计算机模拟纳豆源多肽与DPP-IV和SARS-CoV-2 Mpro的相互作用

兼具糖尿病的新型冠状病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019,COVID-19）患者病死率明显偏高,抑制Ⅱ型糖尿病关键酶二肽基肽酶4（DPP-IV）和新冠肺炎病毒主蛋白酶（SARS-CoV-2 Mpro）的活性能缓解相应的病症。该研究采用UniProt、NCBI和PDB数据库检索纳豆蛋白,基于BIOPBP-UWM数据库开展计算机模拟胃肠道蛋白酶（胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶）水解纳豆蛋白的研究,最后利用分子对接技术分别研究纳豆蛋白源多肽与DPP-IV和SARS-CoV-2 Mpro的结合能力,分析参与相互作用的氨基酸残基与分子作用力类型。结果发现,糖转运蛋白与两种酶具有良好的结合效果。特别地,序列为ISQPR、TIPVR和STVTR的多肽对两种酶都具有较高的结合分数（≤-130）,被鉴定为DPP-IV和SARS-CoV-2 Mpro的双重抑制肽。因此,纳豆蛋白具有缓解Ⅱ型糖尿病病症和作为新型冠状病毒感染病人营养补充剂的潜力。