代谢网络可视化系统的力导向布局算法设计

针对生物化学代谢反应网络可视化系统的优化设计,提出了一个基于力导向模型的解决方案。新方案根据具体的可视化目标,综合拓扑信息进行参数调整。实验表明,这些调整给可视化的布局质量带来很大的改善。另外,代谢网络具有鲜明的无尺度网络特性。据此,进一步提出了针对枢纽结点的优化方案,在视觉效果上突出了代谢反应网络的无尺度特性。为了融合力导向方案和基于无尺度网络特性的局部调整方案,最后总结了一个三阶段的布局算法框架。