PAHs代谢物对PAHs生物降解的影响作用

分别研究了芽胞杆菌CN2降解蒽产生的代谢物对蒽生物降解的影响和菲产生的代谢物对菲生物降解的影响.试验结果表明:(1)外加蒽(或菲)代谢物,对蒽(或菲)的降解均表现出促进作用.蒽156 h累计去除率可提高3.07%～6.10%,菲60 h累计去除率可提高13.14%～30.35%.(2)在芽胞杆菌CN2作用下,蒽(或菲)生物降解过程能够用一级动力学方程式较准确地描述,外加代谢物可以增大降解反应表观速率常数k值;从不同时段内蒽(或菲)的降解速率看,反应初期0～2 h内,外加代谢物对蒽(或菲)的降解速率提高最为明显,对蒽可提高0.281～1.20 mg/L·h,对菲可提高0.570～1.13 mg/L·h.(3)外加代谢物对蒽(或菲)降解液的pH值有缓冲作用,使降解液的pH值随降解时间下降趋势减缓.     

俄罗斯减压渣油超临界萃取残渣的催化加氢反应研究

以高压反应釜为反应器、环己烷为溶剂,选用分子筛、金属及舍金3大类共6种催化剂,对俄罗斯减压渣油超临界萃取所得残渣的非催化及催化加氢反应进行研究。结果表明,采用NKF-β型和Y型分子筛作为催化剂,残渣加氢反应产物中芳烃的相对含量超过55％;采用金属Fe、Ni以及合金Co—Fe、Pd—C作为催化剂,残渣加氢反应产物中正构烷烃的相对含量超过70％;除采用Fe和Pd—C作为催化剂的残渣加氢反应产物之外,在其他各组产物中均检测到少量含氧化合物,而在以NKF-β型分子筛作为催化剂的加氢反应产物中还检测出含氮化合物。针对各组加氢反应产物中化合物相对含量的差异,推测了残渣在不同类型催化剂作用下可能存在的反应途径。     

煤气废水有机污染物缺氧生物降解性能及机理

为考察煤制气废水3种典型有机污染物(喹啉、吡啶、邻苯二酚)的缺氧生物降解性能及降解途径,利用缺氧驯化污泥作为接种污泥,以硝态氮为电子受体,考察了3种有机物的缺氧降解过程,并利用UV-Vis和GC/MS分析3种物质缺氧降解机理.结果表明:3种污染物对缺氧微生物抑制与毒害作用随初始质量浓度增加而增强;缺氧降解48 h后,剩余底物质量浓度随初始质量浓度增加而增大;3种污染物缺氧生物降解速率常数大小顺序为吡啶邻苯二酚喹啉.缺氧降解中污染物未被完全氧化成CO2和H2O,部分生成了较底物自身降解性更差的中间产物.葡萄糖共基质可以提高难降解污染物缺氧降解性能,且共代谢作用对自身生物降解性差的污染物降解性能的提高更显著.利用UV-Vis和GC/MS分析了污染物缺氧生物降解途径,结果表明,喹啉和吡啶的降解均始于分子羟基化反应.污染物定量结构-生物降解性关系(QSBR)研究表明,3种物质的缺氧降解速率常数Ks与分子连接性指数1Xv和前线最高占据轨道能EHOMO有很好的相关性.     

人工代谢算法在故障诊断中的应用

从生物体新陈代谢的生理机能出发,建立了基于酶催化的人工代谢算法模型．通过对代谢算子功能的 分析提出了模式定理的概念,并证明了算法的收敛性．利用酶与底物相匹配的原理,通过代谢操作找出酶与底物的 最优匹配,从而找出对应故障现象的原因．在寻优过程中,不断地通过凋亡算子将不可能成立的原因筛除,降低了 故障诊断的成本．实例分析表明,该算法能有效地进行故障定位,尽可能地缩小了不必要的搜索空间．     

