Metagenomics: Facts and Artifacts,and Computational Challenges

Metagenomics is the study of microbial communities sampled directly from their natural environment, without prior culturing. By enabling an analysis of populations including many (so-far) unculturable and often unknown microbes, metagenomics is revolutionizing the field of microbiology, and has excited researchers in many disciplines that could benefit from the study of environmental microbes, including those in ecology, environmental sciences, and biomedicine. Specific computational and statistical tools h...     

估算水电工程对生态系统生产力影响的一种方法

初级生产力是描述生态系统功能和稳定性的重要参数之一,但目前尚无定量估算水电工程占地对评价区生态系统初级生产力影响的适用方法。提出多个群落组成的生态系统加权平均净初级生产力的概念,用于定量估算水电站等各类工程占地对评价区生态系统净初级生产力的影响,并以川西某在建大型水电站的永久占地数据为例子,对方法的应用作了说明。该方法同时适用于评价水电或其他工程占地引起陆生和水生生态系统净初级生产力的变化。     

投放方式对聚氨酯内微生物及其净化效能影响

为探讨聚氨酯在生物接触氧化池内不同投放方式对污水净化效能的影响,通过3种投放方式(完全悬浮、完全下沉、一半悬浮一半下沉)的比较,分析不同投放方式导致的微生物群落结构差异与系统净化效果之间的关系.结果表明:聚氨酯在生物接触氧化池内一半悬浮一半下沉状态下的净化效果最佳,COD及NH4+-N的去除率可达90%和94%;在此状态下载体附着的微生物数量最多、多样性最高、活性最强、功能结构最合理.聚氨酯在生物接触氧化池内的投放状态直接影响着生物接触氧化池的净化效果,一半悬浮一半下沉是更有效的投放方式.     

生活污水污泥驯化过程中细菌多样性及演替规律

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析了实验室生活污水处理系统(Anoxic/Oxic工艺)好氧池内细菌多样性及演替规律,推究污泥中优势细菌与水质变化之间的关系.提取不同驯化时期污泥的细菌总DNA,以细菌的通用引物PCR扩增16S rRNA基因V3区,DGGE分析扩增产物,并对优势细菌的DNA片段进行回收、序列分析;构建驯化稳定后污泥的16SrDNA克隆文库.结果表明:系统内细菌群落结构随污泥驯化过程的进行发生了明显的演替变化,克隆文库的序列分析表明污泥中细菌种群具有丰富的多样性,主要包括Proteobacteria类群,Bacteroidetes类群,Firmicutes类群,Zoogloea sp.,Pseudomonas sp.,Rhodobacter sp.,Planctomyces sp.,Clostridium sp.等.DGGE优势条带的测序结果结合水质处理效果分析表明:Proteobacteria类群,Pedobacter sp.,Sphingobacterium sp.对CODcr的去除起到了关键的作用.     

浅谈从生态园林到生态城市

建设生态园林、生态城市首先要转变观念,要加强边缘科学研究,城与乡要拆墙,实现一体化;要把园林建设看作投资自然资本,为地球增加绿色,改善生存环境。     

基于神经网络和数据融合的红树林群落分类研究

及时准确地掌握红树林群落现状信息可为保护和修复红树林生态系统提供重要的决策依据。对红树林群落进行遥感分类在实际应用中具有较大的意义。但红树林各群落间的光谱差异很微弱,有必要采用多源遥感数据融合的方法来提高分类的精度。本文以珠海淇澳岛红树林区为例,使用SAR图像与TM图像,探讨了监督分类、非监督分类以及神经网络分类3种分类方法和IHS融合、小波融合以及主成分融合3种融合方法对红树林群落进行分类的效果。结果表明,对SAR与TM主成分融合图像应用神经网络分类方法能够取得最好的分类效果。     

