基于Illumina PE300高通量测序的海南糟粕醋微生物多样性分析

目的 研究海南糟粕醋中微生物的多样性,分析海南糟粕醋在自然条件下贮藏时的优势菌及风险菌。方法 采用Illumina PE300高通量测序技术对海南糟粕醋中细菌和真菌群落进行多样性分析,扩增糟粕醋中细菌的16S rDNA和真菌的ITS序列。结果 细菌多样性测序获得306,600条序列, 130,745,424碱基(base pair, bp),505操作分类单元(operational taxonomic units, OTU),可归属为23门(phylum)、51纲(class)、115目(order)、191科(family)、312属(genus)、432种(species);真菌多样性测序获得612,015条序列, 132,784,567 bp, 27 OTU,可归属为3 phylum、7 class、12 order、18 family、24 genus、25 species。糟粕醋在自然条件下贮藏时,主要细菌属为:乳酸菌属(Lactobacillus)、棒杆菌属(Corynebacteriums)、乳酪短杆菌属(Brevibacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、...     

应用Illumina MiSeq测序解析O3-BAC水处理技术生产饮用水中细菌多样性

采用切向流超滤技术(TFF)大量富集浓缩饮用水,提取其基因组DNA,扩增16SrDNA片段的V4+V5区,共获得45 093条序列,序列平均长度395.65bp,经高通量测序和物种注释、评估、组成分析、β-多样性分析、物种差异分析、RDA分析等进行生物信息学分析,获得饮用水中细菌多样性组成及丰度信息。结果发现,饮用水中可能含有的细菌多样性具有不确定性和随机性,对其影响最大的水质指标为浊度和余氯,经Illumina MiSeq高通量测序获得基因信息的细菌可能存在无活性或者处于VBNC状态的可能,难以采用纯培养方式培养,Illumina MiSeq高通量测序可作为饮用水细菌分析的前置技术加以推广和应用。     

延长扎啤保藏时间的研究

对以山梨酸钾、Nisin、尼泊金庚酯为复合添加剂延长扎啤保藏时间做了研究。最后确定的复合添加剂最佳添加量为山梨酸钾添加量为0.25 g/L、Nisin添加量为0.35 g/L、尼泊金庚酯添加量为0.10 g/L。结果表明,在该条件下可使扎啤的保藏时间至少延长4 d以上。     

木耳保健饮品的研制

主要对木耳保健饮品进行研究，采用生物酶解技术、超声波破壁技术以及传统饮料生产工艺，将木耳中具有抗癌作用的木耳多糖、有益的胶质、纤维素等成分最大程度地溶出，并采用合理的技术将其最大限度地保留于饮料中，利用木耳多糖的降糖、抗癌、抗衰老、增强造血功能以及防止动脉硬化等作用，通过科学的调配，研制一种营养丰富、口感良好、吸收完全、具有保健功能的木耳保健饮品。     

纯天然西瓜汁生产工艺研究

研究采用新式的杀菌工艺,用低压低温杀菌(65℃、0.095MPa、沸腾状态7min)氮气回充的方式对纯天然西瓜汁进行杀菌处理,经过处理的西瓜汁在少氧的状态下进行杀菌,不仅极大地使维生素和其他有益成分得以保留,保证很好的色泽,而且达到了很好的杀菌效果。在杀菌过程中原有加热杀菌工艺中不可避免的加热煮熟气味得到很好的避免和去除,西瓜汁原有风味得到很好的保持,回充氮气防止了西瓜汁中易氧化成分的损失,抑制残留微生物的生长繁殖。在不添加任何食品添加剂的情况下,西瓜汁的贮存期可以达到12个月,达到了工业生产和商品货架期的要求。     

筛选降解豆粕的菌株及其发酵条件优化

筛选了降解豆粕的优良菌株黑曲霉X03.通过正交试验确定了其固态发酵的最佳水解条件.结果表明:在发酵温度31℃、粉碎后豆粕粒径为1.0 mm、小麦粉添加量10％、接种量为4％、自然pH条件下发酵48 h,发酵豆粕大豆肽转化率可达63.5％.     

纳豆发酵型饮料的研制

以大豆为原料进行发酵并以其发酵液为主体经各类物质调配生产纳豆发酵型饮料。最佳发酵条件为:接种量2%、发酵温度35℃、发酵时间18h,在此条件下产酶量达到228IU/ml;饮料最佳配方为:发酵液25%、柠檬酸0.05%、白砂糖4%、β-环糊精0.08%,在此条件下获得了口感良好并含有纳豆发酵营养产物的饮料。     

龙麦26面条预混粉配方优化

采用响应面法对以龙麦26高筋小麦粉为主要原料的面条预混粉配方进行优化。以成品面条断条率、拉伸比及感官等为考察指标,对龙麦26面条预混粉的品质进行综合评分。试验获得龙麦26面条预混粉的配方为:龙麦26小麦粉71.23%,低筋粉26.25%,复合面条改良剂1.55%,食盐0.97%。采用此配方制作的面条预混粉每100g只需添加20℃左右水22g,经和面机高速搅打10min,即可压制出表面光滑,筋性适中,煮后口感爽滑,韧弹性良好的面条。     

利用Illumina高通量测序技术筛选低温降解玉米秸秆真菌

玉米秸秆及根际土壤中纤维素降解菌资源丰富,本研究旨在分析其真菌群落结构及低温纤维素降解真菌的筛选。采集玉米秸秆及根际土壤,利用高通量测序方法对其中的真菌群落结构进行生物信息学分析,以羧甲基纤维素钠为唯一碳源,筛选低温纤维素降解真菌并通过ITS测序进行菌种鉴定。结果表明,对玉米秸秆及秸秆根部土壤测序共获得20715913 bp,共拼接成82250个基因片段,平均长度为249.29 bp,其中共发现5个真菌门,确定共有的优势菌属为Guehomyce;通过在15 ℃低温筛选、比较0、5、10、15 ℃低温下经刚果红染色产生的透明圈与菌落直径的比值得到3株产酶能力较强的纤维素降解真菌,分别为FB1、FB7、FB8。结合液态发酵测定其降解率分别是27.66%、21.53%、23.01%,最终确定菌株FB1分泌纤维素酶效果最好、降解效果最佳,经鉴定后确认为假枝孢菌(Cladosporium pseudocladosporioides)。     

应用Illumina Miseq测序分析饮用水源水中病毒多样性

以东太湖水源水为研究对象,应用梯度-串联-循环-切向流超滤技术对水体中病毒进行分离浓缩,使用非序列依赖性单引物扩增技术扩增源水中病毒基因组,采用Illumina Miseq进行测序,与NCBI基因数据库进行比对,质控后获得1?190?914?928?bp基因数据,可组装成5?554?条scaffolds序列,获知病毒基因组功能,经比对可注释到尾噬菌体目（Caudovirales）、疱疹病毒目（Herpesvirales）、线状病毒目（Ligamenvirales）,在科的水平上,注释到40?个科病毒的同源序列,其中含量较高的病毒科为Microviridae占27.590?1%,Siphoviridae占23.010?7%,Phycodnaviridae占5.322?2%,Retroviridae占1.691?2%,Mimiviridae占1.960?8%,其中无法注释（norank）占21.572?8%,102?112?条reads在科水平上norank,研究可以高通量的获得水源水中病毒多样性信息,并为水体中病毒的检测提供理论参考依据。