组蛋白去乙酰化酶抑制剂SAHA联合ZD55-TRAIL溶瘤腺病毒对肝癌细胞杀伤作用的研究

研究组蛋白去乙酰化抑制剂SAHA(suberoylanilide hydroxamic acid)联合ZD55-TRAIL对人肝癌细胞株的体外杀伤效果,实验采用MTT法检测SAHA、ZD55-TRAIL以及二者联合对肝癌细胞株Huh-7、Bel-7404、Hep3B以及人正常肝细胞株QSG-7701增殖的抑制作用;利用Hoechst33342染色对联合处理的细胞进行凋亡形态学观察;通过结晶紫实验进一步检测联合用药对肿瘤细胞的杀伤情况;通过Western blot实验在蛋白水平上检测一些凋亡相关蛋白表达情况的变化.实验结果表明:SAHA联合ZD55-TRAIL处理3d后对肝癌细胞株Huh-7的增殖抑制率达到50％,对Hep3B、Bel-7404也达到近40％的杀伤效率,并且联合治疗后对人正常细胞株QSG-7701未见明显的毒副作用.同时结晶紫实验也证明联合治疗对肿瘤细胞的杀伤力强于用SAHA或ZD55-TRAIL单独使用.Western blot实验证明了药物和病毒的联合作用使促凋亡蛋白Bcl-2,Bcl-xL的表达量明显减少,caspase-8和caspase-9蛋白也有相应剪切现象的发生.流式细胞仪同样检测出SAHA和ZD55-TRAIL联合作用对肝癌细胞有很好的杀伤作用.     

Fault-based test suite prioritization for specification-based testing

Context

Existing test suite prioritization techniques usually rely on code coverage information or historical execution data that serve as indicators for estimating the fault-detecting ability of test cases. Such indicators are primarily empirical in nature and not theoretically driven; hence, they do not necessarily provide sound estimates. Also, these techniques are not applicable when the source code is not available or when the software is tested for the first time.

Objective

We propose and develop the novel notion of fault-based prioritization of test cases which directly utilizes the theoretical knowledge of their fault-detecting ability and the relationships among the test cases and the faults in the prescribed fault model, based on which the test cases are generated.

Method

We demonstrate our approach of fault-based prioritization by applying it to the testing of the implementation of logical expressions against their specifications. We then validate our proposal by an empirical study that evaluates the effectiveness of prioritization techniques using two different metrics.

Results

A theoretically guided fault-based prioritization technique generally outperforms other techniques under study, as assessed by two different metrics. Our empirical results also show that the technique helps to reveal all target faults by executing only about 72% of the prioritized test suite, thereby reducing the effort required in testing.

Conclusions

The fault-based prioritization approach is not only applicable to the instance empirically validated in this paper, but should also be adaptable to other fault-based testing strategies. We also envisage new research directions to be opened up by our work.     

QM基因研究进展

对QM基因的研究进展做了综述,希望为深入开展不同物种QM基因功能研究提供一些参考。     

阿科特素体外处理乳腺癌细胞的基因表达通路分析

近年来有研究表明黑升麻提取物阿科特素具有抗肿瘤活性。但其分子机制仍然不够清楚。研究用基因集富集分析的方法分析了20μg,／mL和40μg／mL两种不同质量浓度的阿科特素处理乳腺癌细胞MDA—MB--4536h或24h后的基因表达谱,获取处理后的乳腺癌细胞中的基因集富集情况．结果表明：处理6h的乳腺癌细胞中没有获得有统计学意义的基因集,而在处理24h的乳腺癌细胞中与细胞分裂、细胞周期等相关的生物学通路则表达下调,40Ixg／mL阿科特素处理还可以使得乳腺癌细胞中大分子降解相关通路表达上调．由于阿科特素可以促进细胞凋亡并抑制细胞周期,为其今后用于乳腺癌的预防和治疗的可能性提供了良好的理论依据．     

新型基因枪微弹材料可行性初步研究-Ⅰ

基因枪在未来临床基因转导中很有前途,但目前所用微弹材料金、钨都属于重金属,其长期存在于人体的安全性尚无法估计。提出用羟基磷灰石(HAP)微粒来代替金或钨微粒,从理论上推导了这种取代的可行性,并报告了一种HAP微粒的制备及其负载DNA的研究结果。理论推导完全按照物理学方法进行。实验部分的方法:将稳定剂H以一定速度和比例滴入一定浓度的Ca(H2PO4)2溶液中,再按照一定的速度和比例滴入Ca(OH)2饱和溶液,期间或完成后超声处理一定时间,将所得HAP微粒溶液与亚精胺和DNA以一定比例和浓度在一定pH条件下混合。结论:所得HAP粒径值符合要求,并且能够高效负载DNA。     

基于SNP基因型谱和表达谱的乳腺癌相关基因网络的构建

拟构建乳腺癌相关基因网络并从系统生物学角度解析乳腺癌发病的分子机制,采用基于SNP基因型谱和乳腺癌基因芯片表达谱数据分别进行全基因组关联分析和差异表达基因的筛选,并以此为基础构建乳腺癌相关基因网络,网络分析结果显示乳腺癌相关基因主要参与代谢、信号传导、蛋白质修饰等功能。该网络能够从系统层面上解释乳腺癌的遗传互作机制,并为研究其它复杂疾病提供一定的理论依据。     

基于Matlab的甲壳动物线粒体DNA的点突变检测方法

近年来对基因突变检测的研究越来越受到人们的重视,很多基因突变仅是由于单碱基替换所致,如何快速简便地进行检测、发现该点突变具有重要意义’。甲壳动物的线粒体基因组蕴含了物种进化历程中重要的遗传信息,针对甲壳动物线粒体基因序列,提出一种基于Matlab的检测基因序列点突变的简单方法。仿真实验证明,该方法对甲壳动物线粒体基因序列的突变检测和突变基因位置的定位是有效可行的。     

基于排序索引矩阵的频繁项集挖掘算法

针对Apriori算法产生候选项集的问题,提出一种基于排序索引矩阵(SIM)的频繁项集挖掘算法.将频繁1-项集形成的1-项集向量依次与对应矩阵相乘,生成频繁2-项集.从频繁3-项集开始,对每次生成的频繁k-项集建立SIM,借助SIM结构实现项集的跨越式搜索和连接.整个过程只需扫描一次数据库,不会产生候选项集.实验结果表明,该算法能提高频繁项集的挖掘效率.     

一种安全的门限盲签名方案

门限签名在电子签名中有着广泛的应用,针对客户端运行能力的不足,结合双线性映射、门限身份、门限盲签名,提出了一种高效安全的门限签名方案。分析表明,方案易于实现,系统的安全性更高,能够满足电子门限签名的需求。     

改进的基因术语间语义相似度计算方法

目前,基于混合方法的相似度计算对影响语义相似度的因素分析不全面。针对这个问题,提出了基于多个影响术语语义相似度度量因素的综合方法。该方法结合语义层次,语义距离和局部语义密度,充分运用本体的语义信息来计算基因术语间的语义相似度。实验结果表明,该方法与人工打分的相关系数更高。