利用肠杆菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)方法对阪崎克罗诺杆菌进行分子分型

阪崎肠杆菌在2008年被重新命名为克罗诺杆菌属的一个新种,是一种条件致病菌,可引起严重的新生儿脑膜炎、坏死性小肠结肠炎和菌血症,严重的可能引起神经系统后遗症和死亡.目前,越来越多的报道证明婴儿配方粉是其主要的传染源和传播媒介.利用肠杆菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)方法对43株克罗诺杆菌属菌株和5株肠杆菌属菌株进行分子分型,利用BioNumericus软件对其结果进行分析,如果按照相似性大于80%计算,根据辛普森方程计算该分型方法的分辨率可达到0.984.研究结果表明:ERIC-PCR是一种适用于阪崎克罗诺杆菌的快速分子分型方法,能够对由该菌引起的食品中毒事件进行快速的溯源.     

阿科特素体外处理乳腺癌细胞的基因表达通路分析

近年来有研究表明黑升麻提取物阿科特素具有抗肿瘤活性。但其分子机制仍然不够清楚。研究用基因集富集分析的方法分析了20μg,／mL和40μg／mL两种不同质量浓度的阿科特素处理乳腺癌细胞MDA—MB--4536h或24h后的基因表达谱,获取处理后的乳腺癌细胞中的基因集富集情况．结果表明：处理6h的乳腺癌细胞中没有获得有统计学意义的基因集,而在处理24h的乳腺癌细胞中与细胞分裂、细胞周期等相关的生物学通路则表达下调,40Ixg／mL阿科特素处理还可以使得乳腺癌细胞中大分子降解相关通路表达上调．由于阿科特素可以促进细胞凋亡并抑制细胞周期,为其今后用于乳腺癌的预防和治疗的可能性提供了良好的理论依据．     

中国的三处名山

山,倒海翻江卷巨澜。——毛泽东《十六字令》韶山是因为传说中的祝融火神驾临过韶山?韶山冲这块神奇的土地孕育的一位伟人的生命里就有了红色文化的基因。这位伟人是一个伟大的革命家,也是一个伟大的画家。从1893年12月26日他诞生的那一天起,就注定     

乳酸脱氢酶A(ldha)基因的克隆与原核表达

乳酸脱氢酶是一种糖酵解酶,在厌氧条件下能催化丙酮酸生成乳酸;当动物体内缺乏葡萄糖时,还可氧化乳酸生成丙酮酸并经葡萄糖异生途径转变为葡萄糖。通过反转录PCR获得了Hela细胞中的ldha基因,并将它克隆到pET28a(+)载体上,获得重组表达载体pET28a(+)-ldha。重组质粒通过转化法转入宿主E.coli BL21(DE3)溶源菌中。SDS-PAGE分析表明,在1.0 mmol·L-1异丙基硫代-β-D半乳糖苷(IPTG)的诱导下,重组子成功表达了一条分子质量约为36 kDa的目标蛋白。     

基于SNP基因型谱和表达谱的乳腺癌相关基因网络的构建

拟构建乳腺癌相关基因网络并从系统生物学角度解析乳腺癌发病的分子机制,采用基于SNP基因型谱和乳腺癌基因芯片表达谱数据分别进行全基因组关联分析和差异表达基因的筛选,并以此为基础构建乳腺癌相关基因网络,网络分析结果显示乳腺癌相关基因主要参与代谢、信号传导、蛋白质修饰等功能。该网络能够从系统层面上解释乳腺癌的遗传互作机制,并为研究其它复杂疾病提供一定的理论依据。     

改进的基因术语间语义相似度计算方法

目前,基于混合方法的相似度计算对影响语义相似度的因素分析不全面。针对这个问题,提出了基于多个影响术语语义相似度度量因素的综合方法。该方法结合语义层次,语义距离和局部语义密度,充分运用本体的语义信息来计算基因术语间的语义相似度。实验结果表明,该方法与人工打分的相关系数更高。     

A Novel Sample Selection Method for Plant Resistance Gene Recognition

植物抗性基因识别中的从头预测方法可以看作机器学习中的分类问题.通常情况下,一个分类器的训练需要正确标记的正例和反例.然而,抗性基因识别中可用的信息仅有少数人工标记的抗性基因,且不具有抗性功能的基因也不明确.为了消除由于正例太少和错误的反例带来的抗性基因识别的影响,基于抗性基因和其他基因在蛋白质相互作用网中的距离,提出了一种新的样本选择方法,并对提出的样本选择方法和通常样本选择方法分别在四种分类器上进行了10倍交叉验证.结果表明,文中方法的SN值平均提高了6.9％,SP值平均提高了13.1％.因此,就敏感性和特异性而言,提出的方法获得了更高效、更可靠的结果.     

东宝药业启动基因重组人胰岛素二期工程

通化东宝药业日前进行了基因重组人胰岛素及制剂二期工程建设，这个扩产项目已通过国家发展和改革委员会批准立项。     

在大肠杆菌K99(中国QH株)菌毛形成亚单位基因(fanC)的克隆和测序中发现IS1 插入序列

目的 构建大肠杆菌K99菌毛表达载体。方法 通过逐级亚克隆的方法克隆k99菌毛形成亚单位基因（fanC），并进行序列测定和fanC亚单位的抗原决定簇模拟，以确定突变部位。结果 克隆了包括K99菌毛形成亚单位基因（fanC）和部分fanD基因在内的一段基因，该基因与国外报道相比明显偏大。序列测定表明：在fanC尾部多出 24bp，在fanC与 fanD，的结合部有一 800bp左右的新基因。经与基因库中大肠杆菌基因作同源性比较发现，该新基因为768bp的插入序列IS1。其他基因为K99自身fonC与fanD片段之间的过渡基因。IS1的插入未改变fanD，基因的阅读框架，只是使fanD片段末端增加了 8个氨基酸。fanC亚单位的抗原决定簇模拟结果显示，K99 fanC片段具有一个非常突出的亲水区域，根据经验它应是抗原决定簇所在的部位。结论 首次发现大肠杆菌K99基因中含有插入序列IS1。     

HSV-tk基因/GCV系统治疗肿瘤的旁观者效应与缝隙连接关系的研究

目的 探讨单纯疱疹病毒胸苷激酶（HSV－tk）基因／丙氧鸟苷（GCV）系统杀伤肿瘤细胞时旁观者效应与细胞间缝隙连接的关系。方法 用PA317细胞包装STK质粒（逆转录病毒载体介导的HSV-tk基因），形成假逆转录病毒颗粒，转染有缝隙连接的大鼠胶质瘤细胞C6和无缝隙连接的入宫颈癌细胞 Hela，制成 C6 tk+和 Helatk+细胞，将不同比例的C6和 C6 tk+、Hela和 Hela tk+细胞混合，每种比例8孔，培养 24h后 4孔加入含0．5μg/mlGCV的培养基，4孔作对照，6d后用MTT法测量细胞存活率。在两个培养皿中放入周围粘有33mm高滤纸的载玻片，分别接种 C6、C6 tk+细胞。细胞 80%汇合后将载玻片互换，并加入含0．5μg/ml GCV的培养基，6d后观察细胞形态。结果C6细胞组存在旁观者效应，Heal细胞组不存在旁观者效应。培养皿中tk+细胞大部分被杀死,tk-细胞无变化。结论HSV-tk基因/GCV系统杀伤肿瘤细胞时旁观者效应与细胞间缝隙连接有关。