基于组蛋白修饰数据预测基因差异性表达的深度融合模型

针对使用大规模组蛋白修饰（HM）数据预测基因差异性表达（DGE）时未合理利用细胞型特异性（CS）和细胞型间异同两类信息,且输入规模大、计算量高等问题,提出一种深度学习方法dcsDiff。首先,使用多个自编码器（AE）和双向长短时记忆（Bi?LSTM）网络降维,并建模HM信号得到嵌入表示;然后,利用多个卷积神经网络（CNN）分别挖掘每类CS的HM组合效应以及两细胞型间每种HM的异同信息和所有HM的联合影响;最后,融合两类信息预测两细胞型间的 DGE。在对REMC数据库中10对细胞型的实验中,与DeepDiff相比,dcsDiff的预测DGE的皮尔逊相关系数（PCC）最高提升了7.2%、平均提升了3.9%,准确检测出差异表达基因的数量最多增加了36、平均增加了17.6,运行时间节省了78.7%;进一步的成分分析实验证明了合理整合上述两类信息的有效性;并通过实验确定了算法的参数。实验结果表明dcsDiff能有效提高DGE预测的效率。     

2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量检测ELISA法的验证

目的验证2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体定量检测ELISA法。方法采用ELISA法检测2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清Ig G抗体含量,并验证该方法的准确性、精密性、特异性、线性、最低检测限及检测范围。结果 3次加标回收测定各型肺炎链球菌多糖IgG抗体回收率为77.47%~99.33%;连续11次测定质控血清2009S、QC5及QC6各型别多糖抗体的CV值为8.97%~18.38%;随着多糖浓度的增高,对抗体的抑制率也增高,呈浓度依赖性,相应其他22型多糖混合物对抗体的抑制率较低;线性R~2均0.99;2、9N、17F及20型肺炎链球菌荚膜多糖血清IgG抗体的检测限分别为0.630、0.592、0.478及0.594 ng/ml,检测范围分别为0.125~30.6、0.08~19.425、0.104~25.325及0.089~21.825 ng/ml。结论该方法具有良好的准确性、精密性及特异性,可用于肺炎球菌疫苗临床血清的检测。     

A/SMBBR组合工艺处理DOP生产废水

以DOP生产废水为研究对象,考察了投加SDC-03生物填料的厌氧/特异性移动床生物膜反应器对废水COD的去除效果,并探讨了进水COD、水力停留时间(HRT)、溶解氧(DO)3个因素对反应器处理性能的影响。结果表明:在水温18~30℃,进水pH为6.0~8.0,COD为2 500~4 000 mg/L,系统水力停留时间(HRT)为5 d的操作条件下,出水COD可稳定在100 mg/L以下,平均去除率为97.1%,最高可达98.39%。该废水处理工艺运行稳定,各项出水水质指标均满足《污水综合排放标准》(GB 8978—1996)三级排放标准的要求。     

甘草黄酮合酶Ⅱ催化甘草素特异性合成7，4′-二羟基黄酮

利用同源序列比对和分子进化树分析从胀果甘草转录组数据库中挖掘并成功克隆到2个黄酮合酶基因：Gur.gene26505和Gur.gene26116。经表征Gur.gene26505为黄酮合酶Ⅱ,具有催化甘草素特异性合成7,4′-二羟基黄酮的特性,而Gur.gene26116为黄烷酮2位羟化酶,可催化甘草素生成包括7,4′-二羟基黄酮在内的三种产物。进一步通过蛋白质结构预测、分子对接和分子动力学模拟探究了黄酮合酶Ⅱ(Gur.gene26505)催化合成7,4′-二羟基黄酮特异性的原因。由于Gur.gene26505活性口袋附近特有的刚性结构β片层使大位阻苯丙氨酸残基翻转至羟化中心下方,消除了羟化产物2-羟基甘草素进入脱水中心的阻力进而发生C₂-C₃位的脱水反应特异性生成7,4′-二羟基黄酮。最后通过基因过表达、反应条件优化和强化菌体生长建立了7,4′-二羟基黄酮特异性合成的最佳细胞催化工艺,使甘草素转化率达到了76.67%。     

孕妇IgG类红细胞血型不规则抗体对早期诊断Non-ABO-HDN的意义

目的探讨孕妇IgG类红细胞血型不规则抗体对早期诊断Non-ABO-HDN的意义。方法筛查4200份孕妇血清中红细胞血型不规则抗体,阳性者检测抗体特异性、免疫球蛋白类型及效价;对检测出IgG类不规则抗体者,分娩时取脐血(或新生儿血)检测血清(浆)游离抗体,并进行红细胞直接抗球蛋白试验和红细胞放散试验,以诊断其是否发生HDN。结果4200份孕妇血清中检出红细胞血型不规则抗体44份(阳性率为1.05%),其中20份孕妇血清的抗体为IgG类或IgG及IgM混合抗体,脐血(或新生儿血)检测结果,10名婴儿发生了Non-ABO-HDN,1名发生了宫内死胎。致病的抗体特异性分布为:抗-D2例、抗-c1例、抗-E2例、抗-cE1例、抗-M4例(其中1例并有抗-A)。结论孕妇体内IgG类的Rh血型系统的抗体及抗-M易引起non-ABO-HDN,检测孕妇IgG类红细胞血型不规则抗体对早期诊断Non-ABO-HDN、鉴别引发HDN的抗体型别、评估HDN的严重程度及制定治疗方案均具有重要意义。     

我国电化学生物传感器的研究进展

介绍电化学生物传感器的基本原理及分类;阐述电化学生物传感器的发展历程;综述近三年来电化学生物传感器中研究最为广泛的电流型生物传感器的应用.     

多通道SPR影像传感器及其对生物分子的检测

采用多通道SPR影像传感系统结构,通过不同通道之间的比较,提取待测分子与探针分子之间相互作用所引起的特异性响应,实现了对生物分子相互作用的实时、高精度、动态检测。该传感系统的光路设计使得入射光可以在可能发生共振的角度范围内以不同角度同时照射各个通道,通过SPR影像可以同时检测不同角度入射光线的反射光强。这样,各通道共振角的分布可以方便地实时监测,同时避免了非特异性响应和机械调节带来的误差和不便。     

非特异性免疫技术治疗病毒性肝病

<正>近年来,由于细胞免疫疗法治疗病毒性肝炎疗效显著,不良反应罕见,在病毒的清除和疾病免疫发病中的作用明显,而引起医学界重视。研究证实,麻疹疫苗注入人体,在清除麻疹病毒的同时,HBV也得到部分清除或抑制;而且通过非特异性细胞免疫的激活,可直接清除和抑制HBV。停止应用后,CD4和CD8的比值保持在正常范围可长达48周~[1-2]。推