使用GPU加速BLAST算法初探

应用GPU通用高性能编程技术实现了一种加速BLAST算法的新方法。BLAST是目前最常用的用于生物序列查询比对的算法和软件包,其处理速度受到串行化执行和磁盘I/O等因素的影响。本文通过实验分析了BLAST软件包中的典型程序BLASTN的运行热点,并选定关键热点模块,应用CUDA编程技术对其进行并行化改造。对比实验结果表明,对于平均序列长度较大的序列库,应用GPGPU并行化可明显缩短该模块的运行时间,获得超过35倍的加速比。这说明,我们可以利用GPGPU对BLAST进行并行化加速,以满足高性能生物序列查询的需求。     

互联网安全你该信任谁

最近连续发生的两件事情使我感触很深,一件事是瑞星官方的网站服务器被恶意挂马,导致很多瑞星的用户中招;另一件事则是通过谷歌搜索“申银万国”时,排在第1条的查询结果被重点铺上了淡黄色的底纹,异常醒目,但投资者们一定想不到,顺着这个链接点击进入的并不是申银万国的“大门”,而是假网站的陷阱。     

非确定性数据查询

数据库技术中尽管有完整性约束技术用来维护数据的确定性,但有些情况可能不满足完整性约束。本文提出了非确定性数据的确定性查询概念,给出的查询重写方法能有效地进行数据库SQL查询语句,它可以违反一系列的约束条件,重写查询去查找相应的与约束一致的数据。     

ASP．NET2．0中综合查询的实现

在一个网站应用系统里,系统管理员拥有管理用户的权限。在本文中,我们讨论了在基于VisualC#2005中的ASP．NET环境中,如何让管理员有查询用户的信息权限。     

基于完全加权关联规则挖掘和查询扩展的信息检索

将完全加权关联规则挖掘技术应用于信息检索,提出一种基于完全加权关联规则挖掘和查询扩展的信息检索模型,重点阐述模型的设计思想及其算法和实现的关键技术.实验结果表明,该模型有效,能提高信息检索性能,有很高的实际应用价值和推广前景.     

一种改进的XML查询重写算法研究

查询重写是数据集成的一个关键问题,它是将用户的查询请求自动重写为直接面向数据源的查询请求。最近Michigan大学和IBM的AImaden研究中心提出了一种新的基于约束的XML查询重写算法,但是该算法没有考虑复杂模式匹配重写问题,使得该算法应用受到限制。在原来的算法重写思想基础上,提出了一种改进的XML查询重写算法,扩大原算法的应用范围,并分析了改进算法的正确性和时间复杂度。     

大型Web2．0网站架构纵横谈（三）——主动配置型缓存架构

上篇对缓存配置探讨了概要的设计,可能说得有点模糊了。有几个朋友发了几个问题探讨了下。和常见的缓存策略不同,我们的缓存策略将重点放在更新策略而不是只读策略上。只读缓存以及共性缓存策略性质实现的难度并不大,我们要解决的是非共性缓存、并发更新     

聊天记录我做主

网上聊天需要查询聊天记录中的信息。聊天的地方不同,记录会存在不同的电脑中,如何把零碎的聊天记录整合起来,形成—份完整记录,并且随时更新记录呢？其实聊天记录可以自己做主。     

基于Struts框架构建收费查询系统

本文研究分析了如何在收费查询系统中应用Struts框架,提高了代码的重用性和软件开发的效率,实现了学院相关部门对收费信息的动态科学管理。     

域名查询系统

为检索网络域名,方便网络用户为自己的网站命名,本文利用ASP．NET结合XML-HTTP组件实现了网络域名的查询,分析了域名查询的原理,介绍了XMLHTTP组件的编程方法,并给出了详细的代码实现。