CUDA下受体评分网格生成并行算法

针对分子对接中生成评分网格需要花费很多的计算时间这一问题, 提出了一种基于统一计算设备架构（CUDA）的评分网格生成并行算法。该算法把传统计算方法中三维计算空间中的一维通过在图形处理单元（GPU）上进行并行处理, 使得总生成时间得到了降低, 提高了评分网格的生成效率。实验结果表明, 借助于GPU的浮点计算能力, 提出的并行算法对比传统的计算方法可以显著缩短评分网格的生成时间, 为评分网格的生成提供一种新的方式。     

随机走步软聚类识别蛋白质网交叠功能模块

认定蛋白质交互网中的功能模块对于理解细胞的组织结构,处理过程及其功能都是至关重要的。由于一个蛋白质可能具有多重功能因此蛋白质功能模块可能会相互交叠。然而,目前已有的一些识别功能模块的软聚类算法有如下两个缺陷：一是一些算法需要阈值来截断聚类;二是有些算法需要预设聚类数目。为了克服这两个缺陷,提出了随机走步软聚类识别算法来认定蛋白质交互网中的交叠功能模块。实验结果表明该算法在无需任何参数的情况下能发现一些重要的交叠功能模块。     

超滤膜-活性炭联用工艺处理长江原水中试研究

不投加任何药剂的长江原水,通过粗格栅过滤后,直接采用超滤(UF)和颗粒活性炭(GAC)联用工艺进行处理。试验中水温、过滤周期、原水水质等对UF运行均有影响。其中温度的影响最大,UF-GAC联用工艺适合处理水温较高的夏秋季长江原水,而在水温较低的冬季要保证设备稳定运行较困难。长周期比短周期过滤更容易造成不可逆膜污染类物质的积累,水的浊度对膜污染也有影响但表现为可恢复膜阻。UF出水相对稳定并对浊度、铁、锰等指标去除率达99%,氨氮等指标满足出水要求,但对CODMn、UV254等去除效果较差,有时会略高于饮用水出水标准,而经GAC吸附后可满足国家饮用水卫生标准(GB 5749-2006)的要求。UF-GAC联用工艺可在短时间内采用,当活性炭吸附饱和后,便会失去对有机物的去除作用,一旦GAC过滤后出水水质恶化,颗粒活性炭需要更换或再生。     

降低快开式法兰结构应力峰值的讨论

快开式法兰是一种采用牙齿咬合的紧固结构,适用于需要经常开启的压力容器,已在浸漆罐、蒸压釜等一类压力容器中使用。有限元计算表明,这类结构,在法兰与容器端盖连接处有较大的应力峰值,其值远高于其基本应力(薄膜应力)值,使结构在这一区域较为薄弱。设计时,设法减小这种应力峰值至关重要。为达此目的,往往采用增大法兰尺寸的办法,但是,这样一来,使法兰过刚,不仅耗费钢材,增加结构重量,而且还可能造成应力峰     

一类矩阵逆特征值问题的线性规划解法

本文提出用线性规划法求解某些逆特征值问题,并给出几个数字例题。     

半固态流变压铸铝合金三角臂开发与应用研究

以底盘关键受力结构件“三角臂”为研究对象,采用铝合金半固态流变压铸成形工艺替代传统钢板焊接工艺实现轻量化,铝合金三角臂本体的静载强度、模态分析及耐久仿真分析均满足性能要求,且静载强度、刚度均显著优于原钢制三角臂。结合高固相半固态流变压铸工艺特点,通过拓扑优化实现了产品半固态“层流充型”的过程控制。金相分析结果显示,半固态α-Al呈近球状且分布均匀,Si颗粒变质正常;经X射线、荧光探伤检测发现,关键受力位置无气孔、缩孔、缩松缺陷,致密度高。开发出的半固态流变压铸铝合金三角臂质量为2.41 kg,相对原钢制三角臂本体减重39.9%,并通过台架性能试验和整车搭载验证。     

基于Kriging代理模型的多点加点序列优化方法

基于Kriging 代理模型提出了一种同时考虑预测响应值及其不确定性的多点加点准则,并基于该准则发展了一套序列近似优化方法。多点加点准则基于初始样本信息和所预测的对象函数特征增加新样本集,以在寻优迭代过程中自适应地提高代理模型的精度。该文方法依据多点加点准则在一次迭代中增加多个空间无关的新样本点,适用于多机同时计算或并行计算,从而提高计算效率。以两个经典的数学函数为例,将该优化方法与期望提高准则方法进行了比较,结果表明该文提出的优化方法能够有效地提高最优解的全局性。将方法用于一盒式注塑件的成型工艺优化设计,优化结果也表明了该方法的有效性。     

一种SaaS模式下的服务社区模型及其在全国科技信息服务网中的应用

如何从服务的提供、运营和使用等多个维度有效组织和管理服务是软件即服务(SaaS)模式下面临的一个重要挑战.以支持服务发现为主要目标的传统服务管理方法难以适应SaaS模式下服务的动态有界、关联演化和可控可测等特征及满足服务全生命周期管控的需求.该文结合全国科技信息服务网实际应用,探索了一种支持科技信息资源整合共享与综合利用的"双向"SaaS模式,并提出一种适于该模式下服务管理的服务社区模型.服务社区模型支持服务元建模和业务规范及服务管控策略自主定义,可以使能面向特定业务领域的有界化和有序化服务管理.文中还针对服务管理边界的演化需求讨论了该模型下的服务社区派生机制.最后,以全国科技信息服务网中的科技信息服务运营管理为具体案例,展示并讨论了服务社区模型的使用方法、应用效果和适用范围.     

计算机辅助药物分子对接并行演化设计

对分子对接理论作了简单介绍,建立了一个基于柔性配体分子与刚性受体分子对接的数学规划模型,将分子对接中的构象优化搜索转化为求解约束极小化问题的过程,并采用带有空间收缩的多种群并行遗传算法进行求解．在分布式存储的并行机曙光3000上模拟计算表明,该设计具有很高的并行加速比,在保证分子对接的准确性和有效性的前提下,大大提高了分子构象搜索的速度．     

基于演化设计的遗传算法在分子对接中的应用

将自然界的物种动态模型引入到遗传算法当中,反映出物种的真实进化状态,开发了基于演化设计的遗传算法。算法采用自适应策略克服了确定交叉和变异概率值的问题,利用小种群策略和最优保留策略保证了种群的多样性,改善了算法的寻优能力,进而提高了计算效率。运用该遗传算法求解分子对接优化模型,给出基于演化设计的分子对接程序。对接实例表明,算法能有效应用于分子对接问题中。