Association between Aspergillus flavus Colonization and Aflatoxins Production in Immature Grains of Maize Genotypes

Aspergillus flavus maize colonization leads to crop contamination by toxic secondary metabolites and carcinogens called aflatoxins （AF）; it has negative effects in public health and has caused economic losses in agricultural activities. Eleven genotypes of immature maize grain frequently used in Mexico were inoculated in vitro with two indigenous toxigenic strains ofA. flavus. The size of inoculum, temperature, humidity and presence of other phytopathogens were assessed. Genotypes Popcorn, C-526, Garst 8366, As910 and 30G40 showed resistance to rating of fungal colonization （FC） and AF accumulation, while 3002W, 30R39, Creole, C-922, HV313 and P3028W genotypes were less resistant. AFB~ had the highest concentrations （26.1 mg/kg ± 14.7 mg/kg）, while AFB2, AFG1 and AFG2 showed only residual concentrations 1.6, 2.0 and 4.0 ~tg/kg, respectively. Concerning FC and AF, there were significant differences （P 〈 0.01） between strains and genotype. Both strains showed significant association （P 〈 0.01） between FC and the concentrations of AFB1 and AFB2 （R2： 99.5% and 93.2%; 87.2% and 73.2%, respectively）. Results suggest that the level of resistance to fungus infection and AF accumulation is related to maize genotype. It emphasizes the relevance of developing A. flavus resistant maize genotypes as an alternative to control contamination in foodstuff intended for human and animal consumption.     

不同小麦品种籽粒中LOX活性及基因型和环境互作分析

选用了安徽省淮南片小麦区试5个生态点的10个小麦品种(系)为试验材料,测定其全麦粉脂肪氧化酶(LOX)活性。研究了基因型、环境及基因型×环境互作对小麦LOX活性的影响。结果表明,全麦粉LOX活性的变幅为4.27~8.94 nkat.g-1,平均值为6.61 nkat.g-1,LOX活性的基因型和环境差异均达到极显著,基因型效应大于环境及基因型与环境互作效应。同时,选用皖麦48等10个小麦品种(系)为试材,测定其LOX活性等9个品质性状,分析了小麦籽粒LOX活性与若干品质性状的关系。结果表明,全麦粉LOX活性与小麦粉LOX活性呈极显著正相关,与水溶性戊聚糖含量呈显著正相关,小麦粉LOX活性与水溶性戊聚糖含量和总戊聚糖含量呈显著正相关。讨论了脂肪氧化酶在小麦品质改良中的利用等问题。     

烟草钾素营养研究进展

从植烟土壤对外源钾素的固定、矿物钾对植物的贡献、植物活化矿物钾的机理以及植物吸钾基因型差异机理四个方面综述了近期钾营养研究的成果。并讨论了烟草钾素营养研究的新内容。     

菲律宾蛤仔生长性状基因型与环境互作研究

为研究菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum基因型和环境的相作效应,采用双列杂交方法构建了AA、AB、BB、BA 4个基因型家系遗传材料,分别在不同温度、盐度和养殖环境条件下养殖30~45 d,以壳长生长为指标分析基因型与环境互作遗传效应。结果表明:基因型与温度互作遗传效应中,温度对基因型存在显著影响(P<0.05),在20、24、28℃水温下,壳长生长由大到小分别为BB>BA>AB>AA,BA>AB>AA>BB,AA>BA>AB>BB,但温度与基因型互作效应不显著(P>0.05);基因型与盐度互作遗传效应中,盐度对基因型存在显著影响(P<0.05),在20、25、30盐度下,AA家系生长均显著快于BA、AB和BB家系(P<0.05),各盐度下壳长生长均依次为AA>AB>BA>BB,但盐度与基因型互作效应不显著(P>0.05);在室外土池、室内循环水槽、室内水桶3种养殖环境下,环境对壳长生长存在显著影响(P<0.05),各家系生长速度均为室外土池>室内循环水>室内水桶,环境对基因型也存在显著影响(P<0.05),各环境条件下BA、AA、AB家系生长速度均显著快于BB家系(P<0.05),壳长生长由大到小依次为AA>AB>BA>BB,且养殖环境和基因型的交互作用也存在显著影响(P<0.05),采用线性回归法对蛤仔4个基因型与养殖环境互作进行数据分析,得出了不同基因型的壳长增长率对环境的响应方法,回归系数所确定的各基因型对环境变化反应的灵敏程度顺序为BB>AB>BA>AA。本研究结果为蛤仔遗传育种工作提供了参考依据。     

