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1.
随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法。文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectation maximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以又由此引出了MEME算法,并对MEME算法的一些基本问题比如时间复杂度、算法性能等进行了详细讨论,对算法的局限性和有待改进的地方作了说明。实践证明,MEME是一个较好的模体识别算法,它能够识别出蛋白质或者DNA序列中单个或多个模体,具有很大的灵活性。  相似文献   
2.
改进的KMP算法在生物序列模式自动识别中的应用   总被引:4,自引:0,他引:4  
戈晓斐  黄竞伟  胡磊 《计算机工程》2004,30(10):140-142
介绍了改进后的KMP算法在生物序列模式自动识别中的应用以及关于生物序列中模式的概念和表示方法,并对生物序列中有关模式匹配的知识作了介绍,阐述了如何将生物序列转换为字符串,以及如何编程实现此算法,成功地对KMP算法作了一些改进,实现了生物序列中模式的自动识别,实验结果表明,该算法具有较好的可行性。  相似文献   
3.
代码统一设计的若干方法及比较   总被引:3,自引:0,他引:3  
通过实例详细讨论了实现代码统一设计的几种方法,并论述了各种方法的优缺点。所介绍的几种方法基本可以实现清晰、流畅、统一的代码设计,有效地减少了程序员的工作量,大大提高了程序的可维护性和可扩充性。  相似文献   
4.
随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法.文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectation maximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以又由此引出了MEME算法,并对MEME算法的一些基本问题比如时间复杂度、算法性能等进行了详细讨论,对算法的局限性和有待改进的地方作了说明.实践证明,MEME是一个较好的模体识别算法,它能够识别出蛋白质或者DNA序列中单个或多个模体,具有很大的灵活性.  相似文献   
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