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针对生物信息分析中基因短序列比对任务计算耗时长的问题,采用Spark平台、RDD数据集以及分布式文件系统HDFS设计了一种分布式计算模型。采用分而治之的策略将庞大的计算任务分割为多个互不重叠的小任务在分布式集群上并行执行。通过基于位置偏移量等分的数据分区算法实现数据的分发;通过将基因短序列封装入RDD数据集的方法实现了短序列的逐条处理;通过将基因比对算法传入RDD的Map函数的方法实现了基因序列的比对。计算模型的实现使得串行比对算法在分布式集群上可扩展,并显著降低了计算耗时,计算结果可与后续的生物信息分析工作相兼容。实验结果证明计算模型具有较好的稳定性和可扩展性,在Spark集群上取得了优秀的加速比。 相似文献
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以海藻酸钠(SA)为包埋剂、CaCl_2为交联剂对耐盐菌株进行固定化,并用于处理高盐废水。结果表明,单因素实验得到的优化条件为:SA和CaCl_2的质量分数分别为2%和2%,进水COD为8 g/L,包埋剂pH为7,包埋量2.5 g/L,进水盐度3%,交联时间24 h。Plackett-Burman实验设计得到影响固定化菌株处理高盐废水的显著因素为包埋量、进水COD以及SA含量。Box-Behnken设计-响应面法运用二次方程对实验数据进行拟合确定优化条件为:包埋量2.33 g/L,进水COD为7.957 g/L,SA的质量分数1.94%,且三者之间交互影响明显,固定化耐盐菌颗粒处理废水效率可达72.45%。 相似文献
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冯晓龙 《计算机应用与软件》2014,(9)
随机微分方程被广泛地应用在生物的各个领域。通常情况下,随机种群模型很难找到解析解,因而数值模拟是研究这类模型数值解的一个有效的工具。为此,运用MATLAB软件,对随机两种群模型和带Markovian转换的随机种群模型进行数值模拟,展示数值模拟的过程,从而给出MATLAB软件求解这类数值模拟的一般方法。 相似文献
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膳食对居民营养健康、资源环境有着深远的影响,推动中国居民可持续健康膳食发展,对支持实现“健康中国”和可持续发展目标、保障国家粮食安全有着重要意义。本文系统梳理了可持续健康膳食的概念形成过程、代表性的可持续健康膳食模式,进一步从营养健康、资源环境、社会经济的角度阐明了可持续健康膳食的国际共识;分析了中国居民膳食现状,重点讨论了膳食相关的营养健康问题、膳食结构改变带来的资源环境问题。研究建议,提出膳食可持续健康优化方案、精确指导各地居民饮食,多措并举干预引导膳食转变、培养居民可持续健康食物消费行为,坚持生产和消费协同发展、构建可持续健康膳食供给体系,以此积极应对日益严峻的居民营养失衡与环境退化双重挑战,完善国家食物政策制定导向。 相似文献
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以建筑工程招标文件中涉及到的三种情况为切入点,对其展开剖析,识别出投标人的投标策略机会点,并在此基础上提出合理的备选方案,试图为投标人在对建筑工程进行多方案报价投标策略的制定上提供借鉴,提高投标人的投标中标率。 相似文献
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目的通过测定导电涂层电阻率来确定导电墨水的最佳制备工艺参数。方法以醋酸铜为前驱体,N,N-二甲基乙醇胺为络合剂,甲酸为还原剂,制备导电性高的铜基无颗粒型导电墨水。采用化学还原法制备铜基无颗粒型导电墨水,通过正交实验研究烧结温度、烧结时间以及Cu2+∶H+∶NH4+的比例对涂层导电性的影响,确定最佳的制备工艺。结果制备的铜基无颗粒型导电墨水在弱碱性环境下较稳定,墨水中的Cu2+,H+,NH4+的最佳物质的量之比为1∶3∶3。该配方的墨水具有很高的稳定性能和导电性能,在玻璃基材上滴涂经160℃下热处理30 min,得到的涂层电阻率仅为0.18μ?·m。结论初步实现了铜基无颗粒型导电墨水的低温烧结。 相似文献
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当前网络游戏面临的一个问题是如何将游戏的更新内容分发给所有的用户,一般而言,游戏的更新内容包括漏洞修复,安全性提高,外挂防护,平衡性调整以及新游戏内容等。为了维护游戏良好的生命周期,一款运行良好的网络游戏常规更新频率一般为一周一次。通常游戏运营商会利用P2P方式来发布游戏补丁,但仍然无法解决游戏更新发布的一瞬间会有大量的用户涌入服务器造成的高带宽消耗。本文通过分析旋风下载组件的下载数据,设计一种提前推送补丁的系统,在不影响用户下载体验的情况下,可以有效降低游戏更新发布时峰值带宽,并在实际运营环境中得到了验证。 相似文献
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为进行剂量率切换辐照加速方法适用性的数值评估,基于定量损伤物理模型和剂量率切换加速方法实验测试条件,以氢浓度、初始缺陷浓度和温度为变量,对金属绝缘层半导体(Metal insulator semiconductor,MIS)结构进行了系统的数值模拟。结果表明,剂量率切换辐照加速方法的适用性对双极器件氧化层内的氢浓度及缺陷浓度有很强的依赖。因此,剂量率切换加速方法的实验可能对部分器件和电路不再适用。 相似文献