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目的 建立一种基于基于Illumina测序平台的高效稳定的痕量样本高通量文库构建方法。通过调整建库过程中的Adapter加入量、片段选择的执行与否、文库扩增循环数等条件来为痕量样本的建库提供依据。 高效稳定的痕量样本高通量文库构建方法。方法 本研究采用不同类型的样本,设计了不同起始DNA量 (最低至0.1 ng) 的文库构建策略,主要对接头使用量、扩增循环数等进行优化,并通过数据分析评估文库质量。结果 本研究通过优化文库构建流程,对于起始量低至0.1 ng的DNA样本,基因组文库构建成功率达100%。对于基因组较小的细菌,0.1 ng的起始DNA量的数据组装效果与100 ng起始DNA量相近;对于基因组较大、结构复杂的细菌,0.1 ng的起始DNA量的数据组装效果显著差于100 ng起始DNA量,但可通过增加测序数据量的方法提高组装效果。对于元基因组测序,起始DNA量为1 ng时,制备的测序文库与常规起始DNA量制备的文库得到的微生物群落结构相近,无明显差异。结论 本研究建立的0.1 ng起始DNA量文库构建方法稳定,可用于更多微生物基因组测序、元基因组测序的应用领域 相似文献
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