基于Illumina MiSeq高通量测序技术内蒙古巴彦淖尔市酸粥真菌菌群多样性分析

采用Illumina MiSeq高通量测序技术解析内蒙古巴彦淖尔地区酸粥样品中的真菌菌群多样性。结果表明,酸粥样品中的优势真菌门（平均相对丰度>1.0%）为子囊菌门（Ascomycota）(98.11%);优势真菌属为毕赤酵母属（Pichia）(37.32%)、哈萨克斯坦酵母属（Kazachstania）(20.34%)、酵母属（Saccharomyces）(11.03%)、耐碱酵母属（Galactomyces）(9.41%)、假丝酵母属（Candida）(5.88%)、曲霉属（Aspergillus）(4.44%)、伊萨酵母属（Issatchenkia）(2.69%)和德巴利酵母属（Debaryomyces）(1.51%)。8份样品共包含50个核心操作分类单元（OTU）（存在于所有样品中的OTU）,其中有15个为优势OTU,分别被注释到8个优势菌属中,累计相对含量达92.49%,具有显著相关性的核心优势OTU间均为正相关关系,该酸粥样品中的真菌类群以Pichia等酵母菌为主,且核心真菌菌群之间大多为正相关关系。     

不同贮藏温度下养殖鲤鱼菌相变化分析

目的通过研究在室温、低温环境下贮藏养殖鲤鱼的菌相、感官、化学和微生物学品质,确定鲤鱼特定腐败菌、货架期和贮藏中鲜度变化,为构建货架期预测模型提供基础。方法分别取贮藏初始和贮藏温度分别为0,5,10,15,25℃货架期终点的鲤鱼鱼肉进行菌落总数、假单胞菌、产H2S菌计数、挥发性盐基氮(TVBN)值测定,并确定特定腐败菌。结果贮藏初始鲤鱼感官指标良好,菌落总数、产H2S菌、假单胞菌和TVBN值分别为(4.34±0.58),(2.85±0.63),(3.42±0.45)lg(CFU/g)和(84.7±5.7)mg/kg。在0,5,10,15℃下贮藏的鲤鱼货架期分别为(28.9±1.20),15.9,6.1,3.6 d,特定腐败菌为腐败希瓦氏菌和假单胞菌;室温货架期为1.1 d,特定腐败菌为气单胞菌。结论基于鲤鱼低温和室温贮藏品质特征、货架期和菌群变化的结果,为货架期模型构建提供了参考。     

Plasma Membrane Calcium ATPase-Neuroplastin Complexes Are Selectively Stabilized in GM1-Containing Lipid Rafts

The recent identification of plasma membrane (Ca²⁺)-ATPase (PMCA)-Neuroplastin (Np) complexes has renewed attention on cell regulation of cytosolic calcium extrusion, which is of particular relevance in neurons. Here, we tested the hypothesis that PMCA-Neuroplastin complexes exist in specific ganglioside-containing rafts, which could affect calcium homeostasis. We analyzed the abundance of all four PMCA paralogs (PMCA1-4) and Neuroplastin isoforms (Np65 and Np55) in lipid rafts and bulk membrane fractions from GM2/GD2 synthase-deficient mouse brains. In these fractions, we found altered distribution of Np65/Np55 and selected PMCA isoforms, namely PMCA1 and 2. Cell surface staining and confocal microscopy identified GM1 as the main complex ganglioside co-localizing with Neuroplastin in cultured hippocampal neurons. Furthermore, blocking GM1 with a specific antibody resulted in delayed calcium restoration of electrically evoked calcium transients in the soma of hippocampal neurons. The content and composition of all ganglioside species were unchanged in Neuroplastin-deficient mouse brains. Therefore, we conclude that altered composition or disorganization of ganglioside-containing rafts results in changed regulation of calcium signals in neurons. We propose that GM1 could be a key sphingolipid for ensuring proper location of the PMCA-Neuroplastin complexes into rafts in order to participate in the regulation of neuronal calcium homeostasis.     

β-葡聚糖增强肠道免疫功能研究进展

肠道既是机体营养物质消化吸收的重要场所,又是防御外界病原体等的重要屏障,维持肠道稳态、增强肠道免疫功能对于保持机体健康至关重要。β-葡聚糖作为一种膳食纤维,同时也被列为益生元,具有众多生物活性和较强的免疫活性,如免疫调节、抗菌、抗炎等,尤其是可以通过直接或间接(肠道代谢物)途径参与重塑肠道菌群组成及比例,维持与修复肠道屏障完整性,调控免疫细胞,进而发挥增强肠道免疫作用。本文主要综述了β-葡聚糖通过增强肠道免疫的作用途径和机制,以及其发挥的生物学作用,为进一步阐明β-葡聚糖与机体肠道相互作用的功能网络提供理论基础。     

