结合位点进化距离与支持向量机的蛋白质分类方法

生物信息学的一个关键的研究课题是理解细胞的分子机制,这依赖于对基因所决定的每一条蛋白质的含义或者功能的理解.一般通过与一条或多条功能已知的蛋白质的相似性比较来推测未知蛋白质的功能,其中,基于支持向量机的一些算法取得了很好的成果.SVM-pairwise算法是当前最好的基于支持向量机的算法中的一个,该方法利用两条序列的相似性来将蛋白质序列转化为固定长度的向量.文中提出了一种新的利用支持向量机算法对蛋白质序列进行分类的方法,这种方法使用位点进化距离代替两条序列的比对得分,该方法比SVM-pairwise有着显著的改善,在蛋白质结构分类数据库(SCOP)上进行的实验表明,该方法具有比SVM-pairwise更好的分类性能.     

基于HPM模型的CoSMPs系统的算法并行与优化

首先，基于并行计算模型HPM，分析了多机机群系统的体系结构特点，从并行性和局部性(存储与通信特性)两方面分析影响并行应用软件性能的主要因素，讨论应用软件并行与优化的相关问题；分析了纯MPI和MPI SMP(或OMP)制导两种编程模式在性能上的优点与不足。然后，讨论了在GoSMFs系统上对并行应用软件进行优化的方法。最后，对两种不同的通信模式(循环交换、边界交换)在CoSMPs；系统上的性能进行讨论，并在多机机群系统的实例——DW3000超级服务器上进行优化；通过计算实例——矩阵乘法和解偏微分方程的五点格式算法加以验证，实算结果和理论分析一致。     

基于HPM模型的Smith-Waterman算法并行优化

用于生物序列联配的Smith Waterman算法在生物信息学中有着重要的意义,但是,算法需要的空间复杂度和时间复杂度都是 O(mn),极大地限制了算法的应用。该文从并行计算模型HPM出发,从通信、存储两方面对Smith Waterman算法进行分析,提出了针对CoSMPs系统的分层的分块行流水并行算法,并通过计算不同规模的长序列进行验证,实验结果与理论分析一致。     

20Mn2A起重链条异常断裂原因分析

起重链条是提升重物不可缺少的起重索具,它对材料性能有特殊要求。要求热轧盘条在加工编链冷变形时具有较高的塑性、可焊性和淬透性,以满足链条加工成型和热处理后机械性能的要求。合金结构钢20Mn2A线材在冷变形过程中具有较高的塑性,与相应含碳量的碳钢相比,具有较高的淬透性,适用于起重链条材料。本文研究了几种断裂强度不足的起重链条的失效现象,从原材料质量和加工工艺上找出了问题的原因,结合链条破断部位化学成分、金相组织、断口形貌等检测分析结果,指出预处理不当造成表面脱碳、原料成分变化及机械损伤等是引起链条机械性能降低的主要原因,并相应地制定了改进措施。     

Q235B焊管横裂缺陷分析

通过检验和对比分析Q235B焊管的化学成分、力学性能和显微组织,找到了导致Q235B焊管横裂缺陷的原因。在原料钢带生产过程中,转炉出钢过程中出现下渣或散流、带钢终轧温度高、层流冷却效果差,造成磷、氮含量高和晶粒粗大,导致原料带钢脆性大是主要原因。对出钢口进行及时维护、合理设定控轧控冷工艺可以杜绝该质量问题的发生。     

SWRH82B热轧盘条拉拔笔尖状断口分析

针对φ12.5 mm SWRH82B热轧盘条拉拔笔尖状断口缺陷,采用扫描电子显微镜和金相显微镜进行了专题研究。结果显示：盘条心部存在网状渗碳体是导致笔尖状断口的主要原因,并提出消除该缺陷的措施与办法。