病毒宏基因组学在医学领域的应用

新发、再发病毒性传染病不断出现,如何快速鉴别致病病原显得尤其重要。近年来,不依赖传统培养技术的病毒宏基因组学在临床医学的运用越来越广泛。大量成功诊断的临床病例和新病毒的发现为病毒宏基因组在传染病的预防和公共卫生防控方面开拓了新的领域。本文主要对近10年来病毒宏基因组的兴起、优势及策略、在临床检测及公共卫生领域的应用进展作一综述。     

生产过程中Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗的灭活效果验证

目的 对Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(Sabin inactivated poliovirus vaccine,sIPV)在生产过程中的灭活效果进行验证及评价.方法 分别制备Sabin株Ⅰ、Ⅱ及Ⅲ型脊髓灰质炎病毒连续5批纯化液,加入终浓度为92.5 μg/mL的甲醛,37℃灭活12d.收集灭活前(0 d)及灭活1～6...     

肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型VP1蛋白在人支气管上皮细胞中对天然免疫相关信号分子的表达及T细胞免疫反应的影响

目的探讨肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsakievirus A 16,CA16)VP1蛋白在人支气管上皮细胞中对天然免疫相关信号分子的表达及T细胞免疫反应的影响。方法经RT-PCR法扩增EV71和CA16的VP1序列,插入至载体pcDNA3. 1(+),构建重组真核表达质粒pcDNA-EV71-VP1和pcDNA-CA16-VP1。分别转染人支气管上皮细胞16HBE,于转染后24、48和72 h收集样本,进行细胞内天然免疫相关信号分子表达的检测和刺激T细胞增殖的检测。结果经双酶切及测序鉴定,重组真核表达质粒pcDNA-EV71-VP1和pcDNA-CA16-VP1构建正确。与阴性对照组比较,EV71-VP1组IFNγ、OX40L、RANKL、TNF-α和IL-2的水平上调,而CA16-VP1组的上调幅度较小。EV71-VP1及CA16-VP1组16HBE细胞的胞内外提取物均可明显刺激分泌IFNγ的T细胞增殖(P 0. 05)。结论 EV71和CA16 VP1蛋白在人上皮细胞16HBE中表达后,可差异性诱导细胞中天然免疫信号分子表达及相似的非特异性刺激T细胞增殖能力。     

云南省1株柯萨奇病毒A组8型分离株全基因组分析

目的 分析柯萨奇病毒A组8型（Coxsackievirus A8,CVA8）云南分离株A8-1/YN/CHN/2019全基因组序列及其遗传特性,以期了解CVA8的流行和变异情况。方法 设计针对CVA8的引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增VP1序列并测序,BioEdit 7.2.3拼接得到全基因组,使用MEGA 7.0软件进行系统进化分析,应用Simplot 3.5.1及RDP4软件进行重组分析。结果 A8-1/YN/CHN/2019株长7 396 nt,编码2 188个氨基酸。其VP1与CVA8原型株AF081299/Donovan/USA/1998核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为81.04%和95.24%;A8-1/YN/CHN/2019株属于基因型E,其他中国分离株位于D和E型。重组分析发现A8-1/YN/CHN/2019株在非结构编码区的P2和P3段上发生重组。结论 A8-1/YN/CHN/2019株为E基因型,并在P2、P3段的非结构区发生了重组事件。     

腮腺炎减毒活疫苗（F-基因型）免疫血清中和抗体效价与特异性IgG浓度的比较分析

目的 对腮腺炎减毒活疫苗(F-基因型)免疫血清中和抗体效价及特异性IgG浓度进行比较分析，评价二者作为相互验证指标的可能性。方法 选取194份人免疫血清，包括疫苗组98份[腮腺炎减毒活疫苗(F-基因型)，免疫前后各49份]和安慰剂组96份(不含腮腺炎病毒，其他成分与疫苗组相同，免疫前后各48份)，采用ELISA法和中和试验分别检测血清腮腺炎病毒特异性IgG浓度和中和抗体效价，并对两个指标的检测结果进行比较。以中和抗体效价为纵坐标，IgG浓度为横坐标绘制散点图，通过逻辑回归分析二者的相关性。以中和抗体效价为标准采用ROC曲线对各组特异性IgG浓度进行分析，评价以特异性IgG浓度判定中和抗体阳转的可靠性。结果 安慰剂组免疫前血清特异性IgG浓度(t=-0.977,P> 0.05)及中和抗体效价与免疫后比较，差异均无统计学意义(Z=-1.405,P> 0.05)，疫苗组免疫后血清特异性IgG浓度(t=-9.959,P <0.001)及中和抗体效价(Z=-5.696,P <0.001)均明显高于免疫前。安慰剂组免疫前后及疫苗组免疫前IgG阳转率均明显高于相应中和抗体阳转...