临界布尔网络的函数泛化问题研究

布尔网络是研究基因调控网络的一种非常重要的模型,通过时序数据推理基因之间的调控关系是研究网络动态行为和干预策略的基础.现有的预测研究主要集中在基因之间的调控关系,而对调控基因与目标基因之间的布尔函数的作用方式研究甚少.由于基因调控网络是一种处于有序和无序之间的临界网络,本文研究了众数规则、基于偏斜和基于互信息的三种泛化方法对临界布尔网络的稳态分布距离和灵敏度误差的影响.结果表明合理的泛化能够明显提高预测网络的稳态分布距离和灵敏度误差指标.三种泛化方法中,基于互信息的泛化方法的总体性能最好.     

作物种质资源学科的发展和展望

作物种质资源学科是 2 0世纪发展起来的 ,瓦维洛夫的世界考察收集及其材料的表型多样性地理分布研究 ,奠定了作物种质资源学科的基础。自 195 8年美国建成世界第一座现代化种子库后 ,至今全世界的种质库已达 130 0多个 ,保存种质 6 0 0× 10 4 份 (另一文献为 2 5 0 0× 10 4 份 )。现在的种质库分为长期、中期和短期三种 ,并在研究液态氮保存。无性繁殖作物采用种质圃或试管苗保存。由于育种工作对种质资源要求日益迫切 ,以及分子生物技术的发展 ,使作物种质资源研究进入了以评价鉴定为主的时代。应用分子遗传图谱不仅能鉴定质量性状 ,而且能发掘数量性状基因。中国原产的作物种质资源得到了较好的收集 ,1986年建成国家作物种质库(长期库 ) ,其中已存入各种作物的种质资源 31× 10 4 份。并建有西宁复份保存库 ,2 2个中期库 ,30个国家种质圃和 2个试管苗库。对保存的材料大多数进行了农艺性状、抗病虫害、抗逆性和品质初步鉴定 ,并建成了中国作物种质资源信息系统。随着生物技术的加速发展 ,应用高新技术千方百计在种质资源中发掘新基因将是 2 1世纪作物种质资源学科发展的热点。因此 ,要妥善保护现有种质资源 ,不再使任何基因流失 ;并从国外引进新作物、新基因 ,以促进农业改制和作物生产的发展 ;大力     

烟草NCED3 基因的克隆及其干旱胁迫表达分析

为揭示9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase, NCED) 在烟草生长发育过程中的功能,通过同源克隆方法获得烟草品种K326 类胡萝卜素降解关键基因NCED3 两个cDNA 全长序列。序列分析表明:K326 NCED3-1 和NCED3-2 基因分别包含一个1842bp 和1830bp 的开放读码框(ORF), 各编码613 个和609 个氨基酸。预测蛋白质分子量分别为68177.8 Da 和67754.2Da,理论等电点(pI) 各为7.66 和7.28。跨膜区预测、亲水性和信号肽分析表明很可能是定位于线粒体膜上的亲水性跨膜蛋白。二级结构预测模型显示此蛋白结构以β 折叠和无规则卷曲为主。蛋白三级结构预测分析表明NCED3-1 与NCED3-2 空间结构极为相似。PEG6000 胁迫分析表明,干旱胁迫可以诱导NCED3 基因表达以及内源ABA 的积累。且在处理12h 之前,NCED3 表达与ABA 累积速度均呈现升高趋势,之后逐渐降低。研究结果为解析NCED3 在烟草抗旱方面的功能提供一定的研究基础。      

印度梨形孢诱导烟草的抗病性分析

内生真菌印度梨形孢(Piriformospora indica)能够增强植物体抗生物和非生物胁迫能力.为了明确印度梨形孢对诱导烟草抗病性的作用,分别进行了接种病原菌长柄链格孢、胶孢炭疽菌、终极腐霉和茄丝核菌后印度梨形孢定殖的烟草对赤星病、炭疽病、猝倒病和立枯病害的抗性试验,同时分析了接种长柄链格孢后烟叶中丙二醛(MDA)和脯氨酸(Pro)含量、抗氧化酶活性以及病程相关蛋白基因表达水平.结果表明:印度梨形孢定殖的烟草,接种长柄链格孢后,烟叶病斑显著减小,烟叶中MDA含量显著降低,Pro含量显著升高,病程相关蛋白基因PR-1a,PR2,PR3和PR5的表达量明显提高;接种胶孢炭疽菌后,烟叶病斑减小;终极腐霉和茄丝核菌对烟草的危害症状显著减轻.印度梨形孢能诱导烟草产生抗病性,是通过维持生物膜系统的完整性、稳定细胞内渗透压以及膜脂过氧化在较低水平、并调控病程相关蛋白基因的表达来实现的.     

