铜绿假单胞菌基因型与生物被膜形成能力的分析

通过改良的组织平板培养法及ERIC-PCR方法对48株PA生物被膜的形成进行定量分析并绘制其指纹图谱。结果发现48株PA菌株生物被膜形成能力不同,且在17%相似水平上分为A、B、C、D、E五个基因型,其中生物被膜形成能力较弱的菌株大多属于前三个基因型,而D和E基因型则包含了大部分生物被膜形成能力较强的菌株,这表明不同生物被膜形成能力的PA在5个基因型中的分布并非随机的,菌株生物被膜形成能力和基因型之间具有一定的相关性。     

不同基因型甘蔗吸收利用土壤钾素差异分析

利用桶栽试验,研究了不同基因型甘蔗在吸收利用根际与非根际土壤钾素方面的差异。结果表明,在所有参试品种中,YT55生物量是最高的,达97.78 g/株,而YY618最低,为73.84 g/株。然而,YT55体内钾含量是最低的,比钾含量最高的ROC22低0.25%;但YT55钾素利用效率最高,ROC22最低;YY618的钾素累积量最低,种植YT55的根际土壤中速效钾含量最低。说明YT55能在低钾条件下获得较高的生物量,且能高效吸收根际土壤中速效钾和利用体内钾素营养,即属钾高效基因甘蔗。     

丙型肝炎病毒JFH1 NS5A基因对HC-J4病毒复制和感染性的影响

目的探讨丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)2a FL-J6JFH NS5A基因置换对1b型HC-J4复制和感染性的影响,为建立HCV 1b细胞模型奠定基础。方法将JFH1 NS5A置换至HC-J4基因组内,构建嵌合全长基因组HC-J4/JFHNS-5A。体外制备野生型HC-J4、嵌合体及FL-J6JFH的RNA转录体,脂质体介导转染Huh-7.5细胞,采用间接免疫荧光法(IFA)检测转染细胞内的蛋白表达,HCV负链RNA特异性RT-PCR法和荧光定量PCR方法(FQ-PCR)检测基因复制情况。转染后不同时间收集转染细胞上清,感染naive Huh-7.5细胞,观察其感染性。结果 IFA未观察到野生型HC-J4和嵌合体转染细胞内HCV蛋白的表达,但在转染后18 d内的各个时间点,均检测到HCV负链RNA,表明嵌合体和野生型HC-J4在转染细胞内呈低水平复制。转染后第9天和12天,FQ-PCR检测表明,嵌合体转染细胞内HCV RNA水平明显高于野生型转染的细胞(P<0.05)。不同时间点转染细胞上清感染naive Huh-7.5细胞后,IFA均未观察到表达HCV蛋白的阳性细胞。结论 JFH1 NS5A蛋白虽然在一定程度上可提高1b型HC-J4株在体外培养细胞中的复制能力,但还不足以产生能够检测到的感染性病毒颗粒。HCV 1b细胞模型的建立尚受其他因素的影响。     

基因型和环境效应对小麦籽粒物理特性的影响

本研究选用种植在山东省8个地区的22个小麦品种(系)，进行了小麦籽粒硬度、粒重和粒径变异的基因型和环境效应分析。结果表明，小麦籽粒硬度、粒重和粒径的变幅分别为56．03、14．97和0．53，品种间差异均显著；在随机效应中，品种和试点互作效应以及试点效应是影响小麦籽粒硬度和粒重的主要随机效应，随机机误效应甚微，随机效应对品种粒径的变异影响不明显；小麦籽粒硬度、粒重和粒径的稳定性分析表明绝大多数品种稳定性好，对环境反应不敏感。     

大肠埃希菌超广谱β-内酰胺酶基因型分析

目的研究临床分离产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌医院感染的临床分布及其基因型特征,为临床合理用药治疗大肠埃希菌引起的感染提供参考依据。方法采用聚合酶链反应(PCR)分别检测162株产ESBLS大肠埃希菌3种易常见的ESBLS基因TEM,SHV和CTX-M并对其标本来源和科室分布进行分析。结果ESBLS大肠埃希菌最多的科室为重外科(22.9%),可能与手术预防性用抗生素的因素有关。     

