全基因组测序在食源性疾病监控和暴发调查中的应用

全基因组测序(WGS)分型在微生物的遗传与变异特征分析、菌株进化和暴发溯源调查中已经显示出了其极大的应用价值和发展潜力。本文简要概述了WGS的基本原理,介绍了基于全基因组的单核苷酸多态性分型和基于全基因组多位点序列分型两种主要的测序数据解读和分析方式,比较了WGS与脉冲场凝胶电泳技术、多位点序列分型等常见分子分型手段的主要特点,列举了典型的WGS应用于食源性疾病监控和暴发识别的案例,最后对WGS分型在食源性疾病监控和暴发调查领域的发展前景进行了展望。     

Monte Carlo方法的最优源项偏倚抽样密度函数

Monte Carlo粒子输运中的源项偏倚抽样方法可以减小方差、提高计算效率。该文通过建立一个多区域分权重数学投篮模型,模拟了输运过程中的源项信息,得到了源项偏倚抽样方差最小时的最佳抽样密度函数解析式。采用随机数值方法对模型进行了计算,验证了函数的正确性,并举一例实际的粒子输运模拟问题,表明最优偏倚抽样方法对减小方差的效果显著。该方法可作为一种普适的减方差技巧应用于Monte Carlo粒子输运中,可用于构造粒子源参数(如位置、发射方向等)的最佳偏倚密度函数,尤其在分层抽样时能给出方差最小的最优各层比例系数。     

近代上海独立式花园住宅屋顶窗形态浅析

该文从建筑形态学的角度解析近代上海独立式花园住宅屋顶窗的空间形态和人文形态,深入理解近代上海的建筑艺术和文化内涵,并衍生出对当代独立式花园住宅屋顶窗设计的指导意义.     

GaAs基通孔刻蚀的崩边形成机理研究

在砷化镓(GaAs)集成无源器件(Integrated Passive Device, IPD)的制作工艺中,通孔刻蚀是一道重要环节。蚀刻孔边缘的GaAs会被蚀刻,由此引发崩边并对器件性能及可靠性造成不利影响。本文中,用于通孔蚀刻的GaAs厚度不小于200 μm,通孔边缘没有被蚀刻的痕迹,以实现金属导线的平滑连接。采用光阻和金属来充当掩膜,有效解决了单一光阻因厚度过高而变形或者厚度薄导致GaAs衬底被蚀刻的问题。通过优化工艺,在光阻厚度为32 μm、金属掩膜厚度为0.5 μm、金属蚀刻时间为60 s以及感应耦合等离子体(Inductively Couple Plasma, ICP)蚀刻4000 s的条件下,得到了孔深为200 μm且通孔边缘平整的形貌。分析了 GaAs 崩边形成的主要原因与机理,并通过优化工艺解决了200 μm通孔的崩边问题,从而提高了器件性能及可靠性。     

200405年度中国纺织工业固定资产投资解析

纺织固定资产投资规模继续扩大，投资增幅明显回落。据国家统计局提供的数据，2004年纺织工业固定资产投资完成额1179亿元(规模以上企业)，同比增长30．2％；增幅比2003年回落43个百分点，比全国制造业低6．1个百分点；在建项目5275个，同比增加522个；新开工项目3753个，增加224个，新建项目增幅明显少于2003年。其中，一季度投资延续了2003年快速增长的势头，投资增幅高达115．6％；     

某福利院一起肠炎沙门菌食源性疾病的调查分析

目的 对某福利院一起肠炎沙门菌食源性疾病进行调查和溯源,为研究相关食源性疾病提供参考。方法采用流行病学、食品卫生学和脉冲场凝胶电泳(PFGE)同源性分析等方法,分析本次食源性疾病事件。结果 确认本次事件中病例23名,患病率5.65%(23/407);现场采集病例肛拭子15份和厨房工作人员肛拭子3份、留样菜品3份、水果2份以及冰棒1份,其中从11份病例肛拭子中检出肠炎沙门菌,PFGE结果显示11株肠炎沙门菌的DNA条带图谱相似性为96.4%,聚类分析为同一型,结合流行病学调查,初步判断菌株来自同一克隆系。结论 综合流行病学、食品卫生学和实验室检测结果,确定为一起肠炎沙门菌引起的食源性疾病,福利院应加强对特殊人群的饮食安全管理,制定相应的食源性疾病突发事件应急处理预案,防止此类事故再发生。     

超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法快速筛查及测定蜂蜜中20种植物源毒性成分

以超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱（ultra-performance liquid chromatography- tandem q-exactive quadrupole-electrostatic field track trap high resolution mass spectrometry,UPLC- Q-Exactive）建立蜂蜜中20种植物源毒性成分的快速筛查和测定方法,基于高分辨质谱的精准分子量和多级碎片信息确立了20种植物源毒性成分的质谱数据库。以纯水提取样品,以混合型阳离子交换固相萃取小柱（Mixed-mode polymeric strong cation exchange and reversed-phase column,MCX）净化,采用AQ-C₁₈色谱柱（2.1 mm×100 mm, 1.9 μm）进行分离,乙腈和含0.1%甲酸的10 mmol/L甲酸铵水溶液作为流动相梯度洗脱,质谱采用全扫描/数据依赖的二级扫描模式（full scan data-dependent MS/MS acquisition mode,Full MS/ddMS2）,外标法定量。结果显示,20种化合物在10.0~200.0 μg/L范围内,线性关系良好（r>0.99）;该方法的检出限为0.4~6.9 μg/kg;在3个加标水平下,平均回收率为74.1% ~ 114.6%, 相对标准偏差（RSD）为0.2%~4.7%。该方法灵敏度高,准确可靠,操作简单,可对蜂蜜中20种植物源性毒性成分进行快速筛查和定量分析。     

后基因组时代诺如病毒的研究进展

食源性疾病暴发通常是由于食品中的微生物污染引起的。诺如病毒是引起急性和慢性胃肠炎的主要病原体之一,每年在世界范围内引起频繁的暴发,增加人们的生活和健康负担。由于诺如病毒突变的迅速发生以及各个行业,尤其是食品行业的全球化的逐渐加快,诺如病毒的感染已成为严重的公共卫生问题。随着后基因组时代的到来和技术的成熟,诺如病毒的研究取得了新的进展。在这里,我们就诺如病毒的病毒学特征、感染后的临床症状、人体的免疫反应、诊断技术以及现阶段使用基因组学技术的各项发展进行了全面的讨论,为诺如病毒感染的研究和控制了线索。     

美国《科学引文索引》(SCI)概述

美国《科学引文索引》是目前国际上公认的最具权威的科技文献检索工具。这里着重介绍了SC I的收录范围、结构体系、功能、选刊原则及要求。     

对象标识符解析系统关键国际标准及应用研究

根据ISO/IEC JTC1/SC6最新通知文件,我国主导修订的两项对象标识符(OID)解析系统关键国际标准即将进入发布阶段。该标准重点解决了OID标识解析性能及可用性差、根节点运营机构缺少有效监管等多方面积弊,更加匹配工业互联网等场景的应用需求。从标准化角度出发,详细对比分析新版标准修订内容及其影响,给出面向产业数字化的OID标识解析系统建设思路,为建设兼容开放、安全可靠、服务国际的OID标识体系提供参考。