我校申报的科技部重大基础研究前期研究专项项目获得资助

近日，从国家科技部传来喜讯，我校特聘教授龚一鸣与胡斌教授申报的2005年度《重大基础研究前期研究专项》项目“陆相生物遗迹群落的组成、结构与遗迹模式研究”经严格的初筛、函审、专家会审和答辩，获准立项，资助经费40万元，我校是今年省内唯一获得此类项目资助的高校．     

江西省鄱阳县典型湖泊浮游植物群落结构变化及分析

为研究典型湖泊浮游植物群落结构及其与环境因子的关系,选取江西省鄱阳县自然湖泊道汊湖、城市景观湖东湖、养殖湖上土湖为研究对象,于2018-2021年每年的春季(5月)、秋季(10月)进行采样。样品分析共鉴定出浮游植物8门73种,浮游植物优势门类均为绿藻门和硅藻门,其次为蓝藻门。道汊湖的主要优势种有色球藻、微囊藻、平裂藻、鱼腥藻、长孢藻;东湖的主要优势种有衣藻、十字藻、盘星藻、色球藻、微囊藻、长孢藻;上土湖的主要优势种有微囊藻、平裂藻、鱼腥藻、长孢藻。研究期间,三个湖泊浮游植物群落结构在不同年份不同季节有显著差异,其变化主要是浮游植物优势种属间再分配。影响道汊湖浮游植物群落结构变化的主要环境因子是温度(WT)、透明度(SD)、溶解氧(DO)、高锰酸盐指数(COD_Mn);影响东湖浮游植物群落结构变化的主要环境因子是SD、TN、TP、COD_Mn;影响上土湖浮游植物群落结构变化的主要环境因子是WT、SD、光照强度、DO、叶绿素a(Chla)。     

油藏微生物群落结构的分子分析

利用PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术考察本源微生物驱油前后,即营养剂注入前后微生物群落结构的变化.实验室模拟地层培养结果表明,在以N-1(主要成分为淀粉纤维素)为唯一营养剂、培养温度为48℃时,在有氧或厌氧务件下,24 h后原始水样中对驱油有利的本源茵便可以被激活,并随着培养时间的延长最终达到稳定.主要激活的对驱油有利的3种菌株为假单胞菌(Pseudomonas sp.)、梭状芽孢杆菌(Clostridium sp.)和烃类降解菌(Hydro-carbon seep bacterium).经分析,原始底层注入水中虽然含有对驱油不利的脱硫肠状菌属(Desul fotomaftculum salinum),但是在经N-1激活后的水样中均未发现该菌的存在,证明N-1不会激活原始水样中的脱硫肠状菌属.为营养体系的筛选、注入方案的优化设计和驱油效果评价提供了理论支撑.     

基于自生植物群落的景观设计途径研究 ——CSR理论介入城市自生地被植物群落 改良设计的探索

作为生态服务功能得到广泛认同的植被资源,城市自 生地被植物群落在绿地建设过程中存在难以利用的问题,需要通 过风景园林设计手法赋予其符合生态秩序的结构与美学特征,才 能实现其实践运用价值。面对群落组成复杂、植株难以筛选、缺 乏稳定性与美学特征等问题,基于以场地自生地被植物群落为基 础进行人工改良设计的思路,提出依托CSR理论对自生群落的 物种组成、垂直结构、景观特质进行调控,并采取低干扰方式进 行建植与维护的设计、管理途径,通过人工干预的方式促进群落 的竞争筛选与演替过程,最终形成相对稳定的低维护地被群落景 观。研究开展了初步实验,改良设计的实验群落经过3年的生长 与演替,物种组成从R型植物优势转向为更加稳定的C型植物为 优势,群落植株密度与覆盖度显著提升,形成了包含主景观层、 底部空间保护层、点缀性景观层的垂直结构,在不同阶段呈现出 了各具特征的植物景观。实验结果验证了自生地被植物群落人工 改良设计途径的可行性,为基于城市自生地被植物群落的植物景 观生态设计实践提供了参考。