带退化因子的人工代谢算法在多对象物流配送优化中的应用

在多对象优化的物流配送中,需要对配送对象实行均衡调度。本文提出了一种含退化因子的人工代谢算法。每一种配送对象对应了不同的代谢底物,每一种配送对象的优先级对应了相应的催化酶,每一次配送对应一次代谢过程。为了降低代谢算法的复杂度,完成配送任务后,初始化时形成的催化酶需要有规律地退出代谢体系。通过对代谢算子等参数的分析,为人工酶设立了不同等级的退化因子。根据对酶优先级的辨识,按照代谢优化的进程,使已完成寻优搜索的代谢路径有序地退出本次代谢网络,提高整个代谢网络运行效率,为后续的物流配送路径缩小搜索空间,实现多对象配送过程的优化。     

一种改进的Web日志数据预处理研究

Web习志中包含大量的冗余信息,这给挖掘带来了不便。数据预处理就是处理这些冗余信息,经过数据净化、用户识别、会话识别、路径补全操作后得到能够用于挖掘的数据。本文详细介绍了预处理过程,同时对传统的会话识别算法加以改进。本文提到的实际系统是基于SQL语句的,能够显著缩短预处理时间。     

In Situ Bioorthogonal Metabolic Labeling for Fluorescence Imaging of Virus Infection In Vivo

Optical fluorescence imaging is an important strategy to explore the mechanism of virus–host interaction. However, current fluorescent tag labeling strategies often dampen viral infectivity. The present study explores an in situ fluorescent labeling strategy in order to preserve viral infectivity and precisely monitor viral infection in vivo. In contrast to pre‐labeling strategy, mice are first intranasally infected with azide‐modified H5N1 pseudotype virus (N₃‐H5N1p), followed by injection of dibenzocyclooctyl (DBCO)‐functionalized fluorescence 6 h later. The results show that DBCO dye directly conjugated to N₃‐H5N1p in lung tissues through in vivo bioorthogonal chemistry with high specificity and efficacy. More remarkably, in situ labeling rather than conventional prelabeling strategy effectively preserves viral infectivity and immunogenicity both in vitro and in vivo. Hence, in situ bioorthogonal viral labeling is a promising and reliable strategy for imaging and tracking viral infection in vivo.     

Thermal and cardiovascular strain imposed by motorcycle protective clothing under Australian summer conditions

Motorcycle protective clothing can be uncomfortably hot during summer, and this experiment was designed to evaluate the physiological significance of that burden. Twelve males participated in four, 90-min trials (cycling 30 W) across three environments (25, 30, 35 °C [all 40% relative humidity]). Clothing was modified between full and minimal injury protection. Both ensembles were tested at 25 °C, with only the more protective ensemble investigated at 30 and 35 °C. At 35 °C, auditory canal temperature rose at 0.02 °C min^?1 (SD 0.005), deviating from all other trials (p < 0.05). The thresholds for moderate (>38.5 °C) and profound hyperthermia (>40.0 °C) were predicted to occur within 105 min (SD 20.6) and 180 min (SD 33.0), respectively. Profound hyperthermia might eventuate in ~10 h at 30 °C, but should not occur at 25 °C. These outcomes demonstrate a need to enhance the heat dissipation capabilities of motorcycle clothing designed for summer use in hot climates, but without compromising impact protection.

Practitioner’s Summary:

Motorcycle protective clothing can be uncomfortably hot during summer. This experiment was designed to evaluate the physiological significance of this burden across climatic states. In the heat, moderate (>38.5 °C) and profound hyperthermia (>40.0 °C) were predicted to occur within 105 and 180 min, respectively.     

一种由代谢方程构建网络的方法及其实现

代谢网络的拓扑结构分析和可视化是系统生物学研究的热点。如何自动合理地由数量众多的代谢方程构建代谢网络是研究者首先面临的问题。基于二部图模型,采用节点唯一化和忽略高度节点策略,提出一种由代谢方程直接构建代谢网络的方法,并给出MATLAB实现步骤,最后使用生物网络模拟软件可视化生成的代谢网络,结果表明这种方法能用来构建复杂代谢网络,并具有较好展现网络模块和拓扑结构的特点,适用于由大量代谢反应方程自动构建复杂代谢网络的一般应用需求。该方法的MATLAB源码和说明文档可以通过http://bioinf.jiangnan.edu.cn/在线获得。