| 基于GM(2,1)的亚细胞定位预测 |
| |
| 引用本文： | 林卫中,肖绚.基于GM(2,1)的亚细胞定位预测[J].计算机工程,2009,35(8):225-226. |
| |
| 作者姓名： | 林卫中 肖绚 |
| |
| 作者单位： | 1. 景德镇陶瓷学院信息工程学院,景德镇,333403
2. 景德镇陶瓷学院机电系,景德镇,333403 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，江西省自然科学基金，江西省青年科学家(井岗之星)培养计划基金 |
| |
| 摘 要： | 对于蛋白质氨基酸序列，使用GM(2,1)模型的参数作为伪氨基酸成分，加上各氨基酸在序列中所占比例，构成蛋白质的灰色伪氨基酸成分表示。利用扩大协方差算法预测亚细胞定位，开发基于该方法的亚细胞定位预测服务器。在相同的数据集上，对比实验结果显示，该预测服务器在总体预测率上达到77.6%，比其他预测方法优越。相关的研究拓展了灰色理论在生物信息学上的应用。
|
| 关 键 词： | 亚细胞定位 灰色模型GM(2 1) 灰色伪氨基酸成分 亚细胞定位预测服务器 |
| 修稿时间： | |
Subcellular Location Prediction Based on GM(2,1) |
| |
| LIN Wei-zhong,XIAO Xuan.Subcellular Location Prediction Based on GM(2,1)[J].Computer Engineering,2009,35(8):225-226. |
| |
| Authors: | LIN Wei-zhong XIAO Xuan |
| |
| Affiliation: | 1. School of Information Engineering;Jingdezhen Ceramic Institute;Jingdezhen 333403;2. Dept. of Machine and Electron;Jingdezhen 333403 |
| |
| Abstract: | The Grey Pseudo Amino Acid Component(Grey-PseAAC) is the combination of the protein amino acid component and the pseudo amino acid component which is derived from GM(2,1). The server is a predictor of protein subcellular location based on the Grey-PseAAC and the augmented covariant discriminant algorithm. The overall success rate is 77.6% by independent dataset applicationsof test. In contrast with the other predictors in the same dataset, the "Grey PortLoc predictor" is more effectively. The study develops... |
| |
| Keywords: | subcellular location grey model GM(2 1) Grey Pseudo Amino Acid Component(Grey-PseAAC) subcellular location prediction server |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《计算机工程》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《计算机工程》下载全文 |
