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多序列比对被称为NP完全问题,是生物信息中最基本的问题之一.目前,广泛使用剖面隐马尔可夫模型解决多序列比对问题.作者在粒子群优化算法的基础上,提出了将量子粒子群优化算法用于剖面隐马尔可夫模型的训练过程,进而构建了一种基于剖面隐马氏模型和量子粒子群优化算法的多序列比对算法.从核酸序列和BaliBASE比对数据库中选取了一些比对例子进行了模拟实验,并与其他算法进行了比较,结果表明,所提出的算法能在有限的时间内不仅能找到理想的隐隐马尔可夫模型,而且能得到最优的比对结果. 相似文献
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蛋白质结构预测,作为计算生物学基本问题之一,是个典型的NP难解问题.研究表明合理运用算法,借助物理模型,可用于预测蛋白质结构.Toy模型就是较为简单的类,其势能最低状态的确定则为结构预测的关键所在.量子粒子群算法是典型的智能优化算法,己广泛应用于多种系统寻优问题中.本篇文章提出使用1种改进的量子粒子群优化算法,并结合Toy模型,进行蛋白质结构预测.算法的改进在于对每次迭代的粒子,排序之后将种群分成精英子群、开采子群和勘探子群来区别处理,并通过实验进行运算和预测.结果表明运用改进的量子粒子群优化算法来进行蛋自质折叠结构预测是可行的且高效的. 相似文献
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针对基于粒子群优化的聚类算法容易陷入局部最优值的缺点,提出将量子行为粒子群优化应用于基因表达数据的聚类分析问题中。在新的聚类算法中采用了对粒子群的多样性控制,以提高算法的全局收敛性能;此外还在新算法中引入了类似于K均值聚类的操作步骤,用以提高算法整体的收敛速度。选择Rand指数和Silhouette指数作为聚类评价标准,对5个人工和实际的基因表达数据集合进行聚类实验分析表明,新算法和基于粒子群优化的聚类算法相比,具有较快的收敛速度,粒子多样性的控制能有效改善算法的全局收敛性能。和其他一些常用的聚类算法比较,也能够获得更好的聚类评价,聚类效果更好。 相似文献
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李成渊 《电子制作.电脑维护与应用》2015,(8)
在信息网络技术告诉发展的今天,高新科技促进了生产力的提高,也给人们的思维方式、工作方式和生活方式带来一定的转变。校园智慧卡系统是现代化校园内部管理的重要组成。它以非接触式IC卡为信息载体,以IC卡读写机器为信息交换装置。通过在该系统中使用RFID技术,以计算机和通信技术为手段,将校园内的各项设施链接成为一个有机的整体,通过一张射频卡便可实现学校内的学员入学注册、人员辨识、工作记录、汽车管理、会务考勤、书籍还借、消费管理等智慧卡功能。 相似文献
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目前,大数据已经成为我国重要的基础性战略资源,相关研究蓬勃兴起.本文首先以中国知网数据库收录的国内大数据研究文献为例,对2011—2020年国内大数据研究的文献数量、核心期刊、权威机构进行计量与分析;其次,运用中国知网可视化软件,对大数据研究的主题热点及其演变历程进行可视化分析.结果表明,大数据研究仍将成为我国重点研究... 相似文献
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李成渊 《网络安全技术与应用》2015,(3):68-70
在信息网络技术高速发展的今天,高新科技促进了生产力的提高,也给人们的思维方式、工作方式和生活方式带来一定的转变。校园一卡通系统是现代化校园内部管理的重要组成。它以非接触式射频识别卡作为信息载体,以读写器作为为信息交换装置。通过在该系统中使用RFID技术,以计算机和通信技术为手段,将校园内的各项设施链接成为一个有机的整体,通过一张智能卡便可实现学校内的学员入学注册、身份识别、考勤管理、车辆出入、会议签到、图书借阅、物品领用、消费管理等一系列功能。 相似文献
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嗜热古细菌和常温古细菌的氨基酰-tRNA合成酶在生物合成蛋白质中都起着至关重要的作用,它们的功能相似而耐热性相差很大。为了阐明氨基酰-tRNA合成酶的耐热机制,本文从进化角度研究了具有全基因组的8种超高温古细菌、3种高温古细菌和2种常温古细菌的Val-tRNA合成酶耐热性的差异。从构建的进化树可知,不同的微生物依据其耐热性而严格的分开;进化关系较近的4种微生物,都是产甲烷的古细菌;序列比对结果表明,耐热Val-tRNA合成酶中的带电荷氨基酸随着进化,突变为疏水性氨基酸,表明常温Val-tRNA合成酶中缺乏像耐热Val-tRNA合成酶中形成盐桥的氨基酸。这表明盐桥是氨基酰-tRNA合成酶耐热的主要因素。 相似文献
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