基于硬件实现的基因算法的研究

本文提出了一种VLSI实现的硬件基因算法.研究了基因算法的各种变种,探讨了它们的性能及硬件实现的可能性.提出了一个能进行群体存储、父本选择、交叉、变异等操作且易于硬件实现的结构.在硬件实现上,用VHDL描述了整个算法.所作的设计是一个通用的VLSI结构,通过流水线结构和并行化操作获得了很好的性能.硬件实现基因算法有效地缩短运行时间,为实时应用提供了可能.整个设计用Altera公司的FLEX10K40型号的芯片进行了FPGA实现,它完全可以用VLSI来实现.     

蛋白质功能预测方法研究进展

蛋白质功能预测是后基因组时代生物信息学的研究热点之一。利用计算方法预测蛋白质的功能,可以弥补传统生物实验方法周期长、效率低和成本高等方面不足。首先介绍蛋白质功能预测的研究背景,并从计算角度定义蛋白质功能预测问题;然后,对蛋白质功能预测方法的研究现状进行分析与总结,最后指出已有方法中存在的不足及未来的研究方向。     

基于环介导等温扩增技术的产呕吐毒素 蜡样芽胞杆菌特异性检测

本研究旨在建立食品中产呕吐毒素蜡样芽胞杆菌的快速检测方法.基于产呕吐毒素蜡样芽胞杆菌合成酶基因cesB靶基因,设计4条特异性引物(2条内引物、2条外引物),建立环介导等温扩增技术(LAMP).然后采用2株产呕吐毒素蜡样芽胞杆菌、19株蜡样芽胞杆菌和41株非蜡样芽胞杆菌验证了该LAMP具有很好的特异性.LAMP检测的灵敏...     

高校基层党组织“三会一课”融入红色基因路径研究

"三会一课"是我党长期坚持的组织生活制度,面对新形式的发展,我们如何创新高校基层党组织"三会一课"值得我们思考。本文从红色基因概念及内涵出发,分析了高校基层组织"三会一课"融入红色基因的价值,得出了高校基层党组织"三会一课"融入红色基因路径选择,即党校培训,注重红色基因融入到党校培训;校园文化,注重红色基因融入到校园活动;社会实践,注重红色基因融入社会实践。     

应用可视化基因芯片技术检测幽门螺杆菌感染个体化药物治疗相关基因

目的:建立一种能同时检测幽门螺杆菌克拉霉素(23S)、喹诺酮(gyrA)耐药位点和人PPI代谢相关CYP2C19的基因多态性情况的基因芯片检测方法。方法:通过分析筛选人基因组CYP4502C19*2,CYP4502C19*3及幽门螺杆菌克拉霉素和喹诺酮类耐药位点的DNA序列,设计制备了HP感染个体化药物治疗检测基因芯片,并对其特异性、灵敏度、重复性进行了评价。结果:该芯片可以检测出不低于103CFU/ml的幽门螺杆菌和不低于2ng/μl的人基因组DNA。196例临床标本的芯片检测结果与测序结果基本一致。结论:应用可视化基因芯片进行幽门螺杆菌感染个体化药物治疗相关基因检测具有较高的特异性和敏感性,结果准确且易判读,具有较好的应用前景,可以为临床医生提供用药指导。     

AEG-1抑制miR-137对非小细胞肺癌增殖调控作用

目的探讨AEG-1在miR-137抑制非小细胞肺癌(NSCLC)增殖中的作用及机制。方法收集2013年2月~2014年5月在本院手术治疗的65例NSCLC患者肿瘤标本,提取RNA,qRT-PCR检测NSCLC组织、A549、H460及16HBE细胞中miR-137与AEG-1的表达,统计分析NSCLC组织中miR-137与胶质细胞上调基因1(AEG-1)表达的相关性;将A549细胞根据不同转染试剂分成4组:转染miR-137 mimics及空载体组,转染miR-137mimics及AEG-1表达载体组,转染miR-137 inhibitor及siRNA无关序列组,转染miR-137 inhibitor及AEG-1 siRNA组。用Lipofectamine 2000进行转染,生长曲线实验检测转染后细胞增殖情况。结果在NSCLC组织中miR-137与AEG-1的表达呈负相关;miR-137表达高的NSCLC细胞中AEG-1表达降低;共同转染miR-137 mimics与AEG-1过表达载体的A549细胞在48 h的细胞数高于对照组,而共同转染miR-137 inhibitor与AEG-1 siRNA的A549细胞在48 h、72 h的细胞数低于对照组。结论 miR-137与AEG-1在NSCLC组织及细胞中表达呈负相关;AEG-1逆转miR-137对NSCLC细胞增殖的作用。     

碱性裂解液提取DNA法在环氧化酶亚型基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用

目的:应用碱性裂解液法提取的DNA鉴定环氧化酶(COX)亚型基因敲除小鼠,为鉴定纯合子小鼠提供一种方便快捷、低成本、可靠的实验方法。方法:取子代小鼠耳缘组织于EP管中,用碱性裂解液提取基因组DNA,PCR扩增COX-1和COX-2基因片段,通过琼脂糖凝胶电泳对小鼠基因型作出鉴定。结果:碱性裂解液法提取的DNA能应用于子代小鼠的不同基因型的鉴定,即野生型(COX-1+/+;COX-2+/+)、杂合子(COX-1+/-;COX-2+/-)和纯合子(COX-1-/-;COX-2-/-)。结论:建立了碱性裂解液提取DNA法,并将该法成功应用于环氧化酶亚型基因敲除小鼠基因型鉴定中。     

IL3融合蛋白稳定性分析、改造及活性研究

白细胞介素3受体α链(IL-3Rα链)即CD123抗原在急性髓系白血病(AML)干细胞表面高表达,在正常造血干细胞表面几乎不表达,可用做白血病治疗靶点。本实验室构建融合蛋白IL3-LDM靶向杀伤CD123+的肿瘤干细胞,针对其结构不稳定部位进行质谱鉴定,发现IL3第131位丙氨酸和第132异亮氨对融合蛋白稳定性起关键作用,经分子克隆改造后,IL3融合蛋白的稳定性得以显著提高,蛋白产量、靶向结合能力没有变化,这一发现有望广泛应用于相关蛋白产品中,有效提高IL3融合蛋白类药物的稳定性。     

c-fos基因表达在脑缺血中的研究进展

从c-fos基因的表达、c-fos基因的诱导机制以及表达意义几个方面,就c-fos基因表达在脑缺血中的研究进行归纳总结,冀为脑缺血后细胞凋亡、神经保护等机制研究提供思路。     

Pim-1在人宫颈鳞癌组织中的表达及临床意义

目的:研究Pim-1基因及其蛋白在宫颈鳞癌组织中的表达水平,探讨其与宫颈鳞癌临床特性之间的关系。方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)半定量方法和免疫组化学法,检测46例宫颈鳞癌组织和10例正常宫颈组织标本中Pim-1基因及蛋白的表达情况。结果:宫颈鳞癌组织中Pim-1基因与蛋白的表达水平明显高于宫颈正常组织(P<0.05);Pim-1蛋白在宫颈鳞癌组织中的表达与组织学分级、临床分期和淋巴结转移密切相关(P<0.05)。结论:原癌基因Pim-1及其蛋白在宫颈鳞癌组织中过度表达,可能与宫颈鳞癌的发生、发展有关。