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改进的RNA-Seq数据转录组表达分析研究 总被引:1,自引:0,他引:1
基于高通量测序的RNA-Seq(RNA-sequencing)是用于转录组研究的一种新技术,针对该技术在转录组表达分析研究中存在的读段多源映射和读段非均匀分布等难点,提出一个改进的转录组表达研究方法LDASeqII(Improvement of latent Dirichlet allocation for sequencing data)。模型利用剪接异构体结构信息对参数进行约束并进行外显子读段数目归一化处理,解决了读段非均匀分布下的多源映射问题。通过引入“伪外显子”和“伪转录本”分别处理接合区读段和噪声读段。将模型应用到真实数据集上,并与原LDASeq(Latent Dirichlet allocation for sequencing data)模型和目前流行的 Cufflinks与RSEM(RNA-Seq by expectation maximization)方法进行对比。结果显示,改进方法获得了更为准确的转录本及基因表达水平计算结果。 相似文献
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谷葆春 《计算技术与自动化》2022,(3):138-141
针对一个基于中文文本摘要的金融知识引擎系统,研究了Seq2Seq模型在系统中的应用。首先构建Seq2Seq模型,将研报等重要的数据输入模型的Encoder端,从Decoder端输出摘要。在seq2seq模型中加入了Attention(注意力)机制,也就是在产生输出的时候,对关系较大的输入输出数据赋以较大权重,再根据关注的区域产生下一个输出。最后通过LawRouge评价器对生成的金融数据进行效果评价。 相似文献
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车道变换在交通安全中起着至关重要的作用,准确预测驾驶员的车道变换行为可以显著提高驾驶安全性.本文提出了一种基于全连接神经网络和循环神经网络的混合神经网络,用于精准预测车道变换行为.并且提出动态时间窗口,提取包括驾驶员生理数据和车辆运动学数据的车道变换特征.最后,通过真实交通场景下的数据验证了所提出模型的有效性.此外,将所提出的模型与五种其他预测模型进行了比较,结果表明,与其他模型相比,本文所提出的预测模型具有更高的精确率和前瞻时间. 相似文献
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燃气负荷预测是一项让城市安全经济地调配燃气的重要的工作. 目前, 基于注意力机制的Seq2Seq模型越来越多地应用于燃气数据预测, 是一种有效的燃气负荷预测方法. 然而, 针对燃气负荷数据这种突变频率高、幅度大的特点, 一般基于注意力机制的Seq2Seq模型难以提取数据中的多维时间模式信息与应对数据随机突变情况, 在处理影响因素复杂的燃气负荷的预测问题时仍然需要改进. 为此, 本文提出多维注意力机制Seq2Seq模型. 一方面设计研究了多层次时间注意力模块, 综合单时间步长、多时间步长的注意力计算提取数据中不同时间模式信息; 另一方面, 设计增加了局部历史注意力模块, 以改进模型中无法区分重要历史信息的缺陷, 使模型在预测时倾向于参考更为重要的历史信息. 本改进模型针对燃气负荷的独特特性, 具有较好的预测表现. 使用国内某市区的燃气消耗数据与2016年电工数学建模竞赛的电力负荷数据的实验结果表明, 本改进模型相对于一般注意力机制Seq2Seq模型, MAE分别降低了17%与9%. 相似文献
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喘振是航空发动机在运行过程中一种危害性极大的气动失稳现象,严重时会导致飞行事故,引起人员和财产的巨大损失,因此寻求一种快速准确的发动机喘振故障的诊断方法对于保障航空发动机飞行安全具有重要的现实意义和价值。当前针对航空发动机喘振故障诊断的模型存在诊断时间长、诊断准确率不高的特点。为了解决这些问题,在序列到序列(Seq2Seq)模型的基础上,使用卷积神经网络(CNN)代替Seq2Seq中编码器-解码器结构上的长短时记忆网络(LSTM)构建得到基于CNN-Seq2Seq的航空发动机喘振诊断模型。该模型利用CNN局部连接以及权值共享的特点实现并行计算,从而大幅提高计算效率并降低诊断耗时。使用某型发动机上的多传感器试验数据对模型进行实验,实验结果表明该模型在显著降低模型大小和计算量的同时,在精确率、召回率及F1 Score上仍然获得了94.3%、92.1%、93.2%的表现,同时单次预测耗时仅需2 ms。 相似文献
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越来越多的研究开始聚焦于情感对话生成,然而现有的研究往往只关注情感因素,却忽视了对话中主题的相关性和多样性以及与主题密切相关的情感倾向,这可能导致生成响应的质量下降。因此提出一种融合主题信息和情感因素的主题扩展情感对话生成模型。该模型首先将对话上下文进行全局编码,引入主题模型以获得全局主题词,并使用外部情感词典获得全局情感词;其次在融合模块里利用语义相似度扩展主题词,并利用依存句法分析提取与主题相关的情感词;最后将上下文、主题词和情感词输入到一个基于注意力机制的解码器中,促使解码器生成主题相关的情感响应。实验结果表明,该模型能生成内容丰富且情感相关的回答。相较于主题增强情感对话生成模型(TE-ECG),所提出的模型在unigram多样性(distinct-1)和bigram多样性(distinct-2)上平均提高了16.3%和15.4%;相较于基于注意力机制的序列到序列模型(Seq2SeqA),所提出的模型在unigram多样性(distinct-1)和bigram多样性(distinct-2)上平均提高了26.7%和28.7%。 相似文献
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针对目前大多数的网络态势预测方法不能挖掘数据中的深度信息且需要手动提取与构造特征的问题,提出了深度特征网络态势预测方法DFS-Seq2Seq。首先将网络流、日志和系统事件等产生的数据进行清洗处理,使用深度特征融合算法自动合成深度关系特征,然后采用自动编码器对合成的特征进行提取,最后使用长短期记忆网络(LSTM)构建Seq2Seq模型对数据进行预测。通过设计缜密的实验在公开数据集Kent2016上对所提方法进行验证,结果显示在深度为2时与支持向量机(SVM)、贝叶斯、随机森林(RF)和LSTM这四种分类模型相比,其召回率分别提升了7.4%、11.5%、6.5%、3.0%。实验结果表明DFS-Seq2Seq可以在实际应用中有效地识别网络身份验证中的危险事件,对网络态势作出有效的预测。 相似文献