| 基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用 |
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| 引用本文： | 张盈盈,李春,杨闫,贾美多.基于多重集逆序数的DNA序列的数值刻画及其应用[J].计算机与应用化学,2014(6). |
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| 作者姓名： | 张盈盈 李春 杨闫 贾美多 |
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| 作者单位： | 渤海大学数理学院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(11171042);辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划(LJQ2011122);辽宁省“百千万人才工程”项目(2012921060) |
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| 摘 要： | 随着人类和其它一些模式生物基因组计划的实施与完成,DNA序列的数量呈指数方式增长,这使得序列分析成为生物信息学的核心问题之一。众所周知,序列之所以称为"序列",自然而然地包含了2个重要因素:元素及其之间的序关系。本文介绍一种全新的考虑元素之间序关系的方法,首先将传统集合上的排列的逆序数推广到多重集上,从而提出带有重复元素的排列的逆序数的概念;在此基础上通过将数字1、2、3、4分别赋值给4个碱基,将DNA原始序列转化为多重集上的数字排列,进而借助逆序数构造出DNA序列的24维向量表示;基于3个数据集的系统发生分析,证实了该方法的有效性。
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| 关 键 词： | 多重集 逆序数 系统发生分析 |
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