单体型组装问题计算模型的比较与分析

单体型检测在遗传病基因的定位、药理反应的研究、个体识别等方面有极其广阔的应用前景。单体型组装问题指如何利用个体的基因测序片断数据,根据不同的优化准则确定该个体单体型的计算问题。对MSR,MFR,MEC,WMLF,MEC／GI等单体型组装模型做了详细的分析比较,得出了如下结论：在没有引入测序误差情况下,上述模型的重构精度基本一致。随着测序误差的增加,MEC／GI模型的容错性最好,重构精度最高;MSR模型受测序误差的影响最大,只适用于测序误差极小的情形。     

基于变长基因型遗传算法的多供应点应急物资调度优化

如何及时高效地调度应急物资以减小突发事件带来的伤害成为社会关注的焦点问题。在综合考虑新冠肺炎疫情这类特殊突发事件特点的前提下,构建了一类多供应点多式联运应急物资调度网络,并以运输成本最低、时间惩罚最少、配送员被感染风险最小为优化目标建立了一类多目标调度优化模型。考虑到基于聚类思想的优化算法在解决多供应点,尤其是多目标调度优化问题中缩减可行域方法科学性存疑的局限性,提出了一类考虑完全可行域思想的变长基因型混合小生境遗传算法,并借助23个基准测试实例验证了这一算法的有效性,更新了部分实例的现有最优解。在此基础上,通过比较多供应点应急物资多式联运算例中四类遗传算法的仿真结果进一步验证了混合小生境等改进策略的优越性。     

戊型肝炎病毒在长春地区动物群中的流行病学研究

目的分析戊型肝炎病毒(HEV)在长春地区动物群中的感染情况及戊型肝炎病毒系统进化关系。方法用抗-HEV抗体试剂盒检测长春地区猪、牛、羊、鹿、鸡和马血清中的抗体;对部分血清用RT-PCR检测HEVRNA,并对PCR阳性产物进行克隆测序及序列分析。结果493份猪血清中有427份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为86.61%;有5份为HEVRNA阳性,5株克隆的核苷酸序列的同源性为91.2%～99.1%,该5株克隆的序列在ORF2区348bp与1～4型间核苷酸同源性分别为77.8%～82.3%、77.2%～78.1%、77.2%～99.1%和85.2%～95.2%;266份牛血清中有122份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为45.86%;93份羊血清中有7份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为7.53%;798份鹿血清中有348份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为43.61%;369份鸡血清中有18份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为4.88%;197份马血清中有31份为抗-HEV抗体阳性,阳性率为15.74%。结论HEV在多种动物群中均有流行,但在猪群中的流行率明显高于其他动物群。猪感染的HEV的基因序列与人群中散发性戊型肝炎病毒的基因4型同源性最高。进化关系表明,在长春地区猪与人HEV应划为一个分支。     

炎症相关基因多态性与子宫颈癌风险及疗效的关系

目的:探讨炎症相关基因多态性与子宫颈癌风险及疗效的关系。方法:纳入本院妇产科行子宫颈癌手术切除患者的病理样本共计96例,另外纳入正常子宫颈黏膜78例作为对照组,采用基因测序的方法确定单核苷酸多态性的等位基因,分析两组患者的基因型与临床特点,探讨分析子宫颈癌的淋巴结转移与不同的MMP-2基因型之间的关系。结果:MMP-2基因型在子宫颈癌组织及正常组织中基因型的分布是不相同的,通过多因素的Logistic回归分析显示GC和GG两种基因型是子宫颈癌发病的危险因素;淋巴结转移的患者GG基因型的比例要高于未转移子宫颈癌患者。结论:MMP-2的G等位基因是子宫颈癌的危险因素,GG基因型与子宫颈癌的淋巴结转移及预后有着相关性,可作为子宫颈癌发病及转移的危险因素。     

水果和蔬菜能够改变心血管疾病的遗传倾向

<正>我们知道生物体的一切遗传性状都受基因控制,但是基因并不等于性状,从基因型到表现型(性状)要经过一系列的发育过程。遗传性状的表现,不但要受到内部基因的控制,还受到外部条件的制约。因此,不同基因型的个体在不同的环境条件下可以产生不同的表现型,即使同一基因型的个体,在不同环境条件下,也可以产生不同的表现型。也就是说,表现型是基因型与环境共同作用的结果。     

芯片型实验室及基因组研究

芯片型实验室是９０年代后出现的新领域，它与稍早出现的测定型生物芯片相关，但其功能已超宣布是包括了分离、分析等各到基本操作。本文以在基因组研究中常用的几种技术，从ＤＮＡ测序、基因型分析和蛋白组研究三个方面，探讨了在这些领域中开始出现的芯片型推行操作元件现状和潜力。     

纤维连接蛋白基因型多态性与草酸钙肾结石相关性研究

目的:探讨纤维连接蛋白基因(FN)型多态性与草酸钙肾结石的关系.方法:用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测所有研究对象的FN第2内含子rs10202709位点及第26内含子rs35343644位点的基因型,探讨其基因型与草酸钙肾结石的关系.结果:FNAA基因型与草酸钙肾结石的发病率相关(P＜0.05),未发现其他基因型与草酸钙肾结石有相关性.结论:FN基因型多态性与草酸钙肾结石有相关性,FN的AA基因型可作为肾结石患者草酸钙结石危险因素的标志.     

腐植酸浸种对盐碱胁迫下小麦根系抗氧化系统的影响

采用中性盐(NaCl)和碱性盐(NaHCO3)混合模拟不同浓度盐碱胁迫条件,对龙麦26和克旱162种不同基因型春小麦进行腐植酸浸种处理。分别测定根系氧离子自由基、丙二醛和谷胱甘肽含量,以及过氧化物酶和超氧化物歧化酶活性,以探讨腐植酸对盐碱两种胁迫下小麦根系抗氧化系统的调控效应。试验结果表明:随着盐碱胁迫浓度的     

脱落酸对不同基因型小麦抗旱性的影响

脱落酸（ＡＢＡ）是植物内源激素，参与调节许多与植物抗旱性有关的生理生化反应，但外源ＡＢＡ对植物抗旱性的影响与植物的基因型和ＡＢＡ的施用方法有关。停水７ｄ后，根施ＡＢＡ和叶施ＡＢＡ提高所有４个供试小麦品种的绿叶面积和降低所有品种的叶绿素含量。根施ＡＢＡ提高３个品种叶片相对含水量，叶施ＡＢＡ只提高１个品种相对含水量。根施ＡＢＡ对小麦品种Ｋｉｔｅ和Ｂａｎｋｓ的复水成活率无影响，但降低Ｋａｒｃｈｙｉａ和Ｃ－３０６的复水成活率，叶施ＡＢＡ降低所有４个品种的复水成活率。相关分析表明干旱复水成活率与幼苗全株干重相关显著，与假茎干重相关极显著。     

不同基因型春小麦磷效率差异的研究

通过土培试验,研究了甘肃省石灰性土壤上不同基因型春小麦的磷效率差异.结果表明,不同基因型春小麦磷效率存在明显差异.武春121和038014均有较高的磷吸收效率和利用效率;甘春20具有较高的磷吸收效率;永良4号在不同磷矿粉及改性磷矿粉处理中的磷吸收效率均最低.