食盐对传统发酵肉成熟过程中微生物菌群、理化性质及盐溶性蛋白特性的影响

以不同食盐添加量（0%、1%、3%、5%、7%）发酵肉（戊糖片球菌∶木糖葡萄球菌＝1∶1）为研究对象,测定发酵肉微生物菌群、pH值、水分含量、亚硝酸盐残留量,以及最终成熟发酵肉中食盐、总氮、非蛋白氮及盐溶性蛋白含量,研究食盐添加量对发酵肉成熟过程中微生物菌群、理化性质及盐溶性蛋白特性的影响。结果表明：随着食盐添加量的增加,微生物菌群数量基本呈先上升后下降的趋势;食盐添加量3%的发酵肉,蛋白质水解指数最高,盐溶性蛋白含量最低,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳条带最为清晰。     

基于微生物多样性考察西洋参超微粉饮片的抗疲劳作用和急性毒性

研究了西洋参超微粉饮片对小鼠抗疲劳作用和急性毒性,并探究其潜在作用机制。各组小鼠连续灌胃给药31d,期间和给药后测定小鼠体重、行为学指标、生化指标、肠道微生物变化。与空白组比较,西洋参超微粉饮片组小鼠的转棒时间、跑步距离与爬杆时间均延长,分别为31.03%、15.67%、27.77%;肝糖原和肌糖原、骨骼肌ATP都有升高,分别为35.78%、29.29%、14.49%。血清中的丙二醛(MDA)、尿素氮(BUN)水平显著降低24.03%(p<0.05)、 13.27%(p<0.01), T-SOD活性升高12.71%。Ruminiclostridium9(p=0.0367)、Oscillibacter(p=0.0154)丰度降低,Turicibacters(p=0.0001)丰度增加。胃肠道HE无明显病理变化;一日内给予KM小鼠25.6 g/kg超微粉饮片,小鼠体质量、行为和胃肠道病理均无明显变化。结果说明了西洋参超微粉组抗疲劳作用,比其他两种给药方式好,与增加能量供应和减少代谢物质蓄积直接相关、可能与改变肠道菌群间接相关;对KM小鼠无急性毒性反应。     

降血压活性卡拉胶钾的肠道菌群调节作用研究

为了研究κ-卡拉胶与钾元素结合产物的降血压作用机制,采用高通量测序和生物信息学分析了低分子质量卡拉胶钾(LCP)对肠道微生物群的调节作用。研究发现,LCP对原发性高血压大鼠有稳定且持续的降压作用,与对照组相比,最终降压幅度约为18mmHg(2.3kPa)。以盲肠内容物为研究对象,通过研究其短链脂肪酸的种类和含量变化,发现LCP组肠道内乙酸、异丁酸、丁酸的含量与空白组相比显著升高,其中异丁酸产量变化差异性尤为明显。盲肠内容物的16S rRNA测序结果显示,与空白组相比,LCP组的厚壁菌门与拟杆菌门的比值降低,菌群丰度升高,且产丁酸的瘤胃球菌的数量占明显优势。实验结果表明,LCP可能通过肠道菌群调节作用,实现促进肠道生态失调的健康恢复和治疗高血压的作用。     

Lipidomic and Proteomic Alterations Induced by Even and Odd Medium-Chain Fatty Acids on Fibroblasts of Long-Chain Fatty Acid Oxidation Disorders

Medium-chain fatty acids (mc-FAs) are currently applied in the treatment of long-chain fatty acid oxidation disorders (lc-FAOD) characterized by impaired β-oxidation. Here, we performed lipidomic and proteomic analysis in fibroblasts from patients with very long-chain acyl-CoA dehydrogenase (VLCADD) and long-chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (LCHADD) deficiencies after incubation with heptanoate (C7) and octanoate (C8). Defects of β-oxidation induced striking proteomic alterations, whereas the effect of treatment with mc-FAs was minor. However, mc-FAs induced a remodeling of complex lipids. Especially C7 appeared to act protectively by restoring sphingolipid biosynthesis flux and improving the observed dysregulation of protein homeostasis in LCHADD under control conditions.     

高盐酱腌菜坯致腐微生物的分离鉴定

对 6种高盐酱菜坯进行微生物分离培养 ,分离 3株G-杆菌 6株G+芽孢杆菌和 1株酵母菌 ,根据芽孢杆菌的生理生化试验结果 ,初步鉴定其分别为坚强芽孢杆菌 (B .firmus)、嗜热脂肪芽孢杆菌 (B .stearothermophilus)和巨大芽孢杆菌 (B .megaterium)。