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卢国祥 《计算机工程与应用》2011,47(23):54-56
蛋白质的结构分析对研究蛋白质的功能以及进化关系十分重要,而Alignment空间理论作为数学中一个崭新的方向,可以在蛋白质结构分析中发挥显著的作用。简要介绍了Alignment空间理论,采用基于蛋白质主链的二面角序列代表蛋白质的结构,利用Alignment空间理论,通过相应的动态规划算法得到了一种可以度量蛋白质结构相似程度的指标ρ。最后经由蛋白质序列的实例计算证明该指标的有效性。 相似文献
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Alignment空间是一种由广义差错产生的度量空间,其中的序列结构分析在应用领域中起到了越来越重要的作用.本文主要对Alignment空间F2*中Alignment距离为2的序列结构进行了研究,提出Alignment距离分布的概念,得到了长度为n并且Alignment距离为2的序列对数目的解析表达式. 相似文献
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Alignment空间是一种由度量空间产生的度量空间,其中的度量函数称为Alignment距离.本文首先利用扩张结构的方法直接证明了Alignment距离是度量空间中的度量函数.接下来讨论了Alignment空间中逆序列和子序列的Alignment距离之间的关系,给出了关于Alignment距离的一系列不等式. 相似文献
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为了更好地度量不同序列之间的差异,本文在给定度量空间上的符号距离满足特定条件的前提下,以Alignment距离为基础,提出了一种归一化Alignment距离.接下来利用Alignment相关度证明了该距离满足度量定义的三个条件,并且取值在[0,1]区间上.最后对其进行了进一步讨论,从理论上说明该定义的合理性.该距离可以在序列比对、聚类分析以及模式识别等领域中发挥重要作用. 相似文献
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