经导管动脉注入脂质体介导的 p５３ 基因治疗肝癌的实验研究

目的以兔VX２肝癌模型为对象，探讨经导管动脉注入脂质体介导的p５３基因治疗肝癌的可行性及转染和表达情况。方法将pCMV-myc-p５３质粒、阳离子脂质体LipofectAMINE以及pCMV-myc-p５３和LipofectAMINE的复合体分别注入兔VX２肝癌模型的肿瘤供血动脉，并提取肿瘤组织蛋白，采用蛋白印迹法及免疫组化检测基因转染及其表达。以不同量的pCMV-myc-p５３与LipofectAMINE形成的复合体分别注入兔VX２肝癌模型的肿瘤供血动脉内，同法检测基因的转染及其表达。结果脂质体介导的p５３基因经动脉途径成功转染了兔VX２肝癌模型的肿瘤组织并进行表达，其转染效率明显高于单纯基因导入，基因的量与转染效率之间存在量效关系。结论经动脉途径导入脂质体介导的p５３基因治疗肝癌是可行、有效的，具有广阔的应用前景。     

X射线全身照射对小鼠腹腔巨噬细胞c-myc转录水平的影响

c-myc为即刻早期基因之一,其蛋白表达产物具有转录因子的作用。本文用原位杂交方法观察了小鼠受75mGy及2.0GyX射线全身照射后不同时间,腹腔巨噬细胞c-myc mRNA转录水平的变化。结果表明,2.0Gy照射组c-myc表达明显高于75mGy照射组,而且,2.0Gy照射后从30min到8h均有表达增强,16h和24h无表达,48h再次出现表达增强。     

P53基因、Bcl-XL基因表达对淋巴性肿瘤细胞株辐射敏感性的影响

本文运用PCR－SSCP银染法检测人淋巴细胞恶性肿瘤株8226、U266、Raji、Jurkat、Daudi p53基因状态,RT－PCR半定量检测了Bcx-xL的mRNA的相对表达,DNA片段释放法检测细胞受照后24h的细胞DNA链断裂量,探讨了p53基因功能状态及Bcl-xL基因表达对细胞株8226、U266、Raji、Jurkat、Dsaudi辐射敏感性的影响。结果表明,淋巴细胞恶性肿瘤株8226、U266、Raji、Jurkat、Daudi均存在p53基因突变,高表达Bcl-xL基因的细胞株较低表达细胞株有较强的辐射耐性。     

外源小鼠核酸促电离辐射损伤的同系小鼠肠腺细胞修复的相关基因克隆

为研究克隆外源核酸促电离辐射损伤的小鼠肠腺细胞修复的相关基因。建立BALB／c小鼠电离辐射后给予外源RNA与生理盐水治疗的6、12、24h,4d和8d的模型,收集空肠组织标本后采用消减杂交基础上的LD－PCR技术,获取与受照射小鼠肠腺损伤修复相关的基因克隆,对其进行全自动测序与GeneBank检索,新基因递交给基因库。获取了90个与肠腺修复相关的基因,杂交证实在核酸治疗组与生理盐水治疗组之间呈差异表达,其中18个是新基因,GeneBank接受号为AF240164－240181。获取了90个可能与外源核酸促肠腺修复相关的基因克隆,其中18个是新的相关基因。     

oSM基因转染结合局部照射对体内黑色素瘤的抑制作用:肿瘤的基因一放射治疗策略

探讨OSM对黑色素瘤体内生长的抑制作用及其在基因－放射治疗中的应用。将人OSM cDNA插入pCI-neo构成OSM表达质粒（pO);Egr-1基因调控序列（Egr-IR)连接于OSM cDNA上游构成辐射诱导性OSM表达质粒（pEO),pO和pEO转染小鼠B16黑色素瘤细胞,筛选出OSM表达细胞（pO-17和pEO-1)皮下接种C57小鼠,观察和比较相同生长期内瘤体重量及给予60Co γ射线局部照射后肿瘤抑制率的变化。结果表明;在未照射实验中,pO-17和pEO-1细胞接种20d后的瘤体较对照组明显降低;在照射实验中,pEO-1细胞照射后7d瘤体重量的下降最为显著,肿瘤抑制率较未照射时提高42．3％,说明转基因分泌的OSM可对瘤细胞的体内生长产生抑制。γ射线可通过Egr-1R增强OSM表达的途径,加剧对肿瘤的抑制,体现出基因－放射治疗的效果。     

小肠RNA对小鼠电离辐射肠道损伤修复的差异基因表达的研究

为从基因水平探讨小肠糖核酸,促进小鼠电离辐射肠道操作修复的机理,采用随机分组法把９０只小鼠分成４组,建立辐射后给予４０μｇＲＮＡ治疗的实验组与０．４ｍＬ生理盐水治疗的对照组模型,分别于照射后６、１２、２４ｈ,４ｄ和８ｄ采集小肠空肠段标本,动用消减杂交基础上的ＬＤ－ＰＣＲ技术,分离实验组与对照组之间的差异表达基因。结果表明：实验组与对照组６、１２、２４ｈ,４ｄ和８ｄ的克隆新表达基因数分别为１８、２２