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通过平均核苷酸一致性分析、基因预测、泛基因组构建、功能注释等流程,以66 株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)的基因组为对象,进行该物种的泛基因组分析。平均核苷酸一致性分析表明,上述菌株可划为具有明显物种边界的两个独立分支;获得的泛基因组共包含13 051 个基因,其中核心基因2 165 个;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)功能注释显示,B.amyloliquefaciens 相比Bacillus 属内其他菌株在分解淀粉、β-葡聚糖和木聚糖上具有较大优势;在促植物生长方面,B.amyloliquefaciens 通过吲哚丙酮酸途径合成吲哚乙酸,并通过碱性磷酸脂酶和植酸酶分解磷元素;抗生素耐药性分析发现,多数菌株含链霉素以及大环内酯类抗生素抗性基因。此外,在所有基因组中均发现杆菌烯和杆菌肽等次级代谢产物基因簇。上述研究进一步明确B.amyloliquefaciens 基因组水平的分类学特点、核心基础代谢特征,以及菌株在碳水化合物代谢、植物促生、生物防治等方面的优势及潜力,可为开发利用该菌作参考。 相似文献
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分子超光谱成像系统应用于糖网病药物疗效研究 总被引:1,自引:0,他引:1
将成像技术和光谱技术相结合,再配合显微镜技术,研制了基于AOTF(acousto-optic tunable filters)的分子超光谱成像系统.使用该系统采集了正常、糖尿病和EPO(erythropoietin,促红细胞生长素)药物治疗的大鼠视网膜组织切片的分子超光谱图像数据.通过对正常组、糖尿病组、药物治疗组共30例样本的分子超光谱图像数据进行处理,获得了3组样本的单波段图像和伪彩色合成图像,并提取了各组样本外核层的典型透射光谱曲线.从图像上分析各组ONL(outer nuclear layer,外核层)的厚度,由大到小依次为正常组、治疗组、糖尿病组,由于糖尿病会引起视网膜外核层细胞凋亡和厚度减少,实验结果表明经EPO治疗后可增加视网膜外核层的厚度.从光谱上分析各组的透射强度,糖尿病大鼠视网膜外核层组织在550~1000 nm光谱范围内的透射强度整体高于正常组,经EPO治疗后,透射强度介于正常组和糖尿病组之间;通过光谱相似性分析,治疗组与正常组之间的光谱相似性高于糖尿病与正常组.实验结果表明EPO能减少视网膜外核层细胞凋亡,对糖网病大鼠有一定的疗效.因而分子超光谱成像系统可以作为一种新的手段,辅助科研人员对糖网病的发病机理和致盲原因及药物疗效进行研究. 相似文献
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该研究针对一株海洋放线菌HM-01 进行形态学及16S rDNA 分析,并对该菌株的发酵液提取物进行抑菌特性研究,采用antiSMASH 对该菌株亲缘性较高的基因组序列进行次级代谢产物基因簇预测,并结合液相色谱-质谱分析,鉴定主要抑菌活性物质。结果表明,该菌株被鉴定为拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)。Nocardiopsis sp.HM-01 发酵液提取物对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、鳗弧菌、阴沟肠杆菌、铜绿假单胞菌等均有明显抑制活性,且以RP 培养基在发酵第9 天时效果最明显。鉴定出主要的抑菌活性物质为desferrioxamine E 和icosalide B。 相似文献
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对2019年上海市市场监管局对外发布的食用农产品监督抽检相关信息进行汇总分析。数据显示2019年度上海市市场监督管理局共完成省级食用农产品抽检任务6 039批次,合格率为99.2%,其中水果和畜禽肉及副产品的合格率高于总体水平。食用农产品整体安全质量状况较好。抽检中发现的主要问题为农兽药的违规使用和重金属污染,未来仍需进一步加强对食用农产品相关企业的监管力度。 相似文献
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科学的评标方法影响着装配式建筑市场的正常秩序和投资收益,为使评标决策更加合理,构建了基于标准离差-G1赋权和Z-Number-TOPSIS法的装配式建筑项目评标决策模型.研究从装配式建筑项目的特征和招标评标中的现存问题出发建立了适用于装配式建筑项目的评标指标体系;并通过标准离差和G1法的有机结合进行组合赋权,减轻了主、... 相似文献
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针对当前突发事件应急救援体系存在的救援不及时、预案不完备等问题,本文利用计算机开发工具设计了一款突发事件快速应急救援系统,主体架构由基础层、数据层、应用层组成,系统集情报搜集、分析决策、动态反馈三大主要功能于一体。利用基础情报搜集设施进行大范围的数据采集,通过情报搜集,筛选出有价值的信息,系统自动进行分析决策,预案自动生成模块中内置各类突发事件分类、突发事件危害分级标准,并根据突发事件和应急预案实例建立相关的模版数据库。系统根据突发事件的实时进展进行应急预案的相应更新,完成动态反馈,进而为快速、高效的应急救援工作提供参考方案和决策支持。 相似文献
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建立超高效液相色谱-串联质谱法测定猪油中磺胺类药物残留的方法。试样经正己烷溶解,加入80%乙腈水溶液提取,经PRIME HLB小柱净化后,供超高效液相色谱-串联质谱检测。用甲醇-0.1%甲酸+2 mol/L甲酸铵水溶液为流动相,经质谱多反应监测(MRM)模式检测。结果显示:18种磺胺类药物均有良好的线性关系,相关系数均大于0.99,检出限为0.5μg/mL,回收率在90.1%~100.0%,RSD在0.17%~5.94%。 相似文献