红葱中小分子化合物对透明质酸酶的分子对接研究

鸢尾科植物红葱是我国西南地区民间药用植物。由于红葱化学成分分离纯化及鉴定方面的原因,妨碍了红葱药理学研究的深入。本文基于文献收集到的已知化学结构的39种红葱化学成分,利用分子模拟对接软件AutoDock 4.2,以分子对接结合自由能为标准,评价红葱化学成分与透明质酸酶（HAase）间的相互作用,从中筛选出HAase抑制剂,同时采用Elson-Morgan改良法测定红葱不同极性提取物对HAase活性的影响。实验中筛选出10个与HAase结合较好的化合物,其中化合物37,33的对接结合能最低,分别为-7.73和-7.72 kcal/mol,提示其可能具有较强的HAase抑制活性。实验结果显示HAase分子中氨基酸残基TYR75、ASN37和GLU131是化合物与酶形成氢键的重要作用位点。酶活性测定实验显示红葱不同极性提取物对HAase有一定的抑制作用。本研究结果为进一步探讨红葱化学成分对HAase活性的影响提供了参考依据。     

苯甲酸及其类似物与酪氨酸酶分子对接研究

以AutoDock 4.2和iGEMDOCK 2.1分子对接软件对13 种苯甲酸类似物与酪氨酸酶进行模拟对接研究,探讨苯甲酸类似物对接结合自由能与实验测得的酶抑制活性的关系,并对分子对接结果进行分析。结果表明：AutoDock 4.2程序中Cu电荷数的设置对结合自由能有显著影响,铜电荷数为2.0时,苯甲酸类似物结合自由能和pIC50（－lgIC50）线性相关系数可达0.803 6。iGEMDOCK 2.1预测苯甲酸类似物的结果线性较差,即AutoDock 4.2较iGEMDOCK 2.1预测酪氨酸酶抑制剂的可靠性更高。