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Computational biology research is now faced with the burgeoning number of genome data. The rigorous postprocessing of this data requires an increased role for high-performance computing (HPC). Because the development of HPC applications for computational biology problems is much more complex than the corresponding sequential applications, existing traditional programming techniques have demonstrated their inadequacy. Many high level programming techniques, such as skeleton and pattern-based programming, have therefore been designed to provide users new ways to get HPC applications without much effort. However, most of them remain absent from the mainstream practice for computational biology. In this paper, we present a new parallel pattern-based system prototype for computational biology. The underlying programming techniques are based on generic programming, a programming technique suited for the generic representation of abstract concepts. This allows the system to be built in a generic way at application level and, thus, provides good extensibility and flexibility. We show how this system can be used to develop HPC applications for popular computational biology algorithms and lead to significant runtime savings on distributed memory architectures. 相似文献
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本文介绍用激光实时全息术测量岩石的泊松比μ,用散斑照相放大术测量岩石的杨氏模量E,进而由弹性理论中的关系式G=E/(2(1+μ))算出岩石的切变模量G。由此可以获得所测岩石的弹性参数。 相似文献
997.
998.
刘丁慧 《电信工程技术与标准化》2002,(5):52-54
对城市轨道交通通信系统的传输网络需求进行了分析,对各种传输制式进行了比较,提出了城市轨道交通通信系统传输网络的最佳解决方案。 相似文献
999.
1000.