武汉地区呼吸道合胞病毒分离株的G蛋白基因遗传特征

目的分析武汉地区人呼吸道合胞病毒(RSV)分离株的G蛋白基因的遗传特征。方法使用不同的特异性引物,对武汉地区2006年分离的9株RSV进行G基因3′末端第2个高变区的序列测定,并进行基因分型和基因亲缘关系分析。结果分离的9株RSV中,33.3%(3/9)为A亚型,属GA2基因型;66.7%(6/9)为B亚型,其中1株属于BA基因型,5株属于GB8基因型。9株RSVG蛋白与原型株核苷酸同源性为84.5%～99.0%,且与原型株相比,在205～230位氨基酸中有5～8个位点氨基酸变异,还存在糖基化位点的改变。结论2006年初在武汉地区存在着由不同RSV株引起的传播链,A、B亚型共循环,B亚型是优势流行亚型;9株RSVG蛋白与原型比较,存在明显的差异。     

奥氮平在精神分裂症中的血清药物浓度/剂量比影响因素研究

目的:探讨影响精神分裂症患者服用奥氮平后血清药物浓度/剂量比（C/D）的因素。方法:回顾性收集了2018年本院304例精神分裂症住院患者的病例资料并查阅入组患者的病历与医嘱,计算奥氮平C/D值,分别考察性别、年龄、BMI、药物来源（国产或进口）、吸烟、合并用药、CYP1A2代谢酶基因型对奥氮平C/D值的影响。结果:男性患者的C/D均值为（2.59±1.08） ng·mL-1·mg-1·d,女性患者的C/D均值为（3.14±1.80） ng·mL-1·mg-1·d,女性患者的C/D均值在统计学上显著高于男性患者的C/D均值（P=0.032）。联合使用肝药酶诱导剂或抑制剂会显著影响患者的C/D值;吸烟会显著降低奥氮平的C/D值（P=0.024）;不同年龄与CYP1A2基因型患者的C/D值没有统计学差异;BMI与奥氮平的来源对患者的C/D值没有显著性影响。结论:患者服用奥氮平后的C/D值主要与患者的性别、合并用药以及是否吸烟有关,同时也需要充分考虑患者的基因型。     

多重荧光PCR方法在HPV基因分型中的应用

目的:探讨多重荧光PCR方法在HPV基因分型中的应用。方法:用已构建的18种中高危型HPV基因分型的多重荧光PCR方法检测510例临床样本,并与核酸测序法结果比较以考察该技术在HPV基因分型中应用的可行性。结果:临床研究表明,HPV 16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82共18种型别检测与核酸测序法结果几乎完全一致。结论:多重荧光PCR方法具有灵敏性高、特异性强、操作简单、通量高,耗样量少的特点,在中小规模临床样本检测中应用前景广阔。     

C基因型牛副流感3型病毒分离株全基因组测序及分析

目的对宁夏地区分离得到的1株C基因型牛副流感3型病毒(bovine parainfluenza 3 virus,BPIV3)进行全基因组测序,并进行同源性及进化树分析。方法参考Gen Bank上登录的BPIV3中国分离株SD0835基因组序列设计5对引物,覆盖病毒基因组全长,提取BPIV3总RNA,以其为模板,进行RT-PCR扩增,扩增产物与p MD誖18-T Vector连接,连接产物转化大肠埃希菌DH5α感受态细胞,将阳性克隆进行核苷酸测序,测序结果通过分子生物学软件进行拼接,并与Gen Bank上登录的参考序列进行比较,构建系统进化树。结果成功分离得到1株BPIV3,命名为NX49,NX49株全基因组核酸序列为15 474 nt,提交至Gen Bank的序列号为KT071671。NX49与中国山东C型分离株SD0835的同源性最高,为99.3%;与中国内蒙古A型分离株NM09的同源性为82.5%;与澳大利亚B型分离株Q5592的同源性为81.4%。结论 NX49与SD0835同属一个进化分枝,但由于地域及时间上的不同,可能造成它们之间在基因水平上存在差异。