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根据双孢蘑菇耐热相关基因片段028-1400的cDNA序列设计并合成引物,应用cDNA末端快速扩增(RACE)方法获得该基因的5′端cDNA片段028-11200。以上述两个片段为模板,经PCR扩增获得该基因的全长cDNA序列,并对其进行了克隆、鉴定、测序与分析。该序列全长1.37Kb,在GenBank中未发现明显的同源序列。该基因序列在GenBank上的登录号为DQ235473。 相似文献
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石琰璟 《青岛科技大学学报(自然科学版)》2006,27(1):16-19
阐述了SMART RACE的原理,克隆了草莓贝壳杉烯氧化酶基因(STGA3)5’端未知序列。所得到的STGA3 cDNA的5’末端共有1474bp,其中非编码区共34bp,编码区1440bp,编码氨基酸480个,此序列在NCBI的注册号为:AY462247。它与已克隆到的同源基因拟南芥GA3和南瓜CYPT 01A1之间的同源性分别为56.9%和59.2%。 相似文献
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目的 研究大黄鱼类IV型抗冻蛋白基因编码产物的功能.方法 从大黄鱼肝脏SSH cDNA文库筛选到的类似极地鱼类IV型抗冻蛋白的EST序列出发,用RACE方法克隆IV型抗冻蛋白基凶全长cDNA,RT-PCR分析此基因在大黄鱼不同组织内的表达.构建原核表达载体pGEX-4T-Lycarp并表达蛋白质,亲和层析纯化GST融合蛋白,分析它的体外细菌抗冻保护作用.结果 大黄鱼类IV型抗冻蛋白基因cDNA全长664 bp,包含372 bp开放阅读框,编码124个氨基酸,经Signal P 3.0软件预测其N端前20位氨基酸为信号肽,氨基酸序列与长角杜夫鱼IV型抗冻蛋白同源性高达52%:RT-PCR分析表明其mRNA仅在肝脏表达;重组蛋白在大肠杆菌BL21(DE3)中成功表达,初步纯化后分析体外细菌抗冻保护作用表明,融合蛋白抗冻活性并不明显.结论 大黄鱼类IV型抗冻蛋白不具有显著的抗冻活性,这与大黄鱼不能在低温下生存吻合. 相似文献
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根据已知的人参皂苷糖苷酶(GluGF)的N端氨基酸序列设计简并引物,从Absidia Sp.R84g菌株的总RNA出发,应用RACE技术,快速扩增测序得到cDNA3′末端与cDNA5′末端的未知序列,利用扩增测序所得到的cDNA5′末端和cDNA3′末端的序列设计引物,进行二次RT-PCR扩增并测序得到GluGF基因的... 相似文献
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钙依赖蛋白激酶(CDPK)对Ca2+信号转导通路下游元件的调控具有重要作用。本实验采用同源克隆技术从普通烟草中分离得到1 个CDPK 基因,命名为NtCDPK15(GenBank 登录号为JN662020),cDNA 全长为1963 bp,ORF 大小为1569 bp,编码522 个氨基酸。多序列比对结果表明,NtCDPK15 的编码产物具有典型的CDPK 保守序列,C 末端调控区有4个EF 手性结构。系统进化树分析显示,NtCDPK15 可能来源于绒毛状烟草,预测NtCDPK15 与NtCDPK1这对旁系同源基因在功能上可能非常保守。实时荧光定量PCR 分析结果表明,NtCDPK15 在根和叶中的表达量显著高于茎中的表达量,但经盐胁迫诱导后NtCDPK15 在茎中的表达量显著增加,同时,盐胁迫还使基因在叶中的表达量显著上调,ABA 胁迫可诱导基因在根中的表达,而干旱胁迫可使基因在根和叶中的表达量下调,这些结果说明NtCDPK15 在普通烟草中的表达受盐胁迫及ABA 胁迫诱导,但受干旱胁迫抑制。 相似文献