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该研究主要是通过计算机模拟,从食品来源蛋白质中预测筛选具有蛋白酶激活受体2(Protease Activated Receptor 2,PAR2)抑制作用的生物活性肽,同时预测食用藻类蛋白质酶解后所得的肽段的生物活性、水溶性等理化指标。首先,利用NCBI数据库和蛋白质晶体数据库(Protein Data Bank,PDB)比对选择食用藻类蛋白质,其次通过BIOPEP-UWM数据库模拟酶解,Peptide Ranker进行活性分析,Innovagen和Toxin Pred预测高活性肽,最后采用HPEPDOCK将获得的活性评分超过0.5、水溶性优且无毒的小分子活性肽与PAR2进行分子对接模拟,以探究两者之间的分子结合能力,进而分析判别不同小分子活性肽抑制PAR2活力的潜力和机制。结果表明,小分子寡肽PAGR(-165.80)、PAR(-163.93)、IDQW(-152.95)、DISAW(-154.48)与PAR2具有较高的结合分数,是PAR2潜在的活性抑制肽。该研究旨为藻类蛋白的开发利用以及PAR2抑制剂的挖掘研究提供参考。 相似文献
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高校图书馆服务工作的模糊分析高立芳,周漫红(东北电力学院基础教学部吉林132012)(吉林大学长春130023)优质服务,最大限度地提高藏书的利用率,这是图书馆工作的最终目的。作为高校图书馆,它的主要任务是为教学和科研服务,以满足教学和科研需要为宗旨... 相似文献
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兼具糖尿病的新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)患者病死率明显偏高,抑制Ⅱ型糖尿病关键酶二肽基肽酶4(DPP-IV)和新冠肺炎病毒主蛋白酶(SARS-CoV-2 Mpro)的活性能缓解相应的病症。该研究采用UniProt、NCBI和PDB数据库检索纳豆蛋白,基于BIOPBP-UWM数据库开展计算机模拟胃肠道蛋白酶(胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶)水解纳豆蛋白的研究,最后利用分子对接技术分别研究纳豆蛋白源多肽与DPP-IV和SARS-CoV-2 Mpro的结合能力,分析参与相互作用的氨基酸残基与分子作用力类型。结果发现,糖转运蛋白与两种酶具有良好的结合效果。特别地,序列为ISQPR、TIPVR和STVTR的多肽对两种酶都具有较高的结合分数(≤-130),被鉴定为DPP-IV和SARS-CoV-2 Mpro的双重抑制肽。因此,纳豆蛋白具有缓解Ⅱ型糖尿病病症和作为新型冠状病毒感染病人营养补充剂的潜力。 相似文献
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