关于油田跨区域承包会战体制单位探亲文化的探讨

结合会战单位实际,抓住每年职工家属探亲的有利时机,坚持以人为本,打造探亲文化,凝聚职工队伍,把探亲文化与思想政治工作有机结合,对于促进油区和谐稳定具有很强的作用.     

RE-OEM：一种半结构化生物数据的信息抽取模型*

在分析半结构化生物数据特点的基础上,提出了一种新的半结构化数据抽取模型REOEM。它将OEM数据模型和正则表达式有机地结合起来,不但能够灵活方便地表示各种数据结构,而且能够非常方便地进行模式匹配和数据的定位,为半结构化生物数据的抽取打下坚实基础。     

基于Java的基因本体工具包

针对基因本体的需求,利用Java技术,以模块化设计的方式实现了基因本体工具包GO4J.该系统包括4个模块.解析器模块把GO载入到内存中;图数据结构模块记录了所有的GO条目之间的关系;语义相似性模块评估两个GO条目之间的相似程度;可视化模块直观展示GO条目和根节点之间的路径.GO4J把这4个模块整合到本体浏览器中,可以结合GO注释的生物数据来对具体的生物数据进行分析.     

基于MVC架构的基因组序列信息可视化工具

探讨了一种基于Model-View-Controller架构开发基因组序列可视化工具的方法。按照模型、视图、控制器的设计思想划分软件架构,在Java平台上开发了具有良好可操作性、可重用性以及可扩展性的基因组序列信息可视化工具。     

树好领导班子形象 切实加强作风建设

加强作风建设 ,树好领导班子形象非常关键。领导班子只有树好求真务实、廉洁自律、团结协作、开拓创新的整体形象 ,才能赢得职工群众的信赖     

上海生命科学数据中心的设计与实现

上海生命科学数据中心通过整合实验数据、分析工具、相关文献,为研究人员提供一个具有中国特色、地方特点,以知识为导向、技术前瞻的生命科学数据共享、服务支撑平台。平台针对生命科学数据自身的特点,运用最新技术手段,在海量数据的管理、异构数据的整合、分布式数据访问,以及数据安全性管理方面进行了积极、有益的探索。目前,平台一期工作已经完成,并开始对外提供服务（http：／／lifecenter．sgst．cn／）。     

基于Web的代谢网络仿真环境

针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境,结合已有的代谢网络仿真技术,提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。     

基于语义网技术的基因和基因产物搜索工具

GORouter运用多种语义网技术和工具构建了一个以基因本体为中心的基因和基因产物相关信息知识库,为生命科学研究人员提供跨物种、跨领域的语义搜索服务.GORouter核心数据集中共集成了27个语义描述框架(RDF)模块,由约7.2百万个三元组组成,涵盖了18个生物学数据库所提供的基因和基因产物注释信患,并通过引入3个相关本体丰富了不同来源数据间的语义联系.     

基于工作流与Web Portal的分布式软件框架研究

基于表示、业务逻辑和数据的三层软件体系结构已成为大规模分布式软件系统的基本模式。针对其结构灵活、可维护、易扩展的进一步需求,探讨了采用Web Portal实现表示层,采用工作流实现逻辑层的技术思路;在此基础上,为三层软件体系结构设计了一种通用、灵活的软件框架;最后,给出了作者实现的框架原型和用例。     

基于集群的代谢网络计算平台研究

在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟Web计算平台.该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理.通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性.