1种基于信息理论的新分子序列度量法

传统的方法度量序列之间的距离需要序列比对,使一些主观因素破坏数据的原始状态,导致计算结果因人而异。本文拟介绍一些基于信息理论的度量法,提出1种类似的新度量法,建立数学依据。这些度量法度量序列之间的距离不需要序列比对,没有主观因素干涉。同时,选取了20种胎生哺乳动物的线粒体全基因序列,分别使用这些度量法计算出他们的距离,再利用NEIGHBOR法构建系统树。由比较结果看来,新方法用较少时间构建的系统树完全不逊色于以往的方法。这为研究分子序列的差异性提供了1种新方法。