蛋白质相互作用网络功能模块检测的研究综述

蛋白质相互作用（Protein-protein interaction,PPI）网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题. 本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用;其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述;再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比. 最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考.     

磁性塑料卷材的研制与应用

磁性塑料卷材由ＣＰＥ树脂、助剂以及磁粉、经塑炼、压延成型的一种柔性薄 强磁性材料。为使大量磁粉（约９０Ｗｔ％－９２Ｗｔ％）能均匀分散在少量树脂（约６Ｗｔ％－７Ｗｔ％）中，必须对磁粉的分散性及其颗粒形状等方面进行研究。     

用DCS顺控实现电除尘自动控制

介绍一种对电除尘工序进行远程自动控制的方法。使用DCS顺序控制图，通过模块组态和内部编程，实现多台设备的自动控制，优化工艺过程，提高该工序的自动化水平。     

基于交叠社团相似性的生物网络关键节点识别

生物网络是研究生物特性的一个重要工具,目前已经有许多方法用于研究生物网络,关键节点分析是其中最常用的方法之一。关键节点分析通常是根据一定的规则为网络中的各节点分配一个函数值,并由此来确定网络中各节点的重要程度,目前已经发表了一些方法。然而,这些方法在单独使用的情况下,获得的关键节点的生物学意义一般较低,存在一定的缺陷。本文从节点对社团贡献的角度建立关键节点识别方法,首先提取网络中富含生物学功能意义的社团,然后依据交叠社团的相似性为各节点分配贡献值,最后通过两个生物网络实例论证了方法的有效性。     

医用内窥镜微型摄像模组设计

设计了一种新型医用内窥镜微型摄像模组.该模组采用微型、高分辨率的CMOS图像传感器结合低压差分信号（LVDS）传输技术进行设计,使摄像模组直径缩减至5.0mm,并实现了图像数据的长距离高保真传输.搭建了实验平台对摄像模组的摄像功能进行了测试.结果表明：该模组图像传输距离超过2m,分辨率达到30万像素,对口腔溃疡模拟粘膜病变的识别率高达90％.其图像分辨率高,传输距离长,使其适用于内镜诊断;其直径小,能大大提高病人内镜检查的舒适性,为超细内镜诊断提供了一种极佳的解决方案.     

树突细胞算法在线分析组件的研究

原始树突状细胞算法（DCA）的离线分析过程,将会导致时间差异,从而产生假警报,增加了虚警率,也会导致攻击的成功发生,这对一个人侵检测系统来说是致命的。因此,文中的目的就是在不影响检测精度的前提下提高检测速度。于是文中提出了分片思想的在线分析组件与DCA相集成的方法,即根据抗原采样数量或者时间将一系列已处理的信息分割成为更小的部分,使得每个分片独立地进行实时的、周期性的分析,这样在每个分片内的入侵攻击就能及时地被识别出来。文中给出了DCA在线分析模块的伪代码描述,并且将其应用于SYN端口扫描的检测实验中。结果表明,DCA在线分析模块在不影响检测精度的前提下有效地提高了检测速度。     

浅谈"理论设计模块"教学改革

根据多年的教学经验,就“数控加工”方向的机电专业,浅谈对其“理论设计模块”教学内容和教学方法的改革。     

Interactions between immunoglobulin-like and catalytic modules in Clostridium thermocellum cellulosomal cellobiohydrolase CbhA

Cellobiohydrolase CbhA from Clostridium thermocellum cellulosome is a multi-modular protein composed starting from the N-terminus of a carbohydrate-binding module (CBM) of family 4, an immunoglobulin(Ig)-like module, a catalytic module of family 9 glycoside hydrolases (GH9), X1(1) and X1(2) modules, a CBM of family 3 and a dockerin module. Deletion of the Ig-like module from the Ig-GH9 construct results in complete inactivation of the GH9 module. The crystal structure of the Ig-GH9 module pair reveals the existence of an extensive module interface composed of over 40 amino acid residues of both modules and maintained through a large number of hydrophilic and hydrophobic interactions. To investigate the importance of these interactions between the two modules, we compared the secondary and tertiary structures and thermostabilities of the individual Ig-like and GH9 modules and the Ig-GH9 module pair using both circular dichroism (CD) spectroscopy and differential scanning calorimetry (DSC). Thr230, Asp262 and Asp264 of the Ig-like module are located in the module interface of the Ig-GH9 module pair and are suggested to be important in 'communication' between the modules. These residues were mutated to alanyl residues. The structure, stability and catalytic properties of the native Ig-GH9 and its D264A and T230A/D262A mutants were compared. The results indicate that despite being able to fold relatively independently, the Ig-like and GH9 modules interact and these interactions affect the final fold and stability of each module. Mutations of one or two amino acid residues lead to destabilization and change of the mechanism of thermal unfolding of the polypeptides. The enzymatic properties of native Ig-GH9, D264A and T230A/D262A mutants are similar. The results indicate that inactivation of the GH9 module occurs as a result of multiple structural disturbances finally affecting the topology of the catalytic center.     

基于ADS的毫米波收发组件设计及仿真

接收发射组件(T/R组件)是相控阵天线的核心部分,在通信、雷达等应用领域日益得到重视。针对毫米波段的T/R组件进行了研究,在相控阵技术基本原理分析基础上,对功放、低噪放、移相、衰减、开关及中频放大等模块进行了选型设计,利用安捷伦ADS软件对T/R组件进行仿真验证,仿真结果显示接收组件具有较好的噪声系数,发射组件功率输出满足设计指标要求。     

一种蛋白质复合体模块度函数及其识别算法

蛋白质复合体对于研究细胞活动具有重要意义.随着新的生物实验技术的不断出现,产生了大量的蛋白质相互作用网络.通过对蛋白质相互作用网络进行聚类识别蛋白质复合体是当前研究热点.然而,目前大多数蛋白质复合体识别算法的性能不够理想.为此,提出了蛋白质复合体模块度函数(PQ),并在此基础上提出了基于蛋白质复合体模块度函数的模块合并(based on protein complexes modularity function for merging modules,BMM)算法.BMM算法首先识别网络中一些稠密子图作为初始模块,然后依据PQ函数对这些初始模块进行合并,最终得到了质量较高的蛋白质复合体.将识别出的复合体分别与2种已知的蛋白质复合体数据集进行比对,结果表明BMM算法具有很好的识别性能.此外,与其他最新的识别算法相比,BMM算法的识别准确率较高.