基因芯片及其应用

基因芯片技术作为一种新的技术平台 ,已广泛地应用于生命科学研究的领域 ,如基因表达分析、单核苷酸多态性分析、基因突变检测及临床诊断等。随着该技术的不断完善 ,它将在生命科学研究中发挥越来越重要的作用。就基因芯片技术基本原理、分类、检测过程、存在的问题、研究进展和应用作一介绍。     

寡核苷酸自动合成试剂的研究进展

主要介绍近几年来核酸自动化固相合成试剂的研究进展。     

基因芯片技术研究进展

基因芯片是近年出现的一种高通量,快速、平行核酸序列测定及定量分析技术。它是将大量特定序列的核酸片段有序地固定在载体上,与标记酸分子进行杂交,检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的组成及数量,目前广泛应用于疾病的基因民,基因表达研究,基因组研究,药物筛选等领域,影响着生命科学许多领域的研究民途径。本文讨论了基因芯片技术应用的最近进展及存在的问题。     

一种具有高度可验证性的微阵列片间校准算法

由于系统偏差的存在,多微阵列数据之间在进行差异比较分析前,首先需要进行片间校准,使不同微阵列的探针数据处于同一可比较的水平。目前片间校准算法的准确性依赖于看家基因表达水平的不变性,或者探针数据统计分布的稳定性。这些假设条件并非在所有条件下成立,如需要进一步实验验证,其算法的正确性又难以进行实验验证。本文提出一种具有高度实验可验证性的多微阵列数据校准的遗传选择优化方法。基于该方法所得到的优化校准基准子集,可以在仅假设少数看家基因表达水平不变的情况下,在不牺牲校准精度的前提下,完成多微阵列数据的片间校准,从而使得通过实验验证片间校准算法的正确性成为可能。     

直接输注电喷雾电离四极杆飞行时间质谱在十六种中药来源化合物定性分析中的应用(英文)

采用直接输注电喷雾电离质谱对十六种中药来源的化合物进行了分析。观察了它们的电喷雾电离质谱和串联质谱特征 ,以了解不同结构化合物的电离能力和裂解特点。观察表明 :为使样品成分尽可能多地被检测 ,必须同时进行正负两种模式的分析。化合物结构中羰基的存在似有利于化合物在正离子模式下形成准分子离子或其它分子加和离子。当采样锥电压为 3 0 V时 ,大多数化合物能形成准分子离子或其它分子加和离子。但改变采样锥电压似不能完全避免源内裂解。建议分析时同时考察不同采样锥电压 (如 1 0 V、3 0 V和 5 0 V)。串联质谱分析被证明是获得进一步结构信息的有效手段 ,因为对于所有被观察的准分子离子和其它分子加和离子 ,均能在串联质谱分析中检测到碎片离子。本研究在四物汤的研究中已经成功地运用了该方法。此方法有助于中药混合物中样品成分的快速定性分析     

细胞周期调控与细胞抗辐射能力

电离辐射作用后的细胞能够启动多种信号通路，用于维持基因组的完整性。其中细胞周期调控是决定细胞抗辐射能力的一个重要因素。由电离辐射诱导的DNA损伤能最终使细胞周期产生暂时的阻滞，以利于一部分DNA损伤得到修复；或者产生不可逆的细胞周期阻滞，使细胞走向凋亡或坏死。因此，恰当的细胞周期阻滞会给DNA损伤修复提供一定的时间，从而有利于细胞生存。对该领域的深入研究，将会为研制辐射增敏剂和辐射防护剂提供一种新的思路。     

靶向MDM2反义寡核苷酸增强肺癌细胞A549的辐射敏感性

放射治疗在肺癌的治疗中起着重要的作用。然而，提高肺癌的治愈率是一个重要的课题。MDM2基因在肿瘤的形成和增殖过程中起着重要的作用，可能是一个重要的靶基因。本研究自行设计了针对MDM2的反义核酸药物，通过RT-PCR和Western blotting检测其抑制效率，然后通过流式细胞仪观察转染细胞受5Gy照射后的细胞死亡情况，MTT观察细胞照射后的增殖能力。结果发现通过反义治疗的策略成功降低了MDM2在肺癌细胞中A549中的表达，这导致了A549细胞辐射敏感性的增加。表明MDM2参与了A549的辐射抗性的形成，靶向MDM2的反义寡核苷酸可以增强肺癌细胞A549的辐射敏感性。     

基于广义高斯分布模型的基因芯片图像去噪

基因芯片图像去噪是基因芯片应用过程中一个非常重要的步骤,对于芯片数据处理和信息提取具有重要意义.用广义高斯分布对芯片图像子带的小波系数进行建模,在此基础上运用Bayes Shrink法对图像进行小波去噪.实验结果表明,这种方法能够在有效去除基因芯片图像噪声的同时,很好的保持图像的边缘,与其它几种去噪方法相比,不仅提高了去噪后图像的信噪比(SNR)和均方误差(MSE),而且使图像更加清晰,为芯片数据进一步的分析处理奠定了基础.     

激光制备PMMA基PCR微流控芯片的热压键合研究

MEMS技术的发展,使得PCR微流控芯片的制备成为了现实。本文采用波长248nm的准分子激光作为一种新型的微加工方法,在19KV电压和18mm/min的激光优化加工参数下,在40mm×63mm的PMMA基片上制备出了20个循环的PCR微流控芯片。芯片上微通道的宽为104μm,深为56μm,长为1040mm,芯片加工耗时57分钟。随后采用自己搭建的热压装置,定量讨论了热压键合的温度、压力和时间对芯片键合质量的影响,得出了PMMA基微流控芯片热压键合的最佳参数:95℃,160N,20min。并在该条件下成功地将PMMA基的20个循环的PCR微流控芯片和相同尺寸的盖片键合在一起,键合后的芯片具有良好的密封性,能够承受的最大压强为0.85Mpa,能满足进行PCR反应的要求。