尾静脉注射方法考察Stearic-PEI/SPIO 纳米基因载体的基因转染性能及磁共振可视化效果研究

实验应用硬脂酸-聚乙烯亚胺包裹超顺磁氧化铁(Superparamagnetic Iron Oxide,SPIO)装载目的基因构建可视化 纳米复合物,进行 BABL/c 雌性小鼠体内磁共振成像实验、组织学检测,探讨其是否能够有效地介导体内基因表达以及 产生磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)效果。MRI 实验结果显示,对小鼠尾静脉注射复合物 0.5 小时后进 行磁共振扫描,与注射生理盐水的对照组相比实验组 T2 加权信号明显降低,信号强度仅为对照组的 35%;48 小时后, 实验组 T2 加权信号强度略有回升,但与对照组信号强度相比仍存在显著差异。组织学结果显示可视化基因纳米复合物 能够穿过血管内皮细胞进入肝脏组织,并释放 DNA 在细胞内成功表达,但基因表达效果较差。综合 MRI 成像及组织检 查实验结果可知,该纳米颗粒具有优良的 MRI 成像性能,但通过尾静脉注射方法基因转染效率较低。     

基于邻域粗糙集的加权KNN肿瘤基因表达谱分类算法

肿瘤亚型的准确判别对肿瘤的治疗具有重要意义,对肿瘤的不同亚型进行准确判别是当前生物信息学研究的重要课题．本文首先利用Relief算法排序基因并选出初始的肿瘤信息基因子集,然后利用向基于邻域粗糙集模型的向前属性约减算法FARNeM来计算加权基因集合,最后用加权KNN算法对肿瘤对这些数据进行分析,从而发现有差异的基因表达。实验结果表明了上述方法的可行性和有效性。     

在癌症分类中基于分层抽样的神经网络集成算法

在基因表达谱数据的分析中,针对有效合理地选择特征基因集的问题,本文将分层抽样技术引入特征基因选择,提高特征基因集的分类能力。以神经网络作为分量分类器,神经网络集成进行分类预测。并在结肠癌数据集上进行实验,实验结果表明该方法能有效地降低特征基因集选择的复杂性,提高对于未知样本的分类预测效果。     

聚类分析中类数估计方法的实验比较

在基因表达数据的探索性聚类分析中,聚类个数的确定是决定聚类质量的关键因素。许多聚类有效性评价指标和方法可用于PAM聚类算法。该文讨论适合于PAM算法的7种常用评价指标和方法,采用4种不同聚类结构特征的基因表达数据对它们的性能进行实验比较。结果表明,系统演化方法和稳定性方法估计聚类个数的性能最好,正确率分别为100%与90%。     

用GEP实现传感器网络多源时域数据融合

本文提出了一种基于基因表达式编程GEP的多源时域数据融合模型GEP-MSDA,该模型可以在无任何先验知识的情况下自动对多源数据进行融合。实验表明,基于GEP的融合模型较传统方法能滤除更多的冗余数据,有效节省通信开销,并保持较高的精度。     

基于改进Multi-Agent系统的基因表达数据的分析与研究

通过介绍改进的多代理系统在分析基因表达数据中的应用,揭示了运用普通分类器找出有效的分类基因,而且这些普通分类器在研究基因表达数据库时可被代理使用.这样就可得到一个具有大量基因特征的小子集,并且用它可以帮助辨认病人的临床状况和特征.实验表明代理通过改进和相互协作可改进其性能,并通过两个著名的基因表达问题来展示项目的研究成果,而且使得量度的准确性在维数增加时变得不很敏感.     

基于基因库的新型检测器生成方法

提出一种新的检测器生成方法。由于非我样本中存在着关于非我空间的信息,提出通过统计非我样本中各属性的分布情况来构建基因库,并应用基因库来生成检测器的方法来检测入侵。应用KDDCup1999数据集,通过实验证明该方法能够生成检测率更高的检测器集。     

基于改进的基因表达式编程算法在作业车间调度问题中的应用

文章提出一种新颖的方法一改进的基因表达式编程算法来求解作业车间调度问题。作业车间调度问题是许多实际生产调度问题的简化模型,基因表达式编程算法结合了遗传算法和遗传编程的优点,具有更强的解决问题能力,对基因表达式编程算法进行改进使其在作业车间调度问题的应用上更加有效;最后应用一个实例来验证提出方法的有效性。     

基于支持向量机的特征提取方法研究

基因表达数据的一个重要应用是给组织样本进行分类。在基因表达数据中,基因的数量相对于数据样本的个数通常比较多;也就是说,可以得到变量数（基因数）远远大于样本数的数据矩阵。过高的维数（变量或基因数）将给分类问题带来极大的挑战。本文提出结合一种新的特征提取方法——非相关线性判别式分析方法（ULDA）和支持向量机（SVM）分类算法,对结肠癌组织样本进行分类识别。并同其它方法作了比较研究,结果表明了该方法的可行性和有效性。     

脱水过程中无核白葡萄转录组测序及膜脂降解代谢中关键基因的筛选

该研究以吐鲁番地区无核白葡萄为试验材料,在25 ℃常温和30 ℃热风干燥后,取失水25%、50%时褐变和未褐变的样品。利用转录组测序技术筛选出膜脂降解代谢相关的关键基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其进行验证,研究结果显示,转录组测序共获得了11.63亿的clean data,当无核白失水50%时未褐变与褐变的相比,在快速脱水组筛选出718个差异表达基因,慢速脱水组2 259个。将上述基因进行GO功能富集和KEGG富集分析后,筛选出43个膜脂代谢相关的差异基因,归类于5种代谢途径。从已获得的差异基因中最终筛选出乙醛脱氢酶7B4（Aldehyde Dehydrogenase7B4,ALDH7B4）、双半乳糖甘油二酯合成酶1（Digalactose Diglycerol Synthetase1,DGD1）、脂氧合酶（Lipoxygenase,LOX）、磷脂磷酸水解酶2（Lipid Phosphate Phosphatase2,LPP2）、二酰基甘油激酶5（Diacylglycerol Kinase5,DGK5）、非特异性磷脂酶C4（Non-specific Phospholipase C4,NPC4）、磷脂酶Dα1（Phospholipase Dα1,PLDα1）7个膜脂代谢相关的关键基因,经qRT-PCR验证,基因表达趋势与转录组测序结果基本一致。结果表明,膜脂降解代谢相关基因表达量变化对无核白脱水褐变有一定影响。