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991.
Haokun Zhang Qinlinglan Zhou Hongyan Chen Daru Lu 《International journal of molecular sciences》2022,23(9)
Recently developed Prime Editor 3 (PE3) has been implemented to induce genome editing in various cell types but has not been proven in human hematopoietic stem and progenitor cells. Using PE3, we successfully installed the beta-thalassemia (beta-thal) mutations in the HBB gene in the erythroid progenitor cell line HUDEP-2. We inserted the mCherry reporter gene cassette into editing plasmids, each including the prime editing guide RNA (pegRNA) and nick sgRNA. The plasmids were electroporated into HUDEP-2 cells, and the PE3 modified cells were identified by mCherry expression and collected using fluorescence-activated cell sorting (FACS). Sanger sequencing of the positive cells confirmed that PE3 induced precise beta-thal mutations with editing ratios from 4.55 to 100%. Furthermore, an off-target analysis showed no unintentional edits occurred in the cells. The editing ratios and parameters of pegRNA and nick sgRNA were also analyzed and summarized and will contribute to enhanced PE3 design in future studies. The characterization of the HUDEP-2 beta-thal cells showed typical thalassemia phenotypes, involving ineffective erythropoiesis, abnormal erythroid differentiation, high apoptosis rate, defective alpha-globin colocalization, cell viability deterioration, and ROS resisting deficiency. These HUDEP-2 beta-thal cells could provide ideal models for future beta-thal gene therapy studies. 相似文献
992.
993.
994.
最大误差是评价并联6自由度平台性能的重要指标,提出了改进的粒子群算法来求解最大误差.首先借助矩阵微分法求出平台误差表达式,将最大误差作为优化目标函数,除了各结构参数误差外,还将平台的位置和姿态列入优化变量.在标准粒子群算法中引入非线性变化权重和变异操作来保证全局收敛并提高收敛精度.实例计算表明该方法的有效性,可用于平台设计阶段的误差预测. 相似文献
995.
碱性淀粉酶菌株的紫外线和He-Ne激光复合诱变的研究 总被引:1,自引:2,他引:1
以嗜碱芽胞杆菌(alkaliphilic bacillus)BC-A36为出发菌株,通过紫外线,N-甲基-N′-硝基-亚硝基胍(亚硝基胍NTG)和激光复合诱变处理,选育出一株高产碱性淀粉酶的突变株JG-57,在摇瓶发酵培养基上35~37℃培养45 h,测得酶活力稳定在867 u/mL左右,为出发菌株酶活力的2.1倍。该突变株产酶温度在25~43℃,最适温度37℃,产酶pH值7~12,最适pH值9。该酶较稳定的pH值适宜范围为9.5~10。传代实验证明,该突变株遗传性能稳定。说明激光辐照是碱性淀粉酶菌株有效的选育方法。该突变株产生的碱性淀粉酶可适用于淀粉的液化、洗涤及纺织工业等。 相似文献
996.
测试用例集的缺陷检测有效性指测试集能够在多大程度上检测出软件中存在的缺陷. 如何评价测试集的缺陷检测有效性是一个重要问题. 覆盖率和变异得分是两个最重要和最广泛使用的测试集有效性度量. 为量化测试集的缺陷检测能力, 研究人员对测试集有效性评价进行了大量研究并且取得了较大的进展. 与此同时, 现有研究存在不一致的结论, 该领域依然存在一些亟待解决的挑战. 对多年来国内外学者在测试集有效性评价领域的研究成果进行系统性的梳理和总结. 首先, 阐述测试集有效性评价研究中的问题. 然后, 介绍并分析基于覆盖率和基于变异得分的测试集有效性的评价以及介绍测试集有效性评价在测试集优化中的应用. 最后, 指出测试集有效性评价研究中面临的挑战并给出建议的研究方向. 相似文献
997.
适用于高维优化问题的改进进化策略 总被引:7,自引:0,他引:7
针对高维连续函数优化问题,研究了CES(classical evo lution strateg ies)的变异方式、繁殖方式,提出了全基因变异与单基因变异的概念,通过理论分析和仿真计算论证了单基因变异比全基因变异具有更好的局部搜索能力和少的计算开销;针对CES策略参数(变异幅度)随机性过强,不能很好地跟踪进化过程的问题,提出了随着进化过程递减的策略参数.最后,建立了单基因Gauss变异与均匀变异相结合、使用精英繁殖、递减型策略参数、小种群规模的(μ λ k)-ES,给出了一组100维典型测试函数的仿真计算结果. 相似文献
998.
Viktoria Koroknai Istvn Szsz Krisztina Jmbor Margit Balzs 《International journal of molecular sciences》2022,23(5)
Cytokine and chemokine receptors can promote tumor progression, invasion, and metastasis development by inducing different intracellular signaling pathways. The aim of this study was to determine the cytokine and chemokine receptor gene expression patterns in human melanoma cell lines. We found a large set of cytokine and chemokine receptor genes that were significantly differentially expressed between melanoma cell lines that originated from different subtypes of primary melanomas as well as cell lines that originated from melanoma metastases. The relative expressions of two receptor genes (CCR2 and TNFRSF11B) were positively correlated with the invasive potential of the cell lines, whereas a negative correlation was observed for the TNFRSF14 gene expression. We also found a small set of receptor genes that exhibited a significantly decreased expression in association with a BRAFV600E mutation. Based on our results, we assume that the analyzed cytokine and chemokine receptor collection may provide potential to distinguish the different subtypes of melanomas, helping us to understand the biological behavior of BRAFV600E-mutated melanoma cells. 相似文献
999.
改进自适应遗传算法在函数优化中的应用研究 总被引:3,自引:0,他引:3
为了改善传统自适应遗传算法的收敛速度以及局部收敛问题,根据种群适应度的集中程度,以种群的最大适应度、最小适应度以及适应度平均值这3个变量为基础,设计了改进的自适应交叉概率和变异概率来调整整个种群的交叉概率和变异概率,提出了一种基于种群适应度集中程度的改进自适应遗传算法.将该算法应用于函数优化中,仿真结果验证了其具有"快速收敛"的特点,且在很大程度上可避免遗传算法的早熟现象. 相似文献
1000.
为了提升发酵法产L-色氨酸的生产效率,使用常压室温等离子(atmospheric and room temperature plasma, ARTP)诱变育种技术,并结合结构类似物抗性定向筛选的方法,选育高产色氨酸菌株。将出发菌Escherichia coli AC-1042经过ARTP诱变处理后,在抗性培养基平板上筛选具有5-甲基色氨酸、对氟苯丙氨酸抗性的突变菌株,选取产酸高、遗传稳定的菌株重复进行ARTP诱变处理和抗性筛选,不断提高菌株对结构类似物的抗性水平。经过多次ARTP诱变处理和抗性筛选,获得1株色氨酸高产菌株ACTRP104,经过30 L发酵罐培养44 h后L-色氨酸质量浓度可以达到61.65 g/L,葡萄糖转化率达到20.64%,比出发菌分别提高了20.69%和17.81%。结果表明,ARTP诱变和结构类似物抗性筛选相结合,可以有效地获得色氨酸高产突变菌株,大大提高色氨酸的发酵生产技术水平,获得的色氨酸高产菌株ACTRP104具有较好的工业化应用前景。 相似文献