最大节约原则下单倍型推导问题的实用算法

在疾病的易感基因研究和药物反应实验中,常常需要知道单倍型,而不仅仅是基因型数据.但是直接通过生物学实验手段来测定单倍型在时间和成本上消耗过大,所以在实验室里往往仅测得基因型,而通过一些计算手段来推导出单倍型.不同于Clark著名的单倍型推导模型,Gusfield和Wang等人提出了一种通过基因型样本推导单倍型的新模型.这种模型试图按照最大节约原则去寻找可以解释基因型样本的最小单倍型集合.这种基于节约原则的模型克服了Clark模型的一些缺陷.提出了节约原则模型的一个多项式时间的贪心算法以及一种把贪心策略和分支限界策略集合在统一框架下的复合算法.相对于Wang原来提出的分支限界完全算法,贪心的近似算法运行快得多,而且同时保持了比较准确的推导结果.新的复合算法也是一种完全算法.实验结果表明,与原来的分支限界算法相比,复合算法可以极大地提高运行效率以及可应用的实例规模.     

有Mate-Pairs的个体单体型MSR问题的参数化算法

个体单体型MSR(minimum SNP removal)问题是指如何利用个体的基因测序片断数据去掉最少的SNP(single-nucleotide polymorphisms)位点,以确定该个体单体型的计算问题.对此问题,Bafna等人提出了时间复杂度为O(2^kn²m)的算法,其中,m为DNA片断总数,n为SNP位点总数,k为片断中洞(片断中的空值位点)的个数.由于一个Mate-Pair片段中洞的个数可以达到100,因此,在片段数据中有Mate-Pair的情况下,Bafna的算法通常是不可行的.根据片段数据的特点提出了一个时间复杂度为O((n-1)(k₁-1)k₂2^2h+(k₁+1)^2h+nk₂+mk₁)的新算法,其中,k₁为一个片断覆盖的最大SNP位点数(不大于n),k₂为覆盖同一SNP位点的片段的最大数(通常不大于19),h为覆盖同一SNP位点且在该位点取空值的片断的最大数(不大于k₂).该算法的时间复杂度与片断中洞的个数的最大值k没有直接的关系,在有Mate-Pair片断数据的情况下仍然能够有效地进行计算,具有良好的可扩展性和较高的实用价值.     

转基因苹果研究现状与展望

从转基因苹果受体基因型、选择标记基因、报告基因及外源基因等方面综述了转基因苹果研究现状,着重论述了外源基因在转基因苹果中的应用.同时综合文献提出了苹果转基因研究存在的问题和今后的研究方向.     

乙型肝炎病毒基因型和基因变异在乙型肝炎病毒相关性肾小球肾炎中的意义

目的:探讨HBV基因型及基因变异等病毒因素在HBV-GN中的意义.方法:选择41例HBV-GN患者,采用荧光PCR法检测HBV-GN患者基因型,HBV多态性芯片检测基因变异,同时测定尿常规、肾功能和血压等临床资料.结果:41例HBV-GN患者,B基因型14例,C型24例(86.8%),B+C混合型3例.B型和C型患者间24小时尿蛋白有显著性统计学差异(P＜0.05),尿红细胞计数、血压、尿素氮和血清肌酐无显著性统计学差异(均P >0.05).12例为前C区1896位变异,1896位变异与未变异者间小便常规,血压和肾功能无显著性差异.结论:HBV-GN患者HBV基因以B、C两型为主,C型为多.C型患肾脏损害可能更为严重.前C区1896位变异和YMDD变异对HBV-GN患者小便常规、血压和肾功能无明显影响.     

不同玉米基因型吸钾能力的比较研究

通过耗竭试验采用供钾水平极低的沙土对不同基因型玉米吸钾能力进行了研究。结果表明,不同基因型玉米吸钾量的多少有显著差异,不同基因型玉米吸收土壤中各形态钾素的比例不同。供试品种中农大86的吸钾量和吸收土壤矿物钾的比例显著大于其它品种。不同玉米基因型其吸钾量的多少、吸收土壤矿物钾的多少和比例是判定其吸钾能力强弱的重要指标。     

葡萄球菌肠毒素基因分型PCR检测技术的研究

通过生物信息学分析,设计了不同基因型肠毒素检测引物;应用含溶菌酶的碱裂解法提取葡萄球菌DNA及梯度PCR方法提高了肠毒素检出率和特异性.从国内28株葡萄球菌分离株中共检测出14种不同型的肠毒素基因(sea-see、tsst-1、seg-sel、sek-sel、sen-seo、seq-ser和seu),未检测到sei和sem基因.毒素基因携带率为16.67%,同时携带4种及以上毒素基因的菌株有11株,占39.29%,其中sek、seq和sea毒素基因在所研究菌株中分布最广,分别占到15.50%、14.30%和10.70%.结果表明不同葡萄球菌菌株间毒素型的关联度不同,sek与seq,seb和sed,sec、sei、sen和seu基因型呈现密切相关,各型肠毒素的分布还与菌株分离来源有着密切联系.所建立的PCR方法可用于金黄色葡萄球菌肠毒素基因分型和分布的研究.