Construction, properties and specific fluorescent labeling of a bovine prothrombin mutant engineered with a free C-terminal cysteine

To define the role of phosphatidylserine-induced conformationalchanges in prothrombin activation during blood coagulation,a recombinant bovine prothrombin was constructed, characterizedand shown to have a globally native-like conformation. We introduceda cysteine to replace the penultimate residue (Gly581) of apreviously constructed active site mutant, and expressed thedouble mutant in Chinese hamster ovary cells at the level of0.6 µg/ml of cell culture medium. Specific labeling withfluorescein maleimide was accomplished by limited reductionwith dithiothreitol to free the engineered cysteine while maintainingthe native-like functional properties of the molecule. The averagestoichiometry of labeling was 0.84 probe/protein. The locationof the probe at the C-terminus was confirmed by proteolysisby native thrombin, by Taipan venom, and by carboxypeptidaseY. Both the double mutant and labeled prothrombin could be activatedby snake venoms and the prothrombinase but, as expected, thedouble mutant meizothrombin did not autolyze as does nativemeizothrombin. Thus, for the first time, a native-like but specificallylabeled prothrombin has been constructed. This molecule willbe an essential tool for elucidating the structural role ofmembranes during prothrombin activation. In addition, the methodsdescribed might be usefully applied to labeling of an odd, engineeredcysteine in other disulfide bond-containing proteins.     

Ontology-based similarity for product information retrieval

Product development of today is becoming increasingly knowledge intensive. Specifically, design teams face considerable challenges in making effective use of increasing amounts of information. In order to support product information retrieval and reuse, one approach is to use case-based reasoning (CBR) in which problems are solved “by using or adapting solutions to old problems.” In CBR, a case includes both a representation of the problem and a solution to that problem. Case-based reasoning uses similarity measures to identify cases which are more relevant to the problem to be solved. However, most non-numeric similarity measures are based on syntactic grounds, which often fail to produce good matches when confronted with the meaning associated to the words they compare. To overcome this limitation, ontologies can be used to produce similarity measures that are based on semantics. This paper presents an ontology-based approach that can determine the similarity between two classes using feature-based similarity measures that replace features with attributes. The proposed approach is evaluated against other existing similarities. Finally, the effectiveness of the proposed approach is illustrated with a case study on product–service–system design problems.     

基于随机游走模型的维基百科语义关系研究

运用随机游走模型提出了一种基于维基百科的语义相关度的计算方法。维基百科中包含了丰富的链接结构,这些链接结构一定程度上能够反应词条之间概念上的相关性,以内容链接和外部链接关系来计算基于维基百科的语义相关度,并在WS-353数据集上进行了实验,取得了较好的准确性。     

基于半监督距离学习的运动相似性度量算法

人体运动捕获技术的发展使得运动捕获数据不断积累,人体运动的检索技术成为运动数据管理和重用过程中的关键环节。由于逻辑相似的运动在数值上并不一定相似,使用欧式距离度量2个运动间的逻辑相似性难以取得理想的结果。为此,提出一种半监督的距离度量学习算法,利用带标记的运动和未标记运动进行训练以得到运动间的马氏距离度量,从而判断2个运动之间的逻辑相似性,实现运动检索。实验结果表明,与现有的大部分检索算法相比,该算法能够得到更高的查询精度,且没有任何人工干预,可应用于自动检索领域。     

一种基于移动用户位置的网络服务推荐方法

伴随着无线通信技术和智能移动终端的快速发展,基于位置的服务(location-based services,简称LBS)以其移动性、实用性、随时性和个性化的特点,在军事、交通、物流等诸多领域得到了广泛的应用,成为最具发展潜力的移动增值业务之一。在一个基于位置的网络服务推荐框架的基础上,给出了一种基于位置的移动用户偏好相似度计算方法,同时证明了其满足近邻相似测度的一般性质;然后,提出一种符合社会学概念的信任值计算方法。把它们应用于基于移动用户位置的网络服务推荐过程中,从而形成了一种基于移动用户位置的网络服务推荐方法。该方法有效地提高了网络服务推荐的准确性和可靠性,同时缓解了推荐过程中可能存在的数据稀疏性以及冷启动问题。最后,通过公开的MIT数据集验证了该推荐方法的准确度和可行性。     

全参考图像质量评价综述

图像质量评价是图像处理领域内一项很有意义的研究课题。客观图像质量评价方法可分为全参考评价方法、半参考评价方法和无参考评价方法, 目前全参考评价方法较为成熟, 而半参考和无参考评价方法则处于初级阶段, 远远达不到参考评价方法所能达到的效果。对全参考评价方法进行综述。首先简要地介绍了各种类型的评价方法, 其次详细地介绍了PSNR、SSIM、MSSIM、IFC、VIF、FSIM等几种典型的全参考图像质量评价方法, 然后在LIVE和TID2008数据库上进行实验, 对这几种全参考方法进行对比、分析, 最后探讨图像质量评价研究的发展趋势。     

面向个性化云服务的动态信任模型

为更好地实践云计算为用户提供廉价按需服务的宗旨,满足服务请求者的个性化需求,提出一种面向个性化云服务的动态信任模型。基于细粒度服务思想定义个性化云服务,通过引入时间衰减因子和建立高效激励机制修正直接信任值,以灰色系统理论为基础计算实体间的评价相似度,并将评价相似度和推荐者的推荐可信度作为合成推荐信任值的重要因素,同时提出一种基于评价相似度的自信因子赋值方法,以提高合成综合信任值的准确性。实验结果表明,与GM-Trust模型及CCIDTM模型相比,该模型的交互成功率分别平均提高了4%和11%。     

基于本体的语义虚拟环境查询与推理模型

当前将本体引入到语义虚拟环境的研究,只是将领域本体的可视化信息用本体表示,并未发挥本体本身具有的优势。为此,提出一种基于本体的语义虚拟环境查询与推理模型。利用OWL语言统一描述虚拟场景图形内容与语义信息,并分别对两者进行查询,在图形内容查询过程中引入本体的推理方法推理出隐含的图形内容信息,然后查询需要的信息。在语义信息查询时引入语义搜索方法,利用基于语义距离计算本体概念相似度的方法计算语义虚拟环境本体中类之间的相似度,搜索与被查询实例语义相似度最大的实例,并借助推理找出其间的关系。对语义虚拟家具商店进行本体的查询与推理,结果证明了该模型的可行性。     

结合项目类别和动态时间加权的协同过滤算法

基于项目的协同过滤算法仅通过计算项目相似性产生推荐结果,忽略了项目类别信息对项目相似性的影响,且未考虑时间因素对推荐结果产生的影响。针对上述问题,引入项目类别相似性、用户兴趣度时间加权函数和项目流行度时间加权函数,提出结合项目类别相似性和动态时间加权的协同过滤推荐算法,包括将项目类别相似性引入到传统项目相似性计算中。分析用户兴趣度和项目受欢迎程度随时间动态变化对推荐结果产生的影响,构造基于时间的用户兴趣度加权函数和基于时间的项目流行度加权函数。实验结果表明,该算法的项目类别特征能够进一步提高项目相似性的精度,动态时间加权函数能够及时反映用户兴趣度和项目受欢迎程度的变化,提高推荐的准确度。     

作战文书关键信息抽取方法*

作战文书关键信息抽取是实现自动标图系统的关键。现有研究多以文书处理流程设计为主,未深入分析军标用法,信息抽取不完整。为完整提取信息,提出了基于分词处理与语义角色标注（SRL）相结合的文书关键信息抽取方法,实验证明方法有效、可行。基于文中方法所设计的信息抽取系统,已在某集团军内推广、应用。