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在生物信息学中,数据库序列比对是极为常用的操作,Smith-Waterman算法是最流行的序列比对算法,精确度高,但是计算复杂度高,在进行大量的序列比对非常耗时。另外,生物技术的发展使得已知的序列数据库变得越来越庞大,这导致进行数据库序列比对所消耗的时间也越来越长,因而有必要加速数据库序列比对算法。NVIDIA提出了CUDA编程架构,相比之前的GPGPU具有更好的可编程性,用户可以更轻松地发掘出GPU强大的计算能力。在CUDA平台上实现了Smith-Waterman的数据库序列比对算法的并行加速,速度优于已有的基于GPU的实现,超过了基于启发式算法的BLAST算法执行速度。 相似文献
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简要介绍了通信系统的结构和量化、调制的概念,针对模拟信号源,首先阐述了模拟信号数字化量化原则的选择和调制方式的选择对提高通信质量的重要性,利用Matlab仿真工具重点研究了量化方式的选取原则和调制方式的抗噪性能的比较。 相似文献
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