基于计算机模拟探究鱼类烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶源活性肽抗运动疲劳的功效

为了研究鱼类烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶（Nicotinamide Adenine Dinucleotide Dehydrogenase,NADH Dehydrogenase）源活性肽抗运动疲劳的功效,该研究利用计算机模拟水解5种我国常见鱼类中的NADH Dehydrogenase蛋白亚基,将模拟水解得到的寡肽与乳酸脱氢酶（Lactate Dehydrogenase,LDH）、肌酸激酶（Creatine Kinase,CK）分别进行分子对接,确定与LDH和CK具有超高亲和力的寡肽（对接分数≤-160）,并利用Pymol、Ligplot+软件分析寡肽与LDH和CK分子间相互作用机制。结果显示,5种鱼类的7种不同NADH Dehydrogenase蛋白亚基经计算机模拟水解和分子对接后共获得72个超高亲和力寡肽,其中,与LDH、CK均具有超高亲和力的寡肽共36种,对接分数最高且出现次数最多的寡肽是PTIW（-198.762、-204.400）。研究结果为提升鱼类蛋白质的高值化利用以及开发抗疲劳功能食品提供理论参考。