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随着高通量测序成本的不断降低,基于DNA测序技术的肿瘤基因组研究已经成为揭示肿瘤分子机制的主流方法,并在临床诊断和治疗中逐渐得到应用。肿瘤体细胞单核苷酸突变变异 (single nucleotide variant, SNV) 作为最简单的一种基因变异类型,其检测会受到家系多态性、肿瘤异质性、测序和分析误差等多个因素的影响,从而导致一些假阳性的结果。目前,已有一些基于肿瘤基因组测序数据的体细胞 SNV 检测软件,如 Varscan2,Mutect2,Strelka,SomaticSniper 等。本文选取四种典型的检测方法,对每种方法的检测原理进行研究,并使用 ICGC-TCGA 提供的全基因组数据,对上述四种变异检测软件进行测试。参照每种方法的分析流程,获得每种方法识别的候选变异位点集,并与真实的变异位点集合进行比较,分析每种算法的优缺点,从而为研究人员使用这些方法提供指导。 相似文献
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建立了对核电站中含高浓度磷酸盐水样中常见痕量阴离子(氟离子、氮离子、甲酸根、乙酸根、硫酸根)梯度淋洗的分析方法. 相似文献
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基于状态空间模型,综合生态环境、旅游资源和社会经济3个子系统对生态旅游的影响效果,以"一带一路"上的普洱"茶马古道"为例,构建了分层次的遗产廊道生态旅游系统承载力评价模型。针对不同文化遗产类型,采用GIS技术将各影响因子空间化,最后综合得到生态旅游承载力空间分异结果。研究结果表明:普洱市生态旅游承载力较低,仅有14.1%的区域具备强承载力,其余区域为较强承载、中等承载、较弱承载和弱承载等其他等级。研究可为"一带一路"等类似线性文化遗产旅游可持续发展的战略制定奠定理论和方法基础。 相似文献
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基于北京市通州区某深基坑工程,依据降水开挖及支护方案,使用midas GTS NX软件建模研究了在土钉墙–桩锚联合支护下,不同锚杆条件对富水砂层深基坑开挖变形特征的影响,并基于实际施工方案进行支护结构优化。结果表明,桩锚支护中预应力锚杆能够有效加固深层土体,约束其水平位移,显著改善基坑稳定性,相较于无锚杆情况,坡顶和桩顶的水平位移最大值分别减少了60.9%和75.4%;桩锚支护情况下,桩身侧移随桩直径的增大先减小后增大,存在最优桩直径范围,且该范围受到锚杆预应力大小的影响。 相似文献
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淮北市自来水供应是抽取地下水分片区进行的。为保持管网内合适的压力,通常是通过开停供往该片区的机泵来实现的。这种方式经常导致水压大幅波动,爆管现象时有发生,造成能源和水资源浪费。频繁开停机泵还增加了机泵运行故障,减少机泵正常寿命,因此维修费用大大增加。形成了供水成本居高不下的局面。 相似文献
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介绍变频调速技术在分片区供水中的应用.通过变频凋速技术理论分析,得出变频调速技术的应用可行性和优越性,利用变频凋速技术实现片区恒压供水,取得了良好的社会效益和经济效益. 相似文献