimensional gel electrophoresis as an assay. The purified protein is a monomer with M(r) approximately 29,000 which degrades slowly to a specific M(r) approximately 22,000 form when stored in solution. The native protein is bright yellow and contains noncovalently attached FAD that is reduced by either dithionite or NADPH without formation of a stable semiquinone. Titration with NADP+/NADPH gives an E0' value of approximately -327 mV versus SHE. Because this E0' is so close to that of the NADP+/NADPH couple it is not clear if Protein X is an NADPH oxidase or an NADP+ reductase in vivo. Comparison of the NH2-terminal sequence and other properties of Protein X with those of other proteins, suggests that it is likely to be related to the Escherichia coli ferredoxin NADP+ reductase (the fpr gene product), and affinity chromatography shows that Protein X binds specifically to AvFdI.  相似文献   
85.
86.
87.
Neben der Gestaltung technischer Systeme zur Unterstützung des Wissensmanagements ist die Ausgestaltung organisatorischer Ma?nahmen gleichbedeutend wichtig.  相似文献   
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90.
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