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目的:本研究旨在利用生物信息学筛选胃癌的特征基因,探索胃癌的恶性机制。方法:通过GEO数据库筛选胃癌相关基因芯片作为训练集,并利用GEO2R工具分析胃癌组织相较于正常组织的差异基因,进而在验证集患者中对所筛选基因进行验证;采用String数据库计算其蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。根据Cytoscape软件的Centiscape等插件分析PPI网络中的关键节点,分析蛋白相互作用相关性;并利用DAVID数据库对差异基因和PPI关键模块基因进行基因功能富集及注释。随后对关键节点基因进行生存分析。结果:所筛选出的63个特征差异基因对胃癌与正常组织区分度良好,主要参与调控细胞外基质受体相互作用、PI3K-AKT信号通路等。PPI网络中关键节点调控肿瘤增殖、转移。对关键节点基因进行生存性分析发现,ITGB1、COL1A2表达高的患者,其生存率远低于低表达患者(P<0.05)。结论:本文可为寻找胃癌发生发展的关键基因,探索胃癌治疗新靶点提供一定的理论依据。 相似文献
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目的:通过分析近端与远端结直肠癌的差异基因集和其集中的关键通路,区分不同部位结肠癌的分子表达特征基因谱。方法: 利用GEO数据库中高通量基因芯片数据筛选出具有结肠癌患者肿瘤部位近远端信息的芯片。采用GO基因功能注释和KEGG通路富集分析,筛选出可表征远端与近端结肠癌生物特性的特征基因簇和通路,并进行蛋白质相互作用网络可视化分析。结果:经差异基因分析后,发现不同部位结肠癌基因表达具有显著差异,且主要存在于一些重要的肿瘤相关信号通路,如Wnt信号通路,细胞外基质相关通路和免疫调控通路等。结论:本文利用生物信息学方法,从多种角度定义了近端和远端结肠癌的差异分子表达特征,为结肠癌的精准治疗提供理论依据。 相似文献
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为有效进行大数据量单基因扰动的生物学实验,基于自适应灰关联聚类算法,提出一个并行自适应灰关联聚类算法,并行处理大数据量的单基因扰动,并建立相应的基因调控网络.计算结果表明,该并行算法具有很好的并行性能. 相似文献
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目的:根据厄洛替尼群体药动学(PPK)模型,应用蒙特卡洛模拟(MCS)评价肿瘤患者厄洛替尼漏服及补服方案。方法:根据厄洛替尼PPK模型,以口服150 mg qd为给药方案,应用非线性混合效应动力学模型(NONMEM)软件对患者漏服及不同时间段补服方案(6 h,12 h,18 h,24 h双倍剂量补服)进行10 000次MCS,计算漏服及补服方案下个体治疗窗(ITW)外人群比例和ITW外持续时间(>5%人群),评估各场景下补服方案的合理性。结果:患者漏服厄洛替尼时,血药浓度持续下降至下次用药时间,且影响次日的血药浓度,ITW以下持续时间分别为25.1 h和6.6 h;随着补服时间的延长,ITW以下人群比例从6.82%增加到14.55%,持续时间从5.9 h增加到23.6 h;ITW以上人群比例从5.99%增加到10.74%,持续时间从3.7 h增加到9.7 h。结论:根据MCS结果,患者应提高厄洛替尼用药依从性,避免漏服。一旦出现漏服,可考虑尽快补服,但不建议接近下次给药时间时进行补服或加倍剂量补服,以免增加药物不良反应。 相似文献
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在高水头电站中,为满足技术供水水压的要求,经常采取多种减压措施,而利用可调式射流泵进行减压的技术供水系统,在国内还较为少见.文中结合越南儒桂水电站,采用可调式射流泵技术供水方式,介绍了其技术供水自动控制系统的构成、具体实现及控制策略.实验和实践验证了该方法的有效性、可行性及经济性,为高水头水电站技术供水提供了一种新的可行方法. 相似文献
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