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目的 了解食品来源粪肠球菌的全基因组分子特征, 并与临床分离菌株进行比较基因组学分析。 方法 对收集的食品来源粪肠球菌进行全基因组测序和生物信息学分析, 比较分析3株食品来源粪肠球菌和7株已发表的临床分离粪肠球菌基因组, 对比粪肠球菌基因组中携带的耐药基因、毒力基因和移动元件, 筛选核心基因, 构建系统进化树。结果 3株食品来源粪肠球菌染色体全基因组序列全长分别为2816436、3005875和2818728 bp, 共含有2733、2853和2756个基因, 基因平均鸟嘌呤和胞嘧啶(guanine and cytosine, GC)含量为38.0%。在全基因组核酸水平上, 食品与临床分离的粪肠球菌线性关系良好, 基因组结构高度相似。3株食品来源菌株基因组中含有3~7种耐药基因、8~19种毒力基因和42~67个移动元件, 与临床分离菌株比较, 无显著性差异(P>0.05)。系统进化树分析发现食品来源和临床分离粪肠球菌分布在一个进化分枝, 分子遗传关系距离较近。结论 本研究获得了食品来源粪肠球菌全基因组基本特征的背景材料, 证实了食品来源和临床分离粪肠球菌进化溯源关系相近, 基因组无显著差异(P>0.05), 为后续食品工业界实际应用粪肠球菌的安全性评价奠定了基础。 相似文献
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《食品科学》2014,(17)
<正>We are pleased to announce the launch of a new international peer-reviewed journal-Food Science and Human Wellness,ISSN 2213-4530,which is an open access journal,produced and hosted by Elsevier B.V.on behalf of Beijing Academy of Food Sciences.Food Science and Human Wellness is an international peer-reviewed English journal that provides a forum for the dissemination of the latest scientific 相似文献
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《肉类研究》2014,(12)
<正>We are pleased to announce the launch of a new international peer-reviewed journal-Food Science and Human Wellness,ISSN 2213-4530,which is an open access journal,produced and hosted by Elsevier B.V.on behalf of Beijing Academy of Food Sciences.Food Science and Human Wellness is an international peer-reviewed English journal that provides a forum for the dissemination of 相似文献
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Beef palatability is a complex concept and could be described through an array of features such as tenderness, juiciness and flavor traits. Improving the eating experience when consuming beef and the ability to accurately inform the consumers of the expected eating quality when the product is purchased are critical challenges. In this review, we discuss the current knowledge of quantitative and molecular genetic aspects of palatability and discuss implications of genetic manipulation for the cattle industry. 相似文献
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定向诱导基因组局部突变技术(Targeting Induced Local Lesions In Genomes,TILLING)是一种新近发展起来的高通量检测点突变的反向遗传学方法。本研究首次将TILLING技术用于EMS处理的烟草突变体筛选中,通过对正反向荧光引物使用量的摸索,确定了10 μL PCR体系中IRDye-700标记的正向引物(1 μM)适用量为0.32~0.64 μL,IRDye-800标记的反向引物(1 μM)适用量1.12~1.6 μL;对异源双链CEL Ⅰ酶切体系实验表明,10 μL PCR产物中加入0.6 μL CEL I酶,1.5 μL 10× Buffer酶切效果最好。从而建立并优化了适用于普通烟草基因组研究的TILLING技术体系。在此基础上,以NtPhyB为目标基因,在1000份0.6% EMS诱变的M2突变体中进行筛选,共得到13个突变体,该基因突变频率约为1/94 kb。本试验建立的TILLING筛选体系能够快速、高效地筛选任意已知序列基因的突变体,对烟草功能基因组研究具有重要意义